BACT000016 (rpsP) allele sequence: id-72
Contig position
- sequence bin id
- 3327
- contig length
- 292274
- start
- 177985
- end
- 178239
- length
- 255
- orientation
- forward
- complete
- yes
- method
- Illumina
Sequence
CCGTCGAATT TTTGCGCGTA AGTGTTTGTT GTGGCTTTGG TTTCCGGCTA TAATCGCACG TTTCAGTAGT TTCGAACCCG GTTTTCCCGA AGGATTTCAT ATGGTTATCA TCCGTCTGGC TCGTGGCGGC TCGAAGAAGC GCCCGTTCTA CAACATCGTC GCTACCGATT CGCGCAACCG TCGTGACGGT CGCTTCATCG AGCGCGTCGG CTTCTACAAC CCGGTCGCCA CGAAGGGCGA ATCGCTGCGT ATCGCTCAGG ATCGTCTGAC GTACTGGCAA GGTGTTGGCG CGCAACTGTC GCCGACCGTC CAGCGTCTCG TGAAGGAAGC GCAAAAGGCG CAGCCGGCTG CCTAACATGG CGCGGCGTAC CGGTCGTACC GGCTGCAAGG AGCATTGATG TCCGGTCACG ATTCCGGTAA TGCAAGGCGC GGGCGAGCGT CGTTTGGCGC ATTCG
Translation
P S N F C A * V F V V A L V S G Y N R T F Q * F R T R F S R R I S Y F1
R R I F A R K C L L W L W F P A I I A R F S S F E P G F P E G F H F2
V E F L R V S V C C G F G F R L * S H V S V V S N P V F P K D F I F3
1 CCGTCGAATTTTTGCGCGTAAGTGTTTGTTGTGGCTTTGGTTTCCGGCTATAATCGCACGTTTCAGTAGTTTCGAACCCGGTTTTCCCGAAGGATTTCAT 100
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G Y H P S G S W R L E E A P V L Q H R R Y R F A Q P S * R S L H R F1
M V I I R L A R G G S K K R P F Y N I V A T D S R N R R D G R F I E F2
W L S S V W L V A A R R S A R S T T S S L P I R A T V V T V A S S F3
101 ATGGTTATCATCCGTCTGGCTCGTGGCGGCTCGAAGAAGCGCCCGTTCTACAACATCGTCGCTACCGATTCGCGCAACCGTCGTGACGGTCGCTTCATCG 200
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A R R L L Q P G R H E G R I A A Y R S G S S D V L A R C W R A T V F1
R V G F Y N P V A T K G E S L R I A Q D R L T Y W Q G V G A Q L S F2
S A S A S T T R S P R R A N R C V S L R I V * R T G K V L A R N C R F3
201 AGCGCGTCGGCTTCTACAACCCGGTCGCCACGAAGGGCGAATCGCTGCGTATCGCTCAGGATCGTCTGACGTACTGGCAAGGTGTTGGCGCGCAACTGTC 300
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A D R P A S R E G S A K G A A G C L T W R G V P V V P A A R S I D V F1
P T V Q R L V K E A Q K A Q P A A * H G A A Y R S Y R L Q G A L M F2
R P S S V S * R K R K R R S R L P N M A R R T G R T G C K E H * C F3
301 GCCGACCGTCCAGCGTCTCGTGAAGGAAGCGCAAAAGGCGCAGCCGGCTGCCTAACATGGCGCGGCGTACCGGTCGTACCGGCTGCAAGGAGCATTGATG 400
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R S R F R * C K A R A S V V W R I R F1
S G H D S G N A R R G R A S F G A F X F2
P V T I P V M Q G A G E R R L A H S F3
401 TCCGGTCACGATTCCGGTAATGCAAGGCGCGGGCGAGCGTCGTTTGGCGCATTCG 455
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