BACT000013 (rpsM) allele sequence: id-72
Contig position
- sequence bin id
- 3332
- contig length
- 61718
- start
- 30334
- end
- 30699
- length
- 366
- orientation
- reverse
- complete
- yes
- method
- Illumina
Sequence
GCAAAGGCGT CGTTCGCGTG ATCTGCAGCT CGGATCCGCG CCACAAGCAG CGCCAAGGCT GACCGCGCGT TTGTTTGCGC TTTTTGTTTG AGGAAAAACA ATGGCTCGTA TCGCAGGGGT TAACATCCCG AATCACCAGC ATACCGAGAT CGGCCTGACG GCAATCTTCG GTATCGGCCG CACGCGCTCG CGCAGCATCT GCTCGGCAGC TGGCGTGGAA TTCTCGAAGA AGGTCAAGGA CCTGACCGAC GCAGACCTCG AAAAGCTGCG TGAGGAAGTG GGCAAGTTCA TCGTCGAAGG CGACCTGCGC CGTGAAGTGA CGATGAACAT CAAGCGCCTG ATGGACCTCG GTTGCTACCG TGGTGTTCGT CATCGCAAGG GCCTGCCGAT GCGTGGTCAG CGTACGCGTA CGAACGCACG TACCCGCAAG GGTCCGCGTC GTGCAGCGCA AGCGCTGAAG AAGTAAGCGG AACTGACAGT TACAGGAAAA CGTAATGGCT AAGGCTTCGA ACACCGCGGC GCAACGCGTT CGCAAGAAGG TCAAGAAGAA CGTCGCTGAA GGCGTG
Translation
A K A S F A * S A A R I R A T S S A K A D R A F V C A F C L R K N N F1
Q R R R S R D L Q L G S A P Q A A P R L T A R L F A L F V * G K T F2
K G V V R V I C S S D P R H K Q R Q G * P R V C L R F L F E E K Q F3
1 GCAAAGGCGTCGTTCGCGTGATCTGCAGCTCGGATCCGCGCCACAAGCAGCGCCAAGGCTGACCGCGCGTTTGTTTGCGCTTTTTGTTTGAGGAAAAACA 100
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G S Y R R G * H P E S P A Y R D R P D G N L R Y R P H A L A Q H L F1
M A R I A G V N I P N H Q H T E I G L T A I F G I G R T R S R S I C F2
W L V S Q G L T S R I T S I P R S A * R Q S S V S A A R A R A A S F3
101 ATGGCTCGTATCGCAGGGGTTAACATCCCGAATCACCAGCATACCGAGATCGGCCTGACGGCAATCTTCGGTATCGGCCGCACGCGCTCGCGCAGCATCT 200
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L G S W R G I L E E G Q G P D R R R P R K A A * G S G Q V H R R R F1
S A A G V E F S K K V K D L T D A D L E K L R E E V G K F I V E G F2
A R Q L A W N S R R R S R T * P T Q T S K S C V R K W A S S S S K A F3
201 GCTCGGCAGCTGGCGTGGAATTCTCGAAGAAGGTCAAGGACCTGACCGACGCAGACCTCGAAAAGCTGCGTGAGGAAGTGGGCAAGTTCATCGTCGAAGG 300
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R P A P * S D D E H Q A P D G P R L L P W C S S S Q G P A D A W S A F1
D L R R E V T M N I K R L M D L G C Y R G V R H R K G L P M R G Q F2
T C A V K * R * T S S A * W T S V A T V V F V I A R A C R C V V S F3
301 CGACCTGCGCCGTGAAGTGACGATGAACATCAAGCGCCTGATGGACCTCGGTTGCTACCGTGGTGTTCGTCATCGCAAGGGCCTGCCGATGCGTGGTCAG 400
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Y A Y E R T Y P Q G S A S C S A S A E E V S G T D S Y R K T * W L F1
R T R T N A R T R K G P R R A A Q A L K K * A E L T V T G K R N G * F2
V R V R T H V P A R V R V V Q R K R * R S K R N * Q L Q E N V M A F3
401 CGTACGCGTACGAACGCACGTACCCGCAAGGGTCCGCGTCGTGCAGCGCAAGCGCTGAAGAAGTAAGCGGAACTGACAGTTACAGGAAAACGTAATGGCT 500
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R L R T P R R N A F A R R S R R T S L K A X F1
G F E H R G A T R S Q E G Q E E R R * R R X F2
K A S N T A A Q R V R K K V K K N V A E G V F3
501 AAGGCTTCGAACACCGCGGCGCAACGCGTTCGCAAGAAGGTCAAGAAGAACGTCGCTGAAGGCGTG 566
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