BACT000040 (rplK) allele sequence: id-72
Contig position
- sequence bin id
- 3332
- contig length
- 61718
- start
- 59932
- end
- 60363
- length
- 432
- orientation
- reverse
- complete
- yes
- method
- Illumina
Sequence
TTACGGCCCG CGTCATGGCC GTTGAGGAGC GTCAGTAGCC AGCGGCGAAC GCGCGTTATC ACTCACCGAA CGCCGCCTGG CGTTCCAACG AGGTTTTCAA ATGGCAAAGA AGATTGTCGG CTTTATCAAG CTGCAGATCC CTGCAGGTAA AGCCAACCCG TCGCCGCCGG TCGGTCCGGC ACTGGGCCAG CGCGGCCTGA ACATCATGGA GTTCTGCAAG GCGTTCAACG CGCAGACTCA AGGCATGGAG CCGGGTCTGC CGGTGCCGGT GGTCATCACG GCATTCGCTG ACAAGAGCTT CACGTTCGTG ATGAAGACGC CGCCGGCGAC CGTCCTGATC AAGAAGGCGG CGAAGGTGGA CAAGGGCTCG AGCAAGCCGC ACACGGACAA GGTCGGTTCG ATCACGCGCG CTCAAGCCGA AGAAATCGCG AAGACCAAGA TGCCGGACCT TACGGCAGCT GATCTGGACG CAGCCGTTCG CACCATCGCT GGTAGCGCAC GCTCGATGGG CATCACCGTG GAGGGCGTGT AAATGGCTAA GATCTCCAAG CGCCGTCAGG CATTCGAAGC GAAGGTCGAT CGTCAGAAGC TGTACGCGAT CGAAGACGCA CTGGCACTCG TGAAGGAATG CG
Translation
L R P A S W P L R S V S S Q R R T R V I T H R T P P G V P T R F S N F1
Y G P R H G R * G A S V A S G E R A L S L T E R R L A F Q R G F Q F2
T A R V M A V E E R Q * P A A N A R Y H S P N A A W R S N E V F K F3
1 TTACGGCCCGCGTCATGGCCGTTGAGGAGCGTCAGTAGCCAGCGGCGAACGCGCGTTATCACTCACCGAACGCCGCCTGGCGTTCCAACGAGGTTTTCAA 100
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G K E D C R L Y Q A A D P C R * S Q P V A A G R S G T G P A R P E F1
M A K K I V G F I K L Q I P A G K A N P S P P V G P A L G Q R G L N F2
W Q R R L S A L S S C R S L Q V K P T R R R R S V R H W A S A A * F3
101 ATGGCAAAGAAGATTGTCGGCTTTATCAAGCTGCAGATCCCTGCAGGTAAAGCCAACCCGTCGCCGCCGGTCGGTCCGGCACTGGGCCAGCGCGGCCTGA 200
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H H G V L Q G V Q R A D S R H G A G S A G A G G H H G I R * Q E L F1
I M E F C K A F N A Q T Q G M E P G L P V P V V I T A F A D K S F F2
T S W S S A R R S T R R L K A W S R V C R C R W S S R H S L T R A S F3
201 ACATCATGGAGTTCTGCAAGGCGTTCAACGCGCAGACTCAAGGCATGGAGCCGGGTCTGCCGGTGCCGGTGGTCATCACGGCATTCGCTGACAAGAGCTT 300
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H V R D E D A A G D R P D Q E G G E G G Q G L E Q A A H G Q G R F D F1
T F V M K T P P A T V L I K K A A K V D K G S S K P H T D K V G S F2
R S * * R R R R R P S * S R R R R R W T R A R A S R T R T R S V R F3
301 CACGTTCGTGATGAAGACGCCGCCGGCGACCGTCCTGATCAAGAAGGCGGCGAAGGTGGACAAGGGCTCGAGCAAGCCGCACACGGACAAGGTCGGTTCG 400
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H A R S S R R N R E D Q D A G P Y G S * S G R S R S H H R W * R T F1
I T R A Q A E E I A K T K M P D L T A A D L D A A V R T I A G S A R F2
S R A L K P K K S R R P R C R T L R Q L I W T Q P F A P S L V A H F3
401 ATCACGCGCGCTCAAGCCGAAGAAATCGCGAAGACCAAGATGCCGGACCTTACGGCAGCTGATCTGGACGCAGCCGTTCGCACCATCGCTGGTAGCGCAC 500
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L D G H H R G G R V N G * D L Q A P S G I R S E G R S S E A V R D F1
S M G I T V E G V * M A K I S K R R Q A F E A K V D R Q K L Y A I F2
A R W A S P W R A C K W L R S P S A V R H S K R R S I V R S C T R S F3
501 GCTCGATGGGCATCACCGTGGAGGGCGTGTAAATGGCTAAGATCTCCAAGCGCCGTCAGGCATTCGAAGCGAAGGTCGATCGTCAGAAGCTGTACGCGAT 600
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R R R T G T R E G M R F1
E D A L A L V K E C X F2
K T H W H S * R N A F3
601 CGAAGACGCACTGGCACTCGTGAAGGAATGCG 632
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