BACT000036 (rplL) allele sequence: id-72
Contig position
- sequence bin id
- 3332
- contig length
- 61718
- start
- 57996
- end
- 58367
- length
- 372
- orientation
- reverse
- complete
- yes
- method
- Illumina
Sequence
CGCGCTGGCT GAGAAGAAGC AAGCGGAAGC TGCGTAAGCG AACGTGCATC AGCGTCATTG ATCGCTGGCT GTATCCGAAT TCAATTTAGG AGTATTTCAA ATGGCAATCG CAAAAGAAGA CATCCTGGCA GCAGTCGAAG GGATGACCGT TCTGGAACTG AACGAACTGG TCAAGGCATT CGAAGAGAAG TTTGGCGTGT CGGCAGCTGC AGTGGCAGTC GCTGGCCCGG CAGGCGGCGC AGCCGCTGCT GTGGAAGAGA AGACCGAATT CACGGTCGTC CTGACTGAAG CAGGCAGCAA CAAGGTTGCA GTCATCAAGG CAGTTCGCGA ACTGACGGGC CTGGGCCTGA AGGAAGCGAA GGACGTCGTT GACGGCGCAC CGAAGGCTGT CAAGGAAGGC GTCGACAAGG CTGCCGCTGA AGAAGCCAAG AAGAAGCTGG AAGAAGCAGG CGCGAAGGTC GAAGTCAAGT AAGTTTCGAC GCGCTGTGCG AAGGCTGGCG GTATTTTCAC CGCCGGCCTT TTTGTGCTTT GTGGGGACGT TATTCTGGCA CTCTTTCGGG AGCCCGAATG AT
Translation
R A G * E E A S G S C V S E R A S A S L I A G C I R I Q F R S I S N F1
A L A E K K Q A E A A * A N V H Q R H * S L A V S E F N L G V F Q F2
R W L R R S K R K L R K R T C I S V I D R W L Y P N S I * E Y F K F3
1 CGCGCTGGCTGAGAAGAAGCAAGCGGAAGCTGCGTAAGCGAACGTGCATCAGCGTCATTGATCGCTGGCTGTATCCGAATTCAATTTAGGAGTATTTCAA 100
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G N R K R R H P G S S R R D D R S G T E R T G Q G I R R E V W R V F1
M A I A K E D I L A A V E G M T V L E L N E L V K A F E E K F G V S F2
W Q S Q K K T S W Q Q S K G * P F W N * T N W S R H S K R S L A C F3
101 ATGGCAATCGCAAAAGAAGACATCCTGGCAGCAGTCGAAGGGATGACCGTTCTGGAACTGAACGAACTGGTCAAGGCATTCGAAGAGAAGTTTGGCGTGT 200
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G S C S G S R W P G R R R S R C C G R E D R I H G R P D * S R Q Q F1
A A A V A V A G P A G G A A A A V E E K T E F T V V L T E A G S N F2
R Q L Q W Q S L A R Q A A Q P L L W K R R P N S R S S * L K Q A A T F3
201 CGGCAGCTGCAGTGGCAGTCGCTGGCCCGGCAGGCGGCGCAGCCGCTGCTGTGGAAGAGAAGACCGAATTCACGGTCGTCCTGACTGAAGCAGGCAGCAA 300
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Q G C S H Q G S S R T D G P G P E G S E G R R * R R T E G C Q G R R F1
K V A V I K A V R E L T G L G L K E A K D V V D G A P K A V K E G F2
R L Q S S R Q F A N * R A W A * R K R R T S L T A H R R L S R K A F3
301 CAAGGTTGCAGTCATCAAGGCAGTTCGCGAACTGACGGGCCTGGGCCTGAAGGAAGCGAAGGACGTCGTTGACGGCGCACCGAAGGCTGTCAAGGAAGGC 400
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R Q G C R * R S Q E E A G R S R R E G R S Q V S F D A L C E G W R F1
V D K A A A E E A K K K L E E A G A K V E V K * V S T R C A K A G G F2
S T R L P L K K P R R S W K K Q A R R S K S S K F R R A V R R L A F3
401 GTCGACAAGGCTGCCGCTGAAGAAGCCAAGAAGAAGCTGGAAGAAGCAGGCGCGAAGGTCGAAGTCAAGTAAGTTTCGACGCGCTGTGCGAAGGCTGGCG 500
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Y F H R R P F C A L W G R Y S G T L S G A R M X F1
I F T A G L F V L C G D V I L A L F R E P E * X F2
V F S P P A F L C F V G T L F W H S F G S P N D F3
501 GTATTTTCACCGCCGGCCTTTTTGTGCTTTGTGGGGACGTTATTCTGGCACTCTTTCGGGAGCCCGAATGAT 572
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