BACT000038 (rplI) allele sequence: id-72
Contig position
- sequence bin id
- 3376
- contig length
- 227887
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- 153120
- end
- 153572
- length
- 453
- orientation
- reverse
- complete
- yes
- method
- Illumina
Sequence
TCAGCTGGAT ACGGCAATCA AGCGTGCGCG TTTCCTCGCG CTGCTGCCGT ACACCGATCA GCACAAGGCG TAATCAGGCG ACGCAATAAG GAGAATTCGA ATGCAAATCA TTCTGTTGGA AAAAGTCGCC AATCTGGGCA ACCTCGGCGA TATCGTCAAG GTCAAGGACG GTTACGCTCG CAACTTCCTG ATCCCGAACC GCAAGGCTCG CCGTGCAACG AAGGAAGCGA TCGCCGAATT CGAAGTTCGC CGCGCCGAAC TCGAAAAGAT CGCCGCTGAA AAGCTGGCGG CATCGCAGGC AGTCGGCGAG AAGCTGAACG GCCAAGCGTT CGAAGTCACG CAGAAGTCGG GCGTCGACGG CCGTCTGTTC GGCTCGGTCA CGAACGGCGA CGTCGCGGAA CTGCTGAAGA AGGCAGGTTT CGAAGTCGAG AAGCTGCAAG TTCGCATGCC GGAAGGCCCG CTGAAGATGA TCGGCGAGCA CGTCGTTCAA GTCGCGCTGC ATACGGACGT CGTCGTCGAC GTCACGATCA ACGTGATCGG CGACCACGCA TAAGCGTACG CAAGCTTGCC GGGCGGCTTC CGCCGTCCGG ACAAGGGCAG GCGCCCGGGC AACCGGGGCC TGCCTTTTTT TTGCCGATTG CCGGCAACCC GTA
Translation
S A G Y G N Q A C A F P R A A A V H R S A Q G V I R R R N K E N S N F1
Q L D T A I K R A R F L A L L P Y T D Q H K A * S G D A I R R I R F2
S W I R Q S S V R V S S R C C R T P I S T R R N Q A T Q * G E F E F3
1 TCAGCTGGATACGGCAATCAAGCGTGCGCGTTTCCTCGCGCTGCTGCCGTACACCGATCAGCACAAGGCGTAATCAGGCGACGCAATAAGGAGAATTCGA 100
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A N H S V G K S R Q S G Q P R R Y R Q G Q G R L R S Q L P D P E P F1
M Q I I L L E K V A N L G N L G D I V K V K D G Y A R N F L I P N R F2
C K S F C W K K S P I W A T S A I S S R S R T V T L A T S * S R T F3
101 ATGCAAATCATTCTGTTGGAAAAAGTCGCCAATCTGGGCAACCTCGGCGATATCGTCAAGGTCAAGGACGGTTACGCTCGCAACTTCCTGATCCCGAACC 200
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Q G S P C N E G S D R R I R S S P R R T R K D R R * K A G G I A G F1
K A R R A T K E A I A E F E V R R A E L E K I A A E K L A A S Q A F2
A R L A V Q R R K R S P N S K F A A P N S K R S P L K S W R H R R Q F3
201 GCAAGGCTCGCCGTGCAACGAAGGAAGCGATCGCCGAATTCGAAGTTCGCCGCGCCGAACTCGAAAAGATCGCCGCTGAAAAGCTGGCGGCATCGCAGGC 300
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S R R E A E R P S V R S H A E V G R R R P S V R L G H E R R R R G T F1
V G E K L N G Q A F E V T Q K S G V D G R L F G S V T N G D V A E F2
S A R S * T A K R S K S R R S R A S T A V C S A R S R T A T S R N F3
301 AGTCGGCGAGAAGCTGAACGGCCAAGCGTTCGAAGTCACGCAGAAGTCGGGCGTCGACGGCCGTCTGTTCGGCTCGGTCACGAACGGCGACGTCGCGGAA 400
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A E E G R F R S R E A A S S H A G R P A E D D R R A R R S S R A A F1
L L K K A G F E V E K L Q V R M P E G P L K M I G E H V V Q V A L H F2
C * R R Q V S K S R S C K F A C R K A R * R * S A S T S F K S R C F3
401 CTGCTGAAGAAGGCAGGTTTCGAAGTCGAGAAGCTGCAAGTTCGCATGCCGGAAGGCCCGCTGAAGATGATCGGCGAGCACGTCGTTCAAGTCGCGCTGC 500
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Y G R R R R R H D Q R D R R P R I S V R K L A G R L P P S G Q G Q F1
T D V V V D V T I N V I G D H A * A Y A S L P G G F R R P D K G R F2
I R T S S S T S R S T * S A T T H K R T Q A C R A A S A V R T R A G F3
501 ATACGGACGTCGTCGTCGACGTCACGATCAACGTGATCGGCGACCACGCATAAGCGTACGCAAGCTTGCCGGGCGGCTTCCGCCGTCCGGACAAGGGCAG 600
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A P G Q P G P A F F L P I A G N P X F1
R P G N R G L P F F C R L P A T R X F2
A R A T G A C L F F A D C R Q P V F3
601 GCGCCCGGGCAACCGGGGCCTGCCTTTTTTTTGCCGATTGCCGGCAACCCGTA 653
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