BACT000018 (rpsR) allele sequence: id-72
Contig position
- sequence bin id
- 3376
- contig length
- 227887
- start
- 153600
- end
- 153875
- length
- 276
- orientation
- reverse
- complete
- yes
- method
- Illumina
Sequence
GAGACGCTGT TCACGGGCTT CCTGGCAAAA AAGAGCCGCA ACGCGAGAAC CTTGGTGTTT CACATCACTG CATTGCAGGA CATAGGAAAG GACTGAAATC ATGGCCCGCC CGACTGGTAA GAAATTCGAC AAGCGTCGTC AGCAACAAAA CCCGCTCTTC AAGCGCAAGA AGTTCTGCCG CTTCACGGCT GCAGGCGTCG ATCAGATCGA CTACAAGGAC ACGGAAACGC TGAAGGACTT CATCGGCGAA AACGGCAAGA TCACGCCGGC TCGCCTGACG GGTACGAAGG CGCACTATCA GCGTCAGCTG GATACGGCAA TCAAGCGTGC GCGTTTCCTC GCGCTGCTGC CGTACACCGA TCAGCACAAG GCGTAATCAG GCGACGCAAT AAGGAGAATT CGAATGCAAA TCATTCTGTT GGAAAAAGTC GCCAATCTGG GCAACCTCGG CGATATCGTC AAGGTCAAGG ACGGTT
Translation
E T L F T G F L A K K S R N A R T L V F H I T A L Q D I G K D * N H F1
R R C S R A S W Q K R A A T R E P W C F T S L H C R T * E R T E I F2
D A V H G L P G K K E P Q R E N L G V S H H C I A G H R K G L K S F3
1 GAGACGCTGTTCACGGGCTTCCTGGCAAAAAAGAGCCGCAACGCGAGAACCTTGGTGTTTCACATCACTGCATTGCAGGACATAGGAAAGGACTGAAATC 100
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G P P D W * E I R Q A S S A T K P A L Q A Q E V L P L H G C R R R F1
M A R P T G K K F D K R R Q Q Q N P L F K R K K F C R F T A A G V D F2
W P A R L V R N S T S V V S N K T R S S S A R S S A A S R L Q A S F3
101 ATGGCCCGCCCGACTGGTAAGAAATTCGACAAGCGTCGTCAGCAACAAAACCCGCTCTTCAAGCGCAAGAAGTTCTGCCGCTTCACGGCTGCAGGCGTCG 200
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S D R L Q G H G N A E G L H R R K R Q D H A G S P D G Y E G A L S F1
Q I D Y K D T E T L K D F I G E N G K I T P A R L T G T K A H Y Q F2
I R S T T R T R K R * R T S S A K T A R S R R L A * R V R R R T I S F3
201 ATCAGATCGACTACAAGGACACGGAAACGCTGAAGGACTTCATCGGCGAAAACGGCAAGATCACGCCGGCTCGCCTGACGGGTACGAAGGCGCACTATCA 300
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A S A G Y G N Q A C A F P R A A A V H R S A Q G V I R R R N K E N S F1
R Q L D T A I K R A R F L A L L P Y T D Q H K A * S G D A I R R I F2
V S W I R Q S S V R V S S R C C R T P I S T R R N Q A T Q * G E F F3
301 GCGTCAGCTGGATACGGCAATCAAGCGTGCGCGTTTCCTCGCGCTGCTGCCGTACACCGATCAGCACAAGGCGTAATCAGGCGACGCAATAAGGAGAATT 400
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N A N H S V G K S R Q S G Q P R R Y R Q G Q G R X F1
R M Q I I L L E K V A N L G N L G D I V K V K D G X F2
E C K S F C W K K S P I W A T S A I S S R S R T V F3
401 CGAATGCAAATCATTCTGTTGGAAAAAGTCGCCAATCTGGGCAACCTCGGCGATATCGTCAAGGTCAAGGACGGTT 476
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