BACT000031 (rplB) allele sequence: id-72
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- yes
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- Illumina
Sequence
GCTTCGGCCG TTCGATGGGC CGTCGCAAGG ACGTGAAGAA GGCGTACGTT TGCCTGAAGC CCGGCCAGGA AATCAACTTT GAAGCGGAGG CCAAGTAATC ATGGCAATCG TGAAAGTTAA ACCGACTTCG CCGGGTCGCC GCGCGATGGT CAAGGTGGTC AACAAGGATC TGCACCAGGG CAAGCCGCAC GCGGCACTGC TCGACACGCA GAGCTCGACC GCCGGCCGTA ACAACAACGG CCGCATCACC ACCCGCCATA AGGGCGGTGG TCACAAGCAT CACTATCGTA TCGTCGACTT CCGTCGCACG AAGGATGGCA TTCCGGCAAA GGTCGAGCGT CTCGAGTACG ACCCGAACCG CAGCGCGAAC ATTGCGCTGG TGCTCTACGC TGACGGCGAA CGTCGCTACA TCATCGCCCC GAAGGGCCTG ACCGTCGGCC AACAGCTGAT GTCGGGTTCG GAAGCGCCGA TCCGTGCAGG CAACACGCTG CCGATCCGCA ACATTCCGGT CGGTACGACG ATCCACTGCA TCGAGATGCT GCCGGGCAAG GGCGCGCAAA TGGCGCGTTC GGCTGGCACG TCGGCCATGC TGCTGGCGCG TGAAGGCGTC TACGCGCAGG TTCGTCTGCG CTCGGGCGAA ATCCGCCGCG TGCACATCGA GTGCCGTGCA ACGATCGGTG AAGTCGGCAA CGAAGAGCAT AGCCTGCGCC AGATCGGCAA GGCTGGCGCG AACCGCTGGC GCGGTATCCG CCCGACGGTG CGTGGCGTTG CGATGAACCC GGTCGATCAC CCGCACGGTG GTGGTGAGGG CAAGACGGCT GCAGGTCGCG ATCCGGTGAG CCCGTGGGGC ACGCCGACCA AGGGTTATCG CACCCGCAGC AACAAGCGCA CGACGACGAT GATCGTCCAG CGCCGTCACA AGCGTTAAGG AGTAGGCAAT GGCACGTTCT GTAAAAAAAG GTCCGTTCTG CGACGCCCAT TTGCTGAAGA AAGTTGAGGC GGCTGCAGCT TCGCGCGACA AAAAGCCG
Translation
A S A V R W A V A R T * R R R T F A * S P A R K S T L K R R P S N H F1
L R P F D G P S Q G R E E G V R L P E A R P G N Q L * S G G Q V I F2
F G R S M G R R K D V K K A Y V C L K P G Q E I N F E A E A K * S F3
1 GCTTCGGCCGTTCGATGGGCCGTCGCAAGGACGTGAAGAAGGCGTACGTTTGCCTGAAGCCCGGCCAGGAAATCAACTTTGAAGCGGAGGCCAAGTAATC 100
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G N R E S * T D F A G S P R D G Q G G Q Q G S A P G Q A A R G T A F1
M A I V K V K P T S P G R R A M V K V V N K D L H Q G K P H A A L L F2
W Q S * K L N R L R R V A A R W S R W S T R I C T R A S R T R H C F3
101 ATGGCAATCGTGAAAGTTAAACCGACTTCGCCGGGTCGCCGCGCGATGGTCAAGGTGGTCAACAAGGATCTGCACCAGGGCAAGCCGCACGCGGCACTGC 200
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R H A E L D R R P * Q Q R P H H H P P * G R W S Q A S L S Y R R L F1
D T Q S S T A G R N N N G R I T T R H K G G G H K H H Y R I V D F F2
S T R R A R P P A V T T T A A S P P A I R A V V T S I T I V S S T S F3
201 TCGACACGCAGAGCTCGACCGCCGGCCGTAACAACAACGGCCGCATCACCACCCGCCATAAGGGCGGTGGTCACAAGCATCACTATCGTATCGTCGACTT 300
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P S H E G W H S G K G R A S R V R P E P Q R E H C A G A L R * R R T F1
R R T K D G I P A K V E R L E Y D P N R S A N I A L V L Y A D G E F2
V A R R M A F R Q R S S V S S T T R T A A R T L R W C S T L T A N F3
301 CCGTCGCACGAAGGATGGCATTCCGGCAAAGGTCGAGCGTCTCGAGTACGACCCGAACCGCAGCGCGAACATTGCGCTGGTGCTCTACGCTGACGGCGAA 400
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S L H H R P E G P D R R P T A D V G F G S A D P C R Q H A A D P Q F1
R R Y I I A P K G L T V G Q Q L M S G S E A P I R A G N T L P I R N F2
V A T S S P R R A * P S A N S * C R V R K R R S V Q A T R C R S A F3
401 CGTCGCTACATCATCGCCCCGAAGGGCCTGACCGTCGGCCAACAGCTGATGTCGGGTTCGGAAGCGCCGATCCGTGCAGGCAACACGCTGCCGATCCGCA 500
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H S G R Y D D P L H R D A A G Q G R A N G A F G W H V G H A A G A F1
I P V G T T I H C I E M L P G K G A Q M A R S A G T S A M L L A R F2
T F R S V R R S T A S R C C R A R A R K W R V R L A R R P C C W R V F3
501 ACATTCCGGTCGGTACGACGATCCACTGCATCGAGATGCTGCCGGGCAAGGGCGCGCAAATGGCGCGTTCGGCTGGCACGTCGGCCATGCTGCTGGCGCG 600
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* R R L R A G S S A L G R N P P R A H R V P C N D R * S R Q R R A * F1
E G V Y A Q V R L R S G E I R R V H I E C R A T I G E V G N E E H F2
K A S T R R F V C A R A K S A A C T S S A V Q R S V K S A T K S I F3
601 TGAAGGCGTCTACGCGCAGGTTCGTCTGCGCTCGGGCGAAATCCGCCGCGTGCACATCGAGTGCCGTGCAACGATCGGTGAAGTCGGCAACGAAGAGCAT 700
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P A P D R Q G W R E P L A R Y P P D G A W R C D E P G R S P A R W F1
S L R Q I G K A G A N R W R G I R P T V R G V A M N P V D H P H G G F2
A C A R S A R L A R T A G A V S A R R C V A L R * T R S I T R T V F3
701 AGCCTGCGCCAGATCGGCAAGGCTGGCGCGAACCGCTGGCGCGGTATCCGCCCGACGGTGCGTGGCGTTGCGATGAACCCGGTCGATCACCCGCACGGTG 800
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W * G Q D G C R S R S G E P V G H A D Q G L S H P Q Q Q A H D D D F1
G E G K T A A G R D P V S P W G T P T K G Y R T R S N K R T T T M F2
V V R A R R L Q V A I R * A R G A R R P R V I A P A A T S A R R R * F3
801 GTGGTGAGGGCAAGACGGCTGCAGGTCGCGATCCGGTGAGCCCGTGGGGCACGCCGACCAAGGGTTATCGCACCCGCAGCAACAAGCGCACGACGACGAT 900
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D R P A P S Q A L R S R Q W H V L * K K V R S A T P I C * R K L R R F1
I V Q R R H K R * G V G N G T F C K K R S V L R R P F A E E S * G F2
S S S A V T S V K E * A M A R S V K K G P F C D A H L L K K V E A F3
901 GATCGTCCAGCGCCGTCACAAGCGTTAAGGAGTAGGCAATGGCACGTTCTGTAAAAAAAGGTCCGTTCTGCGACGCCCATTTGCTGAAGAAAGTTGAGGC 1000
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L Q L R A T K S R F1
G C S F A R Q K A X F2
A A A S R D K K P F3
1001 GGCTGCAGCTTCGCGCGACAAAAAGCCG 1028
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