BACT000033 (rplD) allele sequence: id-72
Contig position
- sequence bin id
- 3332
- contig length
- 61718
- start
- 40363
- end
- 40983
- length
- 621
- orientation
- reverse
- complete
- yes
- method
- Illumina
Sequence
ACGCAGAGCG CAAGCTGCTG CTCGTCAAGG GCGCGATTCC GGGCGCGAAG GGCGGCAAGG TTTTCGTGAC GCCGGCCGTC AAGACCAAGG GGGCGAAATA ATGGAACTCA AGCTCCTGAA CGAAAATGGT CAGGAAGGTG CAGTGGTCAA CGCGTCGGAC GTCGTGTTCG GTCGTGACTA CAACGAAGCG CTGATCCACC AGGTCGTCGT CGCGTACCAG GCGAATGCTC GCCAGGGTAA CCGCGCACAG AAGGACCGTG AGCAAGTCAA GCACACCACC AAGAAGCCGT GGCGTCAGAA GGGTACGGGC CGCGCTCGTG CCGGTATGTC GTCGAGCCCG TTGTGGCGTG GCGGTGGTCG CATCTTCCCG AACTCGCCGG AAGAGAACTT CTCGCACAAG GTCAACAAGA AGATGCATCG CGCAGGTCTC TGCTCGATCT TCTCGCAGCT GGCCCGTGAA GGCCGTCTGT CGGTCGTCGA GGACATCATC CTCGAAGCGC CGAAGACCAA GCTGCTGGCC GACAAATTCA AGACCATGGG TCTCGACTCC GTCCTGATCA TCACGGATAC GGTCGACGAG AACCTGTACC TGGCTTCGCG CAACCTGCCG CACGTGGCGA TTGTCGAGCC GCGCTACGCT GACCCGCTGT CGCTGATCTA CTTCAAGAAA GTGCTGGTCA CGAAGGCTGC GGTCGCCCAG ATCGAGGAGT TGCTGTCATG AGCGAGATTC GCAAGAACGA TCATCGTTTG ATGCAGGTCC TGCTCGCACC GGTGATTTCC GAAAAGGCGA CGCTGGTTGC CGACAAGAAC GAGCAGGTCG T
Translation
T Q S A S C C S S R A R F R A R R A A R F S * R R P S R P R G R N N F1
R R A Q A A A R Q G R D S G R E G R Q G F R D A G R Q D Q G G E I F2
A E R K L L L V K G A I P G A K G G K V F V T P A V K T K G A K * F3
1 ACGCAGAGCGCAAGCTGCTGCTCGTCAAGGGCGCGATTCCGGGCGCGAAGGGCGGCAAGGTTTTCGTGACGCCGGCCGTCAAGACCAAGGGGGCGAAATA 100
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G T Q A P E R K W S G R C S G Q R V G R R V R S * L Q R S A D P P F1
M E L K L L N E N G Q E G A V V N A S D V V F G R D Y N E A L I H Q F2
W N S S S * T K M V R K V Q W S T R R T S C S V V T T T K R * S T F3
101 ATGGAACTCAAGCTCCTGAACGAAAATGGTCAGGAAGGTGCAGTGGTCAACGCGTCGGACGTCGTGTTCGGTCGTGACTACAACGAAGCGCTGATCCACC 200
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G R R R V P G E C S P G * P R T E G P * A S Q A H H Q E A V A S E F1
V V V A Y Q A N A R Q G N R A Q K D R E Q V K H T T K K P W R Q K F2
R S S S R T R R M L A R V T A H R R T V S K S S T P P R S R G V R R F3
201 AGGTCGTCGTCGCGTACCAGGCGAATGCTCGCCAGGGTAACCGCGCACAGAAGGACCGTGAGCAAGTCAAGCACACCACCAAGAAGCCGTGGCGTCAGAA 300
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G Y G P R S C R Y V V E P V V A W R W S H L P E L A G R E L L A Q G F1
G T G R A R A G M S S S P L W R G G G R I F P N S P E E N F S H K F2
V R A A L V P V C R R A R C G V A V V A S S R T R R K R T S R T R F3
301 GGGTACGGGCCGCGCTCGTGCCGGTATGTCGTCGAGCCCGTTGTGGCGTGGCGGTGGTCGCATCTTCCCGAACTCGCCGGAAGAGAACTTCTCGCACAAG 400
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Q Q E D A S R R S L L D L L A A G P * R P S V G R R G H H P R S A F1
V N K K M H R A G L C S I F S Q L A R E G R L S V V E D I I L E A P F2
S T R R C I A Q V S A R S S R S W P V K A V C R S S R T S S S K R F3
401 GTCAACAAGAAGATGCATCGCGCAGGTCTCTGCTCGATCTTCTCGCAGCTGGCCCGTGAAGGCCGTCTGTCGGTCGTCGAGGACATCATCCTCGAAGCGC 500
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E D Q A A G R Q I Q D H G S R L R P D H H G Y G R R E P V P G F A F1
K T K L L A D K F K T M G L D S V L I I T D T V D E N L Y L A S R F2
R R P S C W P T N S R P W V S T P S * S S R I R S T R T C T W L R A F3
501 CGAAGACCAAGCTGCTGGCCGACAAATTCAAGACCATGGGTCTCGACTCCGTCCTGATCATCACGGATACGGTCGACGAGAACCTGTACCTGGCTTCGCG 600
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Q P A A R G D C R A A L R * P A V A D L L Q E S A G H E G C G R P D F1
N L P H V A I V E P R Y A D P L S L I Y F K K V L V T K A A V A Q F2
T C R T W R L S S R A T L T R C R * S T S R K C W S R R L R S P R F3
601 CAACCTGCCGCACGTGGCGATTGTCGAGCCGCGCTACGCTGACCCGCTGTCGCTGATCTACTTCAAGAAAGTGCTGGTCACGAAGGCTGCGGTCGCCCAG 700
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R G V A V M S E I R K N D H R L M Q V L L A P V I S E K A T L V A F1
I E E L L S * A R F A R T I I V * C R S C S H R * F P K R R R W L P F2
S R S C C H E R D S Q E R S S F D A G P A R T G D F R K G D A G C F3
701 ATCGAGGAGTTGCTGTCATGAGCGAGATTCGCAAGAACGATCATCGTTTGATGCAGGTCCTGCTCGCACCGGTGATTTCCGAAAAGGCGACGCTGGTTGC 800
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D K N E Q V V F1
T R T S R S X F2
R Q E R A G R F3
801 CGACAAGAACGAGCAGGTCGT 821
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