BACT000034 (rplE) allele sequence: id-72
Contig position
- sequence bin id
- 3332
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- 61718
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- end
- 35877
- length
- 540
- orientation
- reverse
- complete
- yes
- method
- Illumina
Sequence
AAGGCGTCGC GTGTTGGCAT CAAGGTCGAG GAAGGCAAGA AGGTTCGCTT CCTGAAGACG ACCGGTGCCG TACTGAGCGC CTGACGCAGC GGAGTAAAAA ATGGCTCGTT TTCAAGAGTT TTACAAAGAA AAGGTTGTGC CCGGCCTGAT CGAGAAGTTC GGTTACAAGT CGGTCATGGA AGTGCCGCGC ATCACCAAGA TCACGCTGAA CATGGGTCTT GGCGAAGCGA TCGCTGACAA GAAGGTCATC GAGAACGCCG TTGGCGACCT CACGAAGATC GCCGGTCAGA AGCCGGTCGT CACGAAGGCA CGCAAGGCAA TCGCAGGCTT CAAGATCCGC CAGGGCTATC CCATCGGCGC GATGGTGACG CTGCGCGGCC GTGCGATGTA CGAATTCCTC GACCGTTTCG TGACCGTTGC CCTGCCCCGC GTGCGTGACT TCCGCGGCGT GTCGGGTCGT GCCTTCGATG GCCGCGGCAA CTACAACATC GGTGTGAAAG AGCAGATCAT TTTCCCCGAA ATCGACTACG ACAAGATCGA CGCACTGCGT GGGCTGAATA TCAGCATCAC GACGACTGCG AAGACCGACG ACGAAGCAAA GGCTCTGCTC GCCAGCTTCA AGTTCCCGTT CAGAAACTGA GGTTACCGTG GCTAAACTGG CACTGATCGA ACGTGAAAAG AAGCGCGCCC GCCTGGTCGC GAAGTTCGCA GCAAAGCGCG AAGCGCTGAA GGCGATCGTC
Translation
K A S R V G I K V E E G K K V R F L K T T G A V L S A * R S G V K N F1
R R R V L A S R S R K A R R F A S * R R P V P Y * A P D A A E * K F2
G V A C W H Q G R G R Q E G S L P E D D R C R T E R L T Q R S K K F3
1 AAGGCGTCGCGTGTTGGCATCAAGGTCGAGGAAGGCAAGAAGGTTCGCTTCCTGAAGACGACCGGTGCCGTACTGAGCGCCTGACGCAGCGGAGTAAAAA 100
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G S F S R V L Q R K G C A R P D R E V R L Q V G H G S A A H H Q D F1
M A R F Q E F Y K E K V V P G L I E K F G Y K S V M E V P R I T K I F2
W L V F K S F T K K R L C P A * S R S S V T S R S W K C R A S P R F3
101 ATGGCTCGTTTTCAAGAGTTTTACAAAGAAAAGGTTGTGCCCGGCCTGATCGAGAAGTTCGGTTACAAGTCGGTCATGGAAGTGCCGCGCATCACCAAGA 200
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H A E H G S W R S D R * Q E G H R E R R W R P H E D R R S E A G R F1
T L N M G L G E A I A D K K V I E N A V G D L T K I A G Q K P V V F2
S R * T W V L A K R S L T R R S S R T P L A T S R R S P V R S R S S F3
201 TCACGCTGAACATGGGTCTTGGCGAAGCGATCGCTGACAAGAAGGTCATCGAGAACGCCGTTGGCGACCTCACGAAGATCGCCGGTCAGAAGCCGGTCGT 300
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H E G T Q G N R R L Q D P P G L S H R R D G D A A R P C D V R I P R F1
T K A R K A I A G F K I R Q G Y P I G A M V T L R G R A M Y E F L F2
R R H A R Q S Q A S R S A R A I P S A R W * R C A A V R C T N S S F3
301 CACGAAGGCACGCAAGGCAATCGCAGGCTTCAAGATCCGCCAGGGCTATCCCATCGGCGCGATGGTGACGCTGCGCGGCCGTGCGATGTACGAATTCCTC 400
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P F R D R C P A P R A * L P R R V G S C L R W P R Q L Q H R C E R F1
D R F V T V A L P R V R D F R G V S G R A F D G R G N Y N I G V K E F2
T V S * P L P C P A C V T S A A C R V V P S M A A A T T T S V * K F3
401 GACCGTTTCGTGACCGTTGCCCTGCCCCGCGTGCGTGACTTCCGCGGCGTGTCGGGTCGTGCCTTCGATGGCCGCGGCAACTACAACATCGGTGTGAAAG 500
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A D H F P R N R L R Q D R R T A W A E Y Q H H D D C E D R R R S K F1
Q I I F P E I D Y D K I D A L R G L N I S I T T T A K T D D E A K F2
S R S F S P K S T T T R S T H C V G * I S A S R R L R R P T T K Q R F3
501 AGCAGATCATTTTCCCCGAAATCGACTACGACAAGATCGACGCACTGCGTGGGCTGAATATCAGCATCACGACGACTGCGAAGACCGACGACGAAGCAAA 600
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G S A R Q L Q V P V Q K L R L P W L N W H * S N V K R S A P A W S R F1
A L L A S F K F P F R N * G Y R G * T G T D R T * K E A R P P G R F2
L C S P A S S S R S E T E V T V A K L A L I E R E K K R A R L V A F3
601 GGCTCTGCTCGCCAGCTTCAAGTTCCCGTTCAGAAACTGAGGTTACCGTGGCTAAACTGGCACTGATCGAACGTGAAAAGAAGCGCGCCCGCCTGGTCGC 700
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S S Q Q S A K R * R R S S F1
E V R S K A R S A E G D R X F2
K F A A K R E A L K A I V F3
701 GAAGTTCGCAGCAAAGCGCGAAGCGCTGAAGGCGATCGTC 740
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