BACT000015 (rpsO) allele sequence: id-72
Contig position
- sequence bin id
- 3338
- contig length
- 232441
- start
- 32374
- end
- 32643
- length
- 270
- orientation
- reverse
- complete
- yes
- method
- Illumina
Sequence
GCGCGTAGTT GTGCTACAAT GCGCGCCGGT TGTAAGTCAC GGCACGGCCA TTCTTCCGTG TCCGCGTGTA CAGTTGGAAA GTCGAAATCA AGGAAATCAC ATGTCTGTTG CAGATATCAA GAAGTCGGAA GTCGTTGCTC AGTTCGCCCG CGGTACCAAC GACACGGGTT CGCCCGAAGT CCAGGTCGCA CTGCTGACCG CACGTATCGT CGAACTGACG GGTCACTTCA AGACCCACGC GAAGGATCAC CACAGCCGCC GCGGCCTGCT GCGCATGGTG AGCCGCCGCC GCAAGCTGCT CGACTACCTC AAGGGCAAGG ATGCCGACCG TTACCGCGCG CTGATCGAGA AGCTGGGTCT GCGTAAGTAA TCGAGGCGAT TGCCGCCAGC AAGATGCCTG TGTCAGTCCG CTGATGCAGG CATTTTGTTT TTGCGCGGTG CGTAGCGTCA CACGCATCGC AGGTAGTCCG
Translation
A R S C A T M R A G C K S R H G H S S V S A C T V G K S K S R K S H F1
R V V V L Q C A P V V S H G T A I L P C P R V Q L E S R N Q G N H F2
A * L C Y N A R R L * V T A R P F F R V R V Y S W K V E I K E I T F3
1 GCGCGTAGTTGTGCTACAATGCGCGCCGGTTGTAAGTCACGGCACGGCCATTCTTCCGTGTCCGCGTGTACAGTTGGAAAGTCGAAATCAAGGAAATCAC 100
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V C C R Y Q E V G S R C S V R P R Y Q R H G F A R S P G R T A D R F1
M S V A D I K K S E V V A Q F A R G T N D T G S P E V Q V A L L T A F2
C L L Q I S R S R K S L L S S P A V P T T R V R P K S R S H C * P F3
101 ATGTCTGTTGCAGATATCAAGAAGTCGGAAGTCGTTGCTCAGTTCGCCCGCGGTACCAACGACACGGGTTCGCCCGAAGTCCAGGTCGCACTGCTGACCG 200
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T Y R R T D G S L Q D P R E G S P Q P P R P A A H G E P P P Q A A F1
R I V E L T G H F K T H A K D H H S R R G L L R M V S R R R K L L F2
H V S S N * R V T S R P T R R I T T A A A A C C A W * A A A A S C S F3
201 CACGTATCGTCGAACTGACGGGTCACTTCAAGACCCACGCGAAGGATCACCACAGCCGCCGCGGCCTGCTGCGCATGGTGAGCCGCCGCCGCAAGCTGCT 300
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R L P Q G Q G C R P L P R A D R E A G S A * V I E A I A A S K M P V F1
D Y L K G K D A D R Y R A L I E K L G L R K * S R R L P P A R C L F2
T T S R A R M P T V T A R * S R S W V C V S N R G D C R Q Q D A C F3
301 CGACTACCTCAAGGGCAAGGATGCCGACCGTTACCGCGCGCTGATCGAGAAGCTGGGTCTGCGTAAGTAATCGAGGCGATTGCCGCCAGCAAGATGCCTG 400
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S V R * C R H F V F A R C V A S H A S Q V V R F1
C Q S A D A G I L F L R G A * R H T H R R * S X F2
V S P L M Q A F C F C A V R S V T R I A G S P F3
401 TGTCAGTCCGCTGATGCAGGCATTTTGTTTTTGCGCGGTGCGTAGCGTCACACGCATCGCAGGTAGTCCG 470
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