BACT000014 (rpsN) allele sequence: id-72

Contig position

sequence bin id
3332
contig length
61718
start
35025
end
35330
length
306
orientation
reverse
complete
yes
method
Illumina
Options

Sequence

CGTGGGCTGA ATATCAGCAT CACGACGACT GCGAAGACCG ACGACGAAGC AAAGGCTCTG CTCGCCAGCT TCAAGTTCCC GTTCAGAAAC TGAGGTTACC GTGGCTAAAC TGGCACTGAT CGAACGTGAA AAGAAGCGCG CCCGCCTGGT CGCGAAGTTC GCAGCAAAGC GCGAAGCGCT GAAGGCGATC GTCGAAGACC AAAGCAAGTC GGAAGAAGAG CGCTACGAAG CACGCCTGGA GCTGCAGCAA CTGCCCCGCA ACTCGAACCC GACCCGCCAG CGTAACCGCT GCGCGATCAC GGGCCGTCCG CGTGGCACGT TCCGTAAATT CGGCCTCGCG CGCAACAAGA TTCGTGAAAT CGCATTCCGT GGCGAGATTC CTGGCCTGAC CAAGGCGAGC TGGTAATAGG AGAAACGTAA ATGAGCATGA GTGATCCTAT CGCCGATATG CTGACTCGCA TCCGCAACGC GCAGATGGTC GAGAAGGTAT CGGTCGCGAT GCCCTC

Translation


          R  G  L  N  I  S  I  T  T  T  A  K  T  D  D  E  A  K  A  L  L  A  S  F  K  F  P  F  R  N  *  G  Y  R   F1
           V  G  *  I  S  A  S  R  R  L  R  R  P  T  T  K  Q  R  L  C  S  P  A  S  S  S  R  S  E  T  E  V  T     F2
            W  A  E  Y  Q  H  H  D  D  C  E  D  R  R  R  S  K  G  S  A  R  Q  L  Q  V  P  V  Q  K  L  R  L  P    F3
        1 CGTGGGCTGAATATCAGCATCACGACGACTGCGAAGACCGACGACGAAGCAAAGGCTCTGCTCGCCAGCTTCAAGTTCCCGTTCAGAAACTGAGGTTACC 100
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            G  *  T  G  T  D  R  T  *  K  E  A  R  P  P  G  R  E  V  R  S  K  A  R  S  A  E  G  D  R  R  R  P    F1
          V  A  K  L  A  L  I  E  R  E  K  K  R  A  R  L  V  A  K  F  A  A  K  R  E  A  L  K  A  I  V  E  D  Q   F2
           W  L  N  W  H  *  S  N  V  K  R  S  A  P  A  W  S  R  S  S  Q  Q  S  A  K  R  *  R  R  S  S  K  T     F3
      101 GTGGCTAAACTGGCACTGATCGAACGTGAAAAGAAGCGCGCCCGCCTGGTCGCGAAGTTCGCAGCAAAGCGCGAAGCGCTGAAGGCGATCGTCGAAGACC 200
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           K  Q  V  G  R  R  A  L  R  S  T  P  G  A  A  A  T  A  P  Q  L  E  P  D  P  P  A  *  P  L  R  D  H     F1
            S  K  S  E  E  E  R  Y  E  A  R  L  E  L  Q  Q  L  P  R  N  S  N  P  T  R  Q  R  N  R  C  A  I  T    F2
          K  A  S  R  K  K  S  A  T  K  H  A  W  S  C  S  N  C  P  A  T  R  T  R  P  A  S  V  T  A  A  R  S  R   F3
      201 AAAGCAAGTCGGAAGAAGAGCGCTACGAAGCACGCCTGGAGCTGCAGCAACTGCCCCGCAACTCGAACCCGACCCGCCAGCGTAACCGCTGCGCGATCAC 300
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          G  P  S  A  W  H  V  P  *  I  R  P  R  A  Q  Q  D  S  *  N  R  I  P  W  R  D  S  W  P  D  Q  G  E  L   F1
           G  R  P  R  G  T  F  R  K  F  G  L  A  R  N  K  I  R  E  I  A  F  R  G  E  I  P  G  L  T  K  A  S     F2
            A  V  R  V  A  R  S  V  N  S  A  S  R  A  T  R  F  V  K  S  H  S  V  A  R  F  L  A  *  P  R  R  A    F3
      301 GGGCCGTCCGCGTGGCACGTTCCGTAAATTCGGCCTCGCGCGCAACAAGATTCGTGAAATCGCATTCCGTGGCGAGATTCCTGGCCTGACCAAGGCGAGC 400
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            V  I  G  E  T  *  M  S  M  S  D  P  I  A  D  M  L  T  R  I  R  N  A  Q  M  V  E  K  V  S  V  A  M    F1
          W  *  *  E  K  R  K  *  A  *  V  I  L  S  P  I  C  *  L  A  S  A  T  R  R  W  S  R  R  Y  R  S  R  C   F2
           G  N  R  R  N  V  N  E  H  E  *  S  Y  R  R  Y  A  D  S  H  P  Q  R  A  D  G  R  E  G  I  G  R  D     F3
      401 TGGTAATAGGAGAAACGTAAATGAGCATGAGTGATCCTATCGCCGATATGCTGACTCGCATCCGCAACGCGCAGATGGTCGAGAAGGTATCGGTCGCGAT 500
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           P  S                                                                                                  F1
            P  X                                                                                                 F2
          A  L                                                                                                   F3
      501 GCCCTC 506
          ----:-