BACT000043 (rplN) allele sequence: id-72
Contig position
- sequence bin id
- 3332
- contig length
- 61718
- start
- 36212
- end
- 36580
- length
- 369
- orientation
- reverse
- complete
- yes
- method
- Illumina
Sequence
TCGCTGCTGT TCCAACCCAA GCAGCCGATT GGCTGACGGG ACCAAGACTG ACCGTATGCA TCATGGTGGT GCATCCGGAT TAAGTTGGGA AAGACAAACC ATGATCCAGA CCGAATCTCG GCTCGAAGTA GCCGACAACA CGGGTGCGCG TGAAGTCATG TGCATCAAGG TGCTCGGCGG CTCGAAGCGT CGTTATGCCG GCATTGGCGA CATCATCAAG GTGACCGTCA AAGAAGCAAC GCCGCGCGGG CGCGTGAAGA AAGGCGAAAT CTACAACGCC GTGGTGGTCC GCACCGCCAA GGGTGTTCGC CGTCAAGACG GCTCGCTGAT CAAGTTCGAC GGCAACGCCG CTGTGCTTTT GAATAACAAG CTTGAGCCGA TCGGCACCCG CATTTTCGGG CCGGTGACGC GTGAGCTGCG TAGCGAACGA TTCATGAAGA TCGTTTCGCT GGCGCCGGAA GTGCTGTAAG GAGTCGCGAT GAACAAGATT CGCAAAGGTG ACGAAGTGAT CGTCGTCACT GGCAAGGACA AGGGCAAGCG CGGCGTCGTG CTGGCTGTCG GTGCTGAAC
Translation
S L L F Q P K Q P I G * R D Q D * P Y A S W W C I R I K L G K T N H F1
R C C S N P S S R L A D G T K T D R M H H G G A S G L S W E R Q T F2
A A V P T Q A A D W L T G P R L T V C I M V V H P D * V G K D K P F3
1 TCGCTGCTGTTCCAACCCAAGCAGCCGATTGGCTGACGGGACCAAGACTGACCGTATGCATCATGGTGGTGCATCCGGATTAAGTTGGGAAAGACAAACC 100
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D P D R I S A R S S R Q H G C A * S H V H Q G A R R L E A S L C R F1
M I Q T E S R L E V A D N T G A R E V M C I K V L G G S K R R Y A G F2
* S R P N L G S K * P T T R V R V K S C A S R C S A A R S V V M P F3
101 ATGATCCAGACCGAATCTCGGCTCGAAGTAGCCGACAACACGGGTGCGCGTGAAGTCATGTGCATCAAGGTGCTCGGCGGCTCGAAGCGTCGTTATGCCG 200
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H W R H H Q G D R Q R S N A A R A R E E R R N L Q R R G G P H R Q F1
I G D I I K V T V K E A T P R G R V K K G E I Y N A V V V R T A K F2
A L A T S S R * P S K K Q R R A G A * R K A K S T T P W W S A P P R F3
201 GCATTGGCGACATCATCAAGGTGACCGTCAAAGAAGCAACGCCGCGCGGGCGCGTGAAGAAAGGCGAAATCTACAACGCCGTGGTGGTCCGCACCGCCAA 300
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G C S P S R R L A D Q V R R Q R R C A F E * Q A * A D R H P H F R A F1
G V R R Q D G S L I K F D G N A A V L L N N K L E P I G T R I F G F2
V F A V K T A R * S S S T A T P L C F * I T S L S R S A P A F S G F3
301 GGGTGTTCGCCGTCAAGACGGCTCGCTGATCAAGTTCGACGGCAACGCCGCTGTGCTTTTGAATAACAAGCTTGAGCCGATCGGCACCCGCATTTTCGGG 400
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G D A * A A * R T I H E D R F A G A G S A V R S R D E Q D S Q R * F1
P V T R E L R S E R F M K I V S L A P E V L * G V A M N K I R K G D F2
R * R V S C V A N D S * R S F R W R R K C C K E S R * T R F A K V F3
401 CCGGTGACGCGTGAGCTGCGTAGCGAACGATTCATGAAGATCGTTTCGCTGGCGCCGGAAGTGCTGTAAGGAGTCGCGATGAACAAGATTCGCAAAGGTG 500
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R S D R R H W Q G Q G Q A R R R A G C R C * T F1
E V I V V T G K D K G K R G V V L A V G A E X F2
T K * S S S L A R T R A S A A S C W L S V L N F3
501 ACGAAGTGATCGTCGTCACTGGCAAGGACAAGGGCAAGCGCGGCGTCGTGCTGGCTGTCGGTGCTGAAC 569
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