BACT000042 (rplM) allele sequence: id-72
Contig position
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- 3356
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- 316436
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- end
- 139445
- length
- 429
- orientation
- forward
- complete
- yes
- method
- Illumina
Sequence
GCCCACGGAA AAAGAACAGG GAGAGCCTGC ACCGCGCCTC GAAGCGCACT CAGACAAGCA GGAAGAACAC ATCGGGCAAA GCATTTTTTT TGGATCGATC ATGAAGACGT TTTCCGCAAA AGCCCATGAG GTGACGCGCG AATGGTACGT GATTGACGCG ACGGATAAGG TTCTCGGCCG TGTTGCCAGC GAAGTGGCAC GCCGTCTGCG CGGCAAGCAC AAGCCTGAGT TCACCCCGCA CGTCGACACT GGTGATTTCA TCATCATCAT CAACGCGAGC AAGTTGAAGG TCACGGGCAA CAAGACGCTG GACAAGAAGT ACTACCGTCA CTCGGGCTAC CCGGGCGGCA TCTATGAAAC GACGTTCGGC AAGATGCAGG AACGCTTCCC GGGCCGTGCG CTCGAGAAGG CGGTCAAGGG CATGCTGCCG AAGGGCCCGC TCGGCTACGC GATGATCAAG AAGCTGAAGG TCTACGCAGA AGCGACGCAT CCGCACTCGG CTCAACAGCC GAAGGCGCTC GAGATCTAAG GGGAGCCCAC ATGATCGGTA ACTGGAACTA CGGTACGGGC CGCCGCAAGA GCGCAGTCGC ACGTGTCTTC ATCAAGGCTG GCAAGGGCGA CATCATCGT
Translation
A H G K R T G R A C T A P R S A L R Q A G R T H R A K H F F W I D H F1
P T E K E Q G E P A P R L E A H S D K Q E E H I G Q S I F F G S I F2
P R K K N R E S L H R A S K R T Q T S R K N T S G K A F F L D R S F3
1 GCCCACGGAAAAAGAACAGGGAGAGCCTGCACCGCGCCTCGAAGCGCACTCAGACAAGCAGGAAGAACACATCGGGCAAAGCATTTTTTTTGGATCGATC 100
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E D V F R K S P * G D A R M V R D * R D G * G S R P C C Q R S G T F1
M K T F S A K A H E V T R E W Y V I D A T D K V L G R V A S E V A R F2
* R R F P Q K P M R * R A N G T * L T R R I R F S A V L P A K W H F3
101 ATGAAGACGTTTTCCGCAAAAGCCCATGAGGTGACGCGCGAATGGTACGTGATTGACGCGACGGATAAGGTTCTCGGCCGTGTTGCCAGCGAAGTGGCAC 200
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P S A R Q A Q A * V H P A R R H W * F H H H H Q R E Q V E G H G Q F1
R L R G K H K P E F T P H V D T G D F I I I I N A S K L K V T G N F2
A V C A A S T S L S S P R T S T L V I S S S S S T R A S * R S R A T F3
201 GCCGTCTGCGCGGCAAGCACAAGCCTGAGTTCACCCCGCACGTCGACACTGGTGATTTCATCATCATCATCAACGCGAGCAAGTTGAAGGTCACGGGCAA 300
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Q D A G Q E V L P S L G L P G R H L * N D V R Q D A G T L P G P C A F1
K T L D K K Y Y R H S G Y P G G I Y E T T F G K M Q E R F P G R A F2
R R W T R S T T V T R A T R A A S M K R R S A R C R N A S R A V R F3
301 CAAGACGCTGGACAAGAAGTACTACCGTCACTCGGGCTACCCGGGCGGCATCTATGAAACGACGTTCGGCAAGATGCAGGAACGCTTCCCGGGCCGTGCG 400
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R E G G Q G H A A E G P A R L R D D Q E A E G L R R S D A S A L G F1
L E K A V K G M L P K G P L G Y A M I K K L K V Y A E A T H P H S A F2
S R R R S R A C C R R A R S A T R * S R S * R S T Q K R R I R T R F3
401 CTCGAGAAGGCGGTCAAGGGCATGCTGCCGAAGGGCCCGCTCGGCTACGCGATGATCAAGAAGCTGAAGGTCTACGCAGAAGCGACGCATCCGCACTCGG 500
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S T A E G A R D L R G A H M I G N W N Y G T G R R K S A V A R V F F1
Q Q P K A L E I * G E P T * S V T G T T V R A A A R A Q S H V S S F2
L N S R R R S R S K G S P H D R * L E L R Y G P P Q E R S R T C L H F3
501 CTCAACAGCCGAAGGCGCTCGAGATCTAAGGGGAGCCCACATGATCGGTAACTGGAACTACGGTACGGGCCGCCGCAAGAGCGCAGTCGCACGTGTCTTC 600
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I K A G K G D I I V F1
S R L A R A T S S X F2
Q G W Q G R H H R F3
601 ATCAAGGCTGGCAAGGGCGACATCATCGT 629
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