BACT000032 (rplC) allele sequence: id-72
Contig position
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- yes
- method
- Illumina
Sequence
TGCTTGGCTT TTCGCGCATT CGCGTAAAAA AGTCGGGCCT TGCGTGCCCG GCATTTTGTA AATCAGCCCC GACCAATCGC AGTCGGGAAT GGAGAAAATG ATGAGCCTTG GACTCGTAGG TCGCAAGGTT GGCATGACCC GTATCTTCAC GGCTGAAGGG GATTCGATTC CCGTCACCGT GCTGGACGTG TCGGACAACC GCGTGACGCA GATCAAGACT GTTGAAACCG ACGGCTACAC GGCCGTGCAG GTTGCATTCG GCTCCCGCCG CGCATCGCGC GTGACGAAGC CGCTGGCAGG TCATCTCGCC AAAGCCGGTG TCGAAGCCGG TGAAATCCTC AAGGAATTCC GCATTGACGC GGCCAAGGCA GCCGAGCTGT CGAATGGCGC CGTGGTCGGT GCAGATCTTT TCGAAGTAGG CCAGAAGGTC GACGTGCAAG GCGTGTCGAT CGGTAAGGGC TACGCCGGTA CGATCAAGCG TTACAACTTC TCCTCCGGCC GTGCCACGCA CGGTAACTCG CGCTCGCACA ACGTGCCGGG CTCGATCGGT ATGGCGCAGG ATCCGGGTCG CGTTTTCCCG GGTAAGCGCA TGACGGGTCA CCTCGGTGAC GTTACGGTGA CGGTGCAGAA CCTCGAAATC GCTCGTATCG ACGCAGAGCG CAAGCTGCTG CTCGTCAAGG GCGCGATTCC GGGCGCGAAG GGCGGCAAGG TTTTCGTGAC GCCGGCCGTC AAGACCAAGG GGGCGAAATA ATGGAACTCA AGCTCCTGAA CGAAAATGGT CAGGAAGGTG CAGTGGTCAA CGCGTCGGAC GTCGTGTTCG GTCGTGACTA CAACGAAGCG CTGATCCACC A
Translation
C L A F R A F A * K S R A L R A R H F V N Q P R P I A V G N G E N D F1
A W L F A H S R K K V G P C V P G I L * I S P D Q S Q S G M E K M F2
L G F S R I R V K K S G L A C P A F C K S A P T N R S R E W R K * F3
1 TGCTTGGCTTTTCGCGCATTCGCGTAAAAAAGTCGGGCCTTGCGTGCCCGGCATTTTGTAAATCAGCCCCGACCAATCGCAGTCGGGAATGGAGAAAATG 100
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E P W T R R S Q G W H D P Y L H G * R G F D S R H R A G R V G Q P F1
M S L G L V G R K V G M T R I F T A E G D S I P V T V L D V S D N R F2
* A L D S * V A R L A * P V S S R L K G I R F P S P C W T C R T T F3
101 ATGAGCCTTGGACTCGTAGGTCGCAAGGTTGGCATGACCCGTATCTTCACGGCTGAAGGGGATTCGATTCCCGTCACCGTGCTGGACGTGTCGGACAACC 200
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R D A D Q D C * N R R L H G R A G C I R L P P R I A R D E A A G R F1
V T Q I K T V E T D G Y T A V Q V A F G S R R A S R V T K P L A G F2
A * R R S R L L K P T A T R P C R L H S A P A A H R A * R S R W Q V F3
201 GCGTGACGCAGATCAAGACTGTTGAAACCGACGGCTACACGGCCGTGCAGGTTGCATTCGGCTCCCGCCGCGCATCGCGCGTGACGAAGCCGCTGGCAGG 300
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S S R Q S R C R S R * N P Q G I P H * R G Q G S R A V E W R R G R C F1
H L A K A G V E A G E I L K E F R I D A A K A A E L S N G A V V G F2
I S P K P V S K P V K S S R N S A L T R P R Q P S C R M A P W S V F3
301 TCATCTCGCCAAAGCCGGTGTCGAAGCCGGTGAAATCCTCAAGGAATTCCGCATTGACGCGGCCAAGGCAGCCGAGCTGTCGAATGGCGCCGTGGTCGGT 400
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R S F R S R P E G R R A R R V D R * G L R R Y D Q A L Q L L L R P F1
A D L F E V G Q K V D V Q G V S I G K G Y A G T I K R Y N F S S G R F2
Q I F S K * A R R S T C K A C R S V R A T P V R S S V T T S P P A F3
401 GCAGATCTTTTCGAAGTAGGCCAGAAGGTCGACGTGCAAGGCGTGTCGATCGGTAAGGGCTACGCCGGTACGATCAAGCGTTACAACTTCTCCTCCGGCC 500
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C H A R * L A L A Q R A G L D R Y G A G S G S R F P G * A H D G S F1
A T H G N S R S H N V P G S I G M A Q D P G R V F P G K R M T G H F2
V P R T V T R A R T T C R A R S V W R R I R V A F S R V S A * R V T F3
501 GTGCCACGCACGGTAACTCGCGCTCGCACAACGTGCCGGGCTCGATCGGTATGGCGCAGGATCCGGGTCGCGTTTTCCCGGGTAAGCGCATGACGGGTCA 600
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P R * R Y G D G A E P R N R S Y R R R A Q A A A R Q G R D S G R E G F1
L G D V T V T V Q N L E I A R I D A E R K L L L V K G A I P G A K F2
S V T L R * R C R T S K S L V S T Q S A S C C S S R A R F R A R R F3
601 CCTCGGTGACGTTACGGTGACGGTGCAGAACCTCGAAATCGCTCGTATCGACGCAGAGCGCAAGCTGCTGCTCGTCAAGGGCGCGATTCCGGGCGCGAAG 700
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R Q G F R D A G R Q D Q G G E I M E L K L L N E N G Q E G A V V N F1
G G K V F V T P A V K T K G A K * W N S S S * T K M V R K V Q W S T F2
A A R F S * R R P S R P R G R N N G T Q A P E R K W S G R C S G Q F3
701 GGCGGCAAGGTTTTCGTGACGCCGGCCGTCAAGACCAAGGGGGCGAAATAATGGAACTCAAGCTCCTGAACGAAAATGGTCAGGAAGGTGCAGTGGTCAA 800
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A S D V V F G R D Y N E A L I H X F1
R R T S C S V V T T T K R * S T X F2
R V G R R V R S * L Q R S A D P P F3
801 CGCGTCGGACGTCGTGTTCGGTCGTGACTACAACGAAGCGCTGATCCACCA 851
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