BACT000035 (rplF) allele sequence: id-72
Contig position
- sequence bin id
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- orientation
- reverse
- complete
- yes
- method
- Illumina
Sequence
TTCGACGCCG AAGGGCGTGA TGACCGACCG CAAGGCGCGC GCTACCGGCG TCGGCGGCGA AGTCATCTGC TACGTCGCTT AAAGCCGAGG AGAGAGAAAC ATGTCTCGAG TAGGTAAGAG CCCGATCGCG CTGCAAGGCG CGGAAGTCAA GCTGGCCGAC GGTGCGATCA CCGTCAAGGG CCCGCTGGGC ACCATCACGC AGCCGGTGAA TCCGCTCGTG AACGTGGCGA ACAACGACGG CACGCTGAAT CTGGCGCCGG TCAACGAAAG CCGCGAAGCA AACGCAATGT CGGGCACGAT GCGCGCGATC ATCGCGAACG CCGTGCACGG CGTGACCAAG GGTTTCGAGC GCAAGCTGAC GCTGGTTGGC GTCGGTTATC GTGCGCAAGC GCAAGGCGAC AAGCTGAACC TGTCGCTGGG TTTCTCGCAC CCGGTGGTGC ACCAGATGCC GGAAGGCGTC AAGGCTGAAA CTCCGACGCA AACCGAAATC GTGATCAAGG GGATCAACAA GCAACAAGTC GGTCAAGTAG CTGCGGAAGT TCGCGGTTAC CGTCCGCCGG AGCCCTACAA GGGCAAGGGC GTGCGCTATT CCGACGAGGT TGTGATCCTC AAAGAAACGA AGAAGAAGTA AGGGTGCGCA ATCATGGATA AGACTCAATC TCGCCTGCGC CGCGCTCGCC AGACGCGTAT CAAGATCGCT GAGCTGCAGG TCGCGCGTCT CGCCGTGCAT C
Translation
F D A E G R D D R P Q G A R Y R R R R R S H L L R R L K P R R E K H F1
S T P K G V M T D R K A R A T G V G G E V I C Y V A * S R G E R N F2
R R R R A * * P T A R R A L P A S A A K S S A T S L K A E E R E T F3
1 TTCGACGCCGAAGGGCGTGATGACCGACCGCAAGGCGCGCGCTACCGGCGTCGGCGGCGAAGTCATCTGCTACGTCGCTTAAAGCCGAGGAGAGAGAAAC 100
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V S S R * E P D R A A R R G S Q A G R R C D H R Q G P A G H H H A F1
M S R V G K S P I A L Q G A E V K L A D G A I T V K G P L G T I T Q F2
C L E * V R A R S R C K A R K S S W P T V R S P S R A R W A P S R F3
101 ATGTCTCGAGTAGGTAAGAGCCCGATCGCGCTGCAAGGCGCGGAAGTCAAGCTGGCCGACGGTGCGATCACCGTCAAGGGCCCGCTGGGCACCATCACGC 200
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A G E S A R E R G E Q R R H A E S G A G Q R K P R S K R N V G H D F1
P V N P L V N V A N N D G T L N L A P V N E S R E A N A M S G T M F2
S R * I R S * T W R T T T A R * I W R R S T K A A K Q T Q C R A R C F3
201 AGCCGGTGAATCCGCTCGTGAACGTGGCGAACAACGACGGCACGCTGAATCTGGCGCCGGTCAACGAAAGCCGCGAAGCAAACGCAATGTCGGGCACGAT 300
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A R D H R E R R A R R D Q G F R A Q A D A G W R R L S C A S A R R Q F1
R A I I A N A V H G V T K G F E R K L T L V G V G Y R A Q A Q G D F2
A R S S R T P C T A * P R V S S A S * R W L A S V I V R K R K A T F3
301 GCGCGCGATCATCGCGAACGCCGTGCACGGCGTGACCAAGGGTTTCGAGCGCAAGCTGACGCTGGTTGGCGTCGGTTATCGTGCGCAAGCGCAAGGCGAC 400
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A E P V A G F L A P G G A P D A G R R Q G * N S D A N R N R D Q G F1
K L N L S L G F S H P V V H Q M P E G V K A E T P T Q T E I V I K G F2
S * T C R W V S R T R W C T R C R K A S R L K L R R K P K S * S R F3
401 AAGCTGAACCTGTCGCTGGGTTTCTCGCACCCGGTGGTGCACCAGATGCCGGAAGGCGTCAAGGCTGAAACTCCGACGCAAACCGAAATCGTGATCAAGG 500
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D Q Q A T S R S S S C G S S R L P S A G A L Q G Q G R A L F R R G F1
I N K Q Q V G Q V A A E V R G Y R P P E P Y K G K G V R Y S D E V F2
G S T S N K S V K * L R K F A V T V R R S P T R A R A C A I P T R L F3
501 GGATCAACAAGCAACAAGTCGGTCAAGTAGCTGCGGAAGTTCGCGGTTACCGTCCGCCGGAGCCCTACAAGGGCAAGGGCGTGCGCTATTCCGACGAGGT 600
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C D P Q R N E E E V R V R N H G * D S I S P A P R S P D A Y Q D R * F1
V I L K E T K K K * G C A I M D K T Q S R L R R A R Q T R I K I A F2
* S S K K R R R S K G A Q S W I R L N L A C A A L A R R V S R S L F3
601 TGTGATCCTCAAAGAAACGAAGAAGAAGTAAGGGTGCGCAATCATGGATAAGACTCAATCTCGCCTGCGCCGCGCTCGCCAGACGCGTATCAAGATCGCT 700
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A A G R A S R R A S F1
E L Q V A R L A V H X F2
S C R S R V S P C I F3
701 GAGCTGCAGGTCGCGCGTCTCGCCGTGCATC 731
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