BACT000021 (rpsU) allele sequence: id-72
Contig position
- sequence bin id
- 3321
- contig length
- 132030
- start
- 10521
- end
- 10733
- length
- 213
- orientation
- reverse
- complete
- yes
- method
- Illumina
Sequence
CGTATTTCCG CTCGTTTCGC CTGTTGTGGG GACGCCCGGA TGGCCGGTGC GTGGCGCTTG GCCGCTACGT TTTTGACCGT TTAAGCACTT TAGGAACGAC ATGACGACGA TTCTTCTGAA AGAAAACGAG CCGTTCGAAG TGGCGATTCG CCGCTTTCGC CGTGCTATCG AAAAAAATGG CCTGATCGCT GAACTGCGCG AACGCCAGTC CTACGAAAAG CCGACCGCAG TCCGCAAGCG CAAGAAGGCA GCAGCCGTCA AGCGCCTGCA CAAGCGTCTG CGTAGCCAGA TGCTGCCGAA GAAGCTCCAC TAAGAGCGTC TGACGGTTCG CCGCGAAACG GCGGAGCGTG CTTCGAAAGA AGCCGCTCCG CCGTTTTGCT TTTTGGCTGG CTGTTCCGGG CGGGAAAGGC GTC
Translation
R I S A R F A C C G D A R M A G A W R L A A T F L T V * A L * E R H F1
V F P L V S P V V G T P G W P V R G A W P L R F * P F K H F R N D F2
Y F R S F R L L W G R P D G R C V A L G R Y V F D R L S T L G T T F3
1 CGTATTTCCGCTCGTTTCGCCTGTTGTGGGGACGCCCGGATGGCCGGTGCGTGGCGCTTGGCCGCTACGTTTTTGACCGTTTAAGCACTTTAGGAACGAC 100
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D D D S S E R K R A V R S G D S P L S P C Y R K K W P D R * T A R F1
M T T I L L K E N E P F E V A I R R F R R A I E K N G L I A E L R E F2
* R R F F * K K T S R S K W R F A A F A V L S K K M A * S L N C A F3
101 ATGACGACGATTCTTCTGAAAGAAAACGAGCCGTTCGAAGTGGCGATTCGCCGCTTTCGCCGTGCTATCGAAAAAAATGGCCTGATCGCTGAACTGCGCG 200
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T P V L R K A D R S P Q A Q E G S S R Q A P A Q A S A * P D A A E F1
R Q S Y E K P T A V R K R K K A A A V K R L H K R L R S Q M L P K F2
N A S P T K S R P Q S A S A R R Q Q P S S A C T S V C V A R C C R R F3
201 AACGCCAGTCCTACGAAAAGCCGACCGCAGTCCGCAAGCGCAAGAAGGCAGCAGCCGTCAAGCGCCTGCACAAGCGTCTGCGTAGCCAGATGCTGCCGAA 300
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E A P L R A S D G S P R N G G A C F E R S R S A V L L F G W L F R A F1
K L H * E R L T V R R E T A E R A S K E A A P P F C F L A G C S G F2
S S T K S V * R F A A K R R S V L R K K P L R R F A F W L A V P G F3
301 GAAGCTCCACTAAGAGCGTCTGACGGTTCGCCGCGAAACGGCGGAGCGTGCTTCGAAAGAAGCCGCTCCGCCGTTTTGCTTTTTGGCTGGCTGTTCCGGG 400
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G K A S F1
R E R R X F2
G K G V F3
401 CGGGAAAGGCGTC 413
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