BACT000020 (rpsT) allele sequence: id-72
Contig position
- sequence bin id
- 3312
- contig length
- 41883
- start
- 26583
- end
- 26855
- length
- 273
- orientation
- forward
- complete
- yes
- method
- Illumina
Sequence
TTATGCGCCC CTGGGCAATC GTTCTCAGGG GACGGATCGA AAAGCAGCGC TTGGCCGTCA GGCTCCAAGC TCTGGAAACA GGACAGGATA AGGAACCGTC ATGGCTAACT CCGCACAAGC ACGCAAGCGC GCCCGCCAGG CCGCGAAGGC AAATTCGCAC AACTCGGCGC TGCGCTCGAA ATTCCGCACC GCGATCAAGT CGGTTCGCAA GGCTGTTGAA GCCGGCGACC AGGCAAAGGC TGCCGAGCTG TTCAAGGCTG CCGTGAAGAC GATCGACACG ATCGCCGACA AGAAGATCGT TCACAAGAAC AAGGCCGCTC GCAGCAAGAG CCGCCTCGCC GCAGCCGTCA AGGGCCTGCA GGCAGCAGCG TAAATCCGGT GTGCCCGCTT CGGCGGGCGC CCTGTTTCCT GCGATCGTGA AAAAGCCCGC CTAGGCGGGC TTTTTTGCTG TGCGCGCGCC GCGCGCGTCG GGC
Translation
L C A P G Q S F S G D G S K S S A W P S G S K L W K Q D R I R N R H F1
Y A P L G N R S Q G T D R K A A L G R Q A P S S G N R T G * G T V F2
M R P W A I V L R G R I E K Q R L A V R L Q A L E T G Q D K E P S F3
1 TTATGCGCCCCTGGGCAATCGTTCTCAGGGGACGGATCGAAAAGCAGCGCTTGGCCGTCAGGCTCCAAGCTCTGGAAACAGGACAGGATAAGGAACCGTC 100
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G * L R T S T Q A R P P G R E G K F A Q L G A A L E I P H R D Q V F1
M A N S A Q A R K R A R Q A A K A N S H N S A L R S K F R T A I K S F2
W L T P H K H A S A P A R P R R Q I R T T R R C A R N S A P R S S F3
101 ATGGCTAACTCCGCACAAGCACGCAAGCGCGCCCGCCAGGCCGCGAAGGCAAATTCGCACAACTCGGCGCTGCGCTCGAAATTCCGCACCGCGATCAAGT 200
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G S Q G C * S R R P G K G C R A V Q G C R E D D R H D R R Q E D R F1
V R K A V E A G D Q A K A A E L F K A A V K T I D T I A D K K I V F2
R F A R L L K P A T R Q R L P S C S R L P * R R S T R S P T R R S F F3
201 CGGTTCGCAAGGCTGTTGAAGCCGGCGACCAGGCAAAGGCTGCCGAGCTGTTCAAGGCTGCCGTGAAGACGATCGACACGATCGCCGACAAGAAGATCGT 300
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S Q E Q G R S Q Q E P P R R S R Q G P A G S S V N P V C P L R R A P F1
H K N K A A R S K S R L A A A V K G L Q A A A * I R C A R F G G R F2
T R T R P L A A R A A S P Q P S R A C R Q Q R K S G V P A S A G A F3
301 TCACAAGAACAAGGCCGCTCGCAGCAAGAGCCGCCTCGCCGCAGCCGTCAAGGGCCTGCAGGCAGCAGCGTAAATCCGGTGTGCCCGCTTCGGCGGGCGC 400
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C F L R S * K S P P R R A F L L C A R R A R R A F1
P V S C D R E K A R L G G L F C C A R A A R V G X F2
L F P A I V K K P A * A G F F A V R A P R A S G F3
401 CCTGTTTCCTGCGATCGTGAAAAAGCCCGCCTAGGCGGGCTTTTTTGCTGTGCGCGCGCCGCGCGCGTCGGGC 473
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