BACT000030 (rplA) allele sequence: id-72
Contig position
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- orientation
- reverse
- complete
- yes
- method
- Illumina
Sequence
GACCAAGATG CCGGACCTTA CGGCAGCTGA TCTGGACGCA GCCGTTCGCA CCATCGCTGG TAGCGCACGC TCGATGGGCA TCACCGTGGA GGGCGTGTAA ATGGCTAAGA TCTCCAAGCG CCGTCAGGCA TTCGAAGCGA AGGTCGATCG TCAGAAGCTG TACGCGATCG AAGACGCACT GGCACTCGTG AAGGAATGCG CGAGCGCGAA GTTCAACGAG TCGATCGACG TCGCAGTTCA GCTCGGCATC GATGCGAAGA AGTCGGACCA GGTCGTTCGT GGTTCGGTCG TTCTGCCGGC AGGTACGGGC AAGTCGGTTC GCGTTGCGGT GTTCGCGCAA GGCGAAAAGG CCGAGCAGGC TCGCGCAGCA GGCGCCGAAA TCGTCGGCAT GGAAGACCTG GCTGAGCAGA TCAAGGCTGG CCAGATGGAC TTCGACATCG TGATCGCTTC GCCGGACACG ATGCGTATCG TCGGTACGCT CGGTCAGATC CTCGGCCCGC GCGGCCTGAT GCCGAACCCG AAGGTCGGCA CGGTCACGCC GGACGTCGCA ACCGCAGTGA AGAACGCAAA GGCAGGTCAG GTGCAGTTCC GCGTCGACAA GGCCGGTATC ATCCACGCAA CGATCGGCCG TGCGTCGTTC GAAGCGACCG CACTGCGTTT GAACCTGTCG GCACTGATCG AAGCGCTGCA GAAGGCCAAG CCGGCAACGA GCAAGGGCGT CTACCTGCGC AAGATCGCAC TGTCGAGCAC GATGGGCGTC GGCGTGCGCG TCGACCAGGC TACGCTGGCA GCGCAGTAAG CAAGTATTCG GGCCGCCTCG TTCGCGAGGC GGCCTAAATG GGCTTTGGGC GGTTGTTCGT GCAGCAAGGC GAACAACCGG TTATCAAAGA CCGTTGGTG
Translation
D Q D A G P Y G S * S G R S R S H H R W * R T L D G H H R G G R V N F1
T K M P D L T A A D L D A A V R T I A G S A R S M G I T V E G V * F2
P R C R T L R Q L I W T Q P F A P S L V A H A R W A S P W R A C K F3
1 GACCAAGATGCCGGACCTTACGGCAGCTGATCTGGACGCAGCCGTTCGCACCATCGCTGGTAGCGCACGCTCGATGGGCATCACCGTGGAGGGCGTGTAA 100
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G * D L Q A P S G I R S E G R S S E A V R D R R R T G T R E G M R F1
M A K I S K R R Q A F E A K V D R Q K L Y A I E D A L A L V K E C A F2
W L R S P S A V R H S K R R S I V R S C T R S K T H W H S * R N A F3
101 ATGGCTAAGATCTCCAAGCGCCGTCAGGCATTCGAAGCGAAGGTCGATCGTCAGAAGCTGTACGCGATCGAAGACGCACTGGCACTCGTGAAGGAATGCG 200
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E R E V Q R V D R R R S S A R H R C E E V G P G R S W F G R S A G F1
S A K F N E S I D V A V Q L G I D A K K S D Q V V R G S V V L P A F2
R A R S S T S R S T S Q F S S A S M R R S R T R S F V V R S F C R Q F3
201 CGAGCGCGAAGTTCAACGAGTCGATCGACGTCGCAGTTCAGCTCGGCATCGATGCGAAGAAGTCGGACCAGGTCGTTCGTGGTTCGGTCGTTCTGCCGGC 300
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R Y G Q V G S R C G V R A R R K G R A G S R S R R R N R R H G R P G F1
G T G K S V R V A V F A Q G E K A E Q A R A A G A E I V G M E D L F2
V R A S R F A L R C S R K A K R P S R L A Q Q A P K S S A W K T W F3
301 AGGTACGGGCAAGTCGGTTCGCGTTGCGGTGTTCGCGCAAGGCGAAAAGGCCGAGCAGGCTCGCGCAGCAGGCGCCGAAATCGTCGGCATGGAAGACCTG 400
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* A D Q G W P D G L R H R D R F A G H D A Y R R Y A R S D P R P A F1
A E Q I K A G Q M D F D I V I A S P D T M R I V G T L G Q I L G P R F2
L S R S R L A R W T S T S * S L R R T R C V S S V R S V R S S A R F3
401 GCTGAGCAGATCAAGGCTGGCCAGATGGACTTCGACATCGTGATCGCTTCGCCGGACACGATGCGTATCGTCGGTACGCTCGGTCAGATCCTCGGCCCGC 500
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R P D A E P E G R H G H A G R R N R S E E R K G R S G A V P R R Q F1
G L M P N P K V G T V T P D V A T A V K N A K A G Q V Q F R V D K F2
A A * C R T R R S A R S R R T S Q P Q * R T Q R Q V R C S S A S T R F3
501 GCGGCCTGATGCCGAACCCGAAGGTCGGCACGGTCACGCCGGACGTCGCAACCGCAGTGAAGAACGCAAAGGCAGGTCAGGTGCAGTTCCGCGTCGACAA 600
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G R Y H P R N D R P C V V R S D R T A F E P V G T D R S A A E G Q A F1
A G I I H A T I G R A S F E A T A L R L N L S A L I E A L Q K A K F2
P V S S T Q R S A V R R S K R P H C V * T C R H * S K R C R R P S F3
601 GGCCGGTATCATCCACGCAACGATCGGCCGTGCGTCGTTCGAAGCGACCGCACTGCGTTTGAACCTGTCGGCACTGATCGAAGCGCTGCAGAAGGCCAAG 700
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G N E Q G R L P A Q D R T V E H D G R R R A R R P G Y A G S A V S F1
P A T S K G V Y L R K I A L S S T M G V G V R V D Q A T L A A Q * A F2
R Q R A R A S T C A R S H C R A R W A S A C A S T R L R W Q R S K F3
701 CCGGCAACGAGCAAGGGCGTCTACCTGCGCAAGATCGCACTGTCGAGCACGATGGGCGTCGGCGTGCGCGTCGACCAGGCTACGCTGGCAGCGCAGTAAG 800
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K Y S G R L V R E A A * M G F G R L F V Q Q G E Q P V I K D R W X F1
S I R A A S F A R R P K W A L G G C S C S K A N N R L S K T V G X F2
Q V F G P P R S R G G L N G L W A V V R A A R R T T G Y Q R P L V F3
801 CAAGTATTCGGGCCGCCTCGTTCGCGAGGCGGCCTAAATGGGCTTTGGGCGGTTGTTCGTGCAGCAAGGCGAACAACCGGTTATCAAAGACCGTTGGTG 899
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