BACT000039 (rplJ) allele sequence: id-72
Contig position
- sequence bin id
- 3332
- contig length
- 61718
- start
- 58431
- end
- 58928
- length
- 498
- orientation
- reverse
- complete
- yes
- method
- Illumina
Sequence
GAGGTGGAAA TACTCCTAAC GAGGTCGGAC GCCGTTGTTG AACGAGGTAC GTGAGGTAGC CCTGTCGGCA AGCCGAACGT ATCGTTTCTG GAGGCTAACC GTGCCGCTTA ATAGAGAAGA CAAGCAAGCC GTCGTCGCTG AGGTTGCCGC GCAAGTCGCG AAGGCCCAGA CCGTTGTGCT GGCTGAGTAT CGTGGAATTG CGGTTGGCGA TCTGACCAAG CTGCGCGCGA AAGCGCGTGA GCAACAGGTT TACCTGCGCG TGTTGAAGAA CACGCTGGCG CGTCGCGCCG TCGAAGGTAC GCCGTTTGCT CCGCTGGCAG AGCAGATGAC TGGTCCCCTG ATCTACGGCA TCTCGGAAGA TGCCATTGCT GCTGCTAAGG TCGTCAACGA CTTCAGCAAG GGCAATGAAA AGTTGGTCAT CAAGGCTGGT TCGTTCGATG GCAAGGTGAT GGACAAGGCT GGCGTGCAAG CGCTGGCAAG CATCCCGAGC CGCGAAGAAC TGCTCTCGAA GCTGCTGTTC GTTATGCAAT CGCCTGTTTC GGGCTTCGCG CGCGCTCTCG CCGCGCTGGC TGAGAAGAAG CAAGCGGAAG CTGCGTAAGC GAACGTGCAT CAGCGTCATT GATCGCTGGC TGTATCCGAA TTCAATTTAG GAGTATTTCA AATGGCAATC GCAAAAGAAG ACATCCTGGC AGCAGTCG
Translation
E V E I L L T R S D A V V E R G T * G S P V G K P N V S F L E A N R F1
R W K Y S * R G R T P L L N E V R E V A L S A S R T Y R F W R L T F2
G G N T P N E V G R R C * T R Y V R * P C R Q A E R I V S G G * P F3
1 GAGGTGGAAATACTCCTAACGAGGTCGGACGCCGTTGTTGAACGAGGTACGTGAGGTAGCCCTGTCGGCAAGCCGAACGTATCGTTTCTGGAGGCTAACC 100
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A A * * R R Q A S R R R * G C R A S R E G P D R C A G * V S W N C F1
V P L N R E D K Q A V V A E V A A Q V A K A Q T V V L A E Y R G I A F2
C R L I E K T S K P S S L R L P R K S R R P R P L C W L S I V E L F3
101 GTGCCGCTTAATAGAGAAGACAAGCAAGCCGTCGTCGCTGAGGTTGCCGCGCAAGTCGCGAAGGCCCAGACCGTTGTGCTGGCTGAGTATCGTGGAATTG 200
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G W R S D Q A A R E S A * A T G L P A R V E E H A G A S R R R R Y F1
V G D L T K L R A K A R E Q Q V Y L R V L K N T L A R R A V E G T F2
R L A I * P S C A R K R V S N R F T C A C * R T R W R V A P S K V R F3
201 CGGTTGGCGATCTGACCAAGCTGCGCGCGAAAGCGCGTGAGCAACAGGTTTACCTGCGCGTGTTGAAGAACACGCTGGCGCGTCGCGCCGTCGAAGGTAC 300
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A V C S A G R A D D W S P D L R H L G R C H C C C * G R Q R L Q Q G F1
P F A P L A E Q M T G P L I Y G I S E D A I A A A K V V N D F S K F2
R L L R W Q S R * L V P * S T A S R K M P L L L L R S S T T S A R F3
301 GCCGTTTGCTCCGCTGGCAGAGCAGATGACTGGTCCCCTGATCTACGGCATCTCGGAAGATGCCATTGCTGCTGCTAAGGTCGTCAACGACTTCAGCAAG 400
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Q * K V G H Q G W F V R W Q G D G Q G W R A S A G K H P E P R R T F1
G N E K L V I K A G S F D G K V M D K A G V Q A L A S I P S R E E L F2
A M K S W S S R L V R S M A R * W T R L A C K R W Q A S R A A K N F3
401 GGCAATGAAAAGTTGGTCATCAAGGCTGGTTCGTTCGATGGCAAGGTGATGGACAAGGCTGGCGTGCAAGCGCTGGCAAGCATCCCGAGCCGCGAAGAAC 500
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A L E A A V R Y A I A C F G L R A R S R R A G * E E A S G S C V S F1
L S K L L F V M Q S P V S G F A R A L A A L A E K K Q A E A A * A F2
C S R S C C S L C N R L F R A S R A L S P R W L R R S K R K L R K R F3
501 TGCTCTCGAAGCTGCTGTTCGTTATGCAATCGCCTGTTTCGGGCTTCGCGCGCGCTCTCGCCGCGCTGGCTGAGAAGAAGCAAGCGGAAGCTGCGTAAGC 600
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E R A S A S L I A G C I R I Q F R S I S N G N R K R R H P G S S R F1
N V H Q R H * S L A V S E F N L G V F Q M A I A K E D I L A A V X F2
T C I S V I D R W L Y P N S I * E Y F K W Q S Q K K T S W Q Q S F3
601 GAACGTGCATCAGCGTCATTGATCGCTGGCTGTATCCGAATTCAATTTAGGAGTATTTCAAATGGCAATCGCAAAAGAAGACATCCTGGCAGCAGTCG 698
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