BACT000017 (rpsQ) allele sequence: id-72
Contig position
- sequence bin id
- 3332
- contig length
- 61718
- start
- 36890
- end
- 37162
- length
- 273
- orientation
- reverse
- complete
- yes
- method
- Illumina
Sequence
AACTCGCGAC CCAGCAGCTC ACGAACACGA GCCAGCTGAA GAAGGTTCGT CGCGACATCG CACGTGTGCG GACCGTCATG ACTCAGAAGG CGAACCAGAA ATGAACGATA GCGTGAAAAC CTCGCTGAAG CGGACGCTGG TCGGTCGGGT CGTCAGCAAC AAGATGGACA AGACCGTCAC CGTGCTGATC GAGCACCGCG TCAAGCACCC GATCTACGGC AAGTATGTCG TGCGTTCGAA GAAGTACCAC GCGCACGATG AAGCGAACAC CTGCAACGAA GGCGATCTCG TCGAAATCCA GGAAACCCGT CCTGTTTCGA AGACGAAGGC CTGGACGGTG TCGCGCCTCG TCGAAGCAGC TCGCGTCATC TAAGCGGGCA GAGCAGTAGG CAGTAACAGG CACTTCGCCA TGAAGTGCTT GAAGTCGCAA AGTTTTTGCT TGCGTGACCG GGATTATTTG TTATAATCCC GGT
Translation
N S R P S S S R T R A S * R R F V A T S H V C G P S * L R R R T R N F1
T R D P A A H E H E P A E E G S S R H R T C A D R H D S E G E P E F2
L A T Q Q L T N T S Q L K K V R R D I A R V R T V M T Q K A N Q K F3
1 AACTCGCGACCCAGCAGCTCACGAACACGAGCCAGCTGAAGAAGGTTCGTCGCGACATCGCACGTGTGCGGACCGTCATGACTCAGAAGGCGAACCAGAA 100
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E R * R E N L A E A D A G R S G R Q Q Q D G Q D R H R A D R A P R F1
M N D S V K T S L K R T L V G R V V S N K M D K T V T V L I E H R V F2
* T I A * K P R * S G R W S V G S S A T R W T R P S P C * S S T A F3
101 ATGAACGATAGCGTGAAAACCTCGCTGAAGCGGACGCTGGTCGGTCGGGTCGTCAGCAACAAGATGGACAAGACCGTCACCGTGCTGATCGAGCACCGCG 200
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Q A P D L R Q V C R A F E E V P R A R * S E H L Q R R R S R R N P F1
K H P I Y G K Y V V R S K K Y H A H D E A N T C N E G D L V E I Q F2
S S T R S T A S M S C V R R S T T R T M K R T P A T K A I S S K S R F3
201 TCAAGCACCCGATCTACGGCAAGTATGTCGTGCGTTCGAAGAAGTACCACGCGCACGATGAAGCGAACACCTGCAACGAAGGCGATCTCGTCGAAATCCA 300
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G N P S C F E D E G L D G V A P R R S S S R H L S G Q S S R Q * Q A F1
E T R P V S K T K A W T V S R L V E A A R V I * A G R A V G S N R F2
K P V L F R R R R P G R C R A S S K Q L A S S K R A E Q * A V T G F3
301 GGAAACCCGTCCTGTTTCGAAGACGAAGGCCTGGACGGTGTCGCGCCTCGTCGAAGCAGCTCGCGTCATCTAAGCGGGCAGAGCAGTAGGCAGTAACAGG 400
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L R H E V L E V A K F L L A * P G L F V I I P V F1
H F A M K C L K S Q S F C L R D R D Y L L * S R X F2
T S P * S A * S R K V F A C V T G I I C Y N P G F3
401 CACTTCGCCATGAAGTGCTTGAAGTCGCAAAGTTTTTGCTTGCGTGACCGGGATTATTTGTTATAATCCCGGT 473
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