BACT000019 (rpsS) allele sequence: id-72
Contig position
- sequence bin id
- 3332
- contig length
- 61718
- start
- 38936
- end
- 39211
- length
- 276
- orientation
- reverse
- complete
- yes
- method
- Illumina
Sequence
AGCCCGTGGG GCACGCCGAC CAAGGGTTAT CGCACCCGCA GCAACAAGCG CACGACGACG ATGATCGTCC AGCGCCGTCA CAAGCGTTAA GGAGTAGGCA ATGGCACGTT CTGTAAAAAA AGGTCCGTTC TGCGACGCCC ATTTGCTGAA GAAAGTTGAG GCGGCTGCAG CTTCGCGCGA CAAAAAGCCG ATCAAGACCT GGTCGCGTCG CTCGACGATT CTGCCGGATT TCATCGGCCT GACGATCGCT GTTCACAACG GCCGTCAACA CGTTCCGGTG TACATCTCGG AAAACATGGT CGGCCACAAG CTTGGCGAGT TCGCACTGAC CCGTACGTTC AAGGGTCACG CAGCCGACAA GAAGGCCAAG AAATAAGGGG CAATCAAGAT GGAAGTGAAA GCAATTCATC GCGGTGCCCG CATCTCGGCG CAAAAAACGC GCCTTGTGGC TGACCAGATC CGCGGTTTGC CGGTCG
Translation
S P W G T P T K G Y R T R S N K R T T T M I V Q R R H K R * G V G N F1
A R G A R R P R V I A P A A T S A R R R * S S S A V T S V K E * A F2
P V G H A D Q G L S H P Q Q Q A H D D D D R P A P S Q A L R S R Q F3
1 AGCCCGTGGGGCACGCCGACCAAGGGTTATCGCACCCGCAGCAACAAGCGCACGACGACGATGATCGTCCAGCGCCGTCACAAGCGTTAAGGAGTAGGCA 100
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
G T F C K K R S V L R R P F A E E S * G G C S F A R Q K A D Q D L F1
M A R S V K K G P F C D A H L L K K V E A A A A S R D K K P I K T W F2
W H V L * K K V R S A T P I C * R K L R R L Q L R A T K S R S R P F3
101 ATGGCACGTTCTGTAAAAAAAGGTCCGTTCTGCGACGCCCATTTGCTGAAGAAAGTTGAGGCGGCTGCAGCTTCGCGCGACAAAAAGCCGATCAAGACCT 200
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
V A S L D D S A G F H R P D D R C S Q R P S T R S G V H L G K H G F1
S R R S T I L P D F I G L T I A V H N G R Q H V P V Y I S E N M V F2
G R V A R R F C R I S S A * R S L F T T A V N T F R C T S R K T W S F3
201 GGTCGCGTCGCTCGACGATTCTGCCGGATTTCATCGGCCTGACGATCGCTGTTCACAACGGCCGTCAACACGTTCCGGTGTACATCTCGGAAAACATGGT 300
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
R P Q A W R V R T D P Y V Q G S R S R Q E G Q E I R G N Q D G S E S F1
G H K L G E F A L T R T F K G H A A D K K A K K * G A I K M E V K F2
A T S L A S S H * P V R S R V T Q P T R R P R N K G Q S R W K * K F3
301 CGGCCACAAGCTTGGCGAGTTCGCACTGACCCGTACGTTCAAGGGTCACGCAGCCGACAAGAAGGCCAAGAAATAAGGGGCAATCAAGATGGAAGTGAAA 400
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
N S S R C P H L G A K N A P C G * P D P R F A G R F1
A I H R G A R I S A Q K T R L V A D Q I R G L P V X F2
Q F I A V P A S R R K K R A L W L T R S A V C R S F3
401 GCAATTCATCGCGGTGCCCGCATCTCGGCGCAAAAAACGCGCCTTGTGGCTGACCAGATCCGCGGTTTGCCGGTCG 476
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:-