BACT000012 (rpsL) allele sequence: id-72
Contig position
- sequence bin id
- 3332
- contig length
- 61718
- start
- 46506
- end
- 46886
- length
- 381
- orientation
- reverse
- complete
- yes
- method
- Illumina
Sequence
AGGTTCGTGC CCGTATCGCC GGTTCGGAAG TCAACTGTGC GCCGATTTTC GCTTTGCCCG AAATCGGTGT GCAGATTTTG TTCAATTTCA GGAATAAACA ATGCCAACCA TCAACCAACT GGTTCGCAAA GGCCGTCAGT CGGAAACGAC GAAGAGCAAG AGCCCGGCCC TGCAGGACTG CCCCCAGCGT CGCGGCGTGT GCACCCGTGT GTACACGACG ACGCCGAAGA AGCCGAACTC GGCACTCCGT AAGGTTGCCA AGGTTCGTCT GACGAACGGC TTCGAAGTGA TTTCGTACAT CGGCGGTGAA GGCCACAACC TGCAGGAACA CTCGGTTGTG CTGATCCGCG GCGGCCGTGT GAAGGACTTG CCGGGTGTGC GTTACCACAT GGTTCGCGGC TCGCTGGATA CCCAGGGCGT CAAGGACCGT AAGCAAGCGC GCTCGAAGTA CGGCGCGAAG CGTGCAAAGG CTGCCAAGTA AGCAGTTTTT GATCAGGGAT CGCCGCAGGG CGGTCAAGGC GGGAGTGCCG GATTGCCGGT GCTGTCGAGT AAGTGGTCAC CCGGCCAAGC TGGTTAGTCG T
Translation
R F V P V S P V R K S T V R R F S L C P K S V C R F C S I S G I N N F1
G S C P Y R R F G S Q L C A D F R F A R N R C A D F V Q F Q E * T F2
V R A R I A G S E V N C A P I F A L P E I G V Q I L F N F R N K Q F3
1 AGGTTCGTGCCCGTATCGCCGGTTCGGAAGTCAACTGTGCGCCGATTTTCGCTTTGCCCGAAATCGGTGTGCAGATTTTGTTCAATTTCAGGAATAAACA 100
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A N H Q P T G S Q R P S V G N D E E Q E P G P A G L P P A S R R V F1
M P T I N Q L V R K G R Q S E T T K S K S P A L Q D C P Q R R G V C F2
C Q P S T N W F A K A V S R K R R R A R A R P C R T A P S V A A C F3
101 ATGCCAACCATCAACCAACTGGTTCGCAAAGGCCGTCAGTCGGAAACGACGAAGAGCAAGAGCCCGGCCCTGCAGGACTGCCCCCAGCGTCGCGGCGTGT 200
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H P C V H D D A E E A E L G T P * G C Q G S S D E R L R S D F V H F1
T R V Y T T T P K K P N S A L R K V A K V R L T N G F E V I S Y I F2
A P V C T R R R R R S R T R H S V R L P R F V * R T A S K * F R T S F3
201 GCACCCGTGTGTACACGACGACGCCGAAGAAGCCGAACTCGGCACTCCGTAAGGTTGCCAAGGTTCGTCTGACGAACGGCTTCGAAGTGATTTCGTACAT 300
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R R * R P Q P A G T L G C A D P R R P C E G L A G C A L P H G S R L F1
G G E G H N L Q E H S V V L I R G G R V K D L P G V R Y H M V R G F2
A V K A T T C R N T R L C * S A A A V * R T C R V C V T T W F A A F3
301 CGGCGGTGAAGGCCACAACCTGCAGGAACACTCGGTTGTGCTGATCCGCGGCGGCCGTGTGAAGGACTTGCCGGGTGTGCGTTACCACATGGTTCGCGGC 400
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A G Y P G R Q G P * A S A L E V R R E A C K G C Q V S S F * S G I F1
S L D T Q G V K D R K Q A R S K Y G A K R A K A A K * A V F D Q G S F2
R W I P R A S R T V S K R A R S T A R S V Q R L P S K Q F L I R D F3
401 TCGCTGGATACCCAGGGCGTCAAGGACCGTAAGCAAGCGCGCTCGAAGTACGGCGCGAAGCGTGCAAAGGCTGCCAAGTAAGCAGTTTTTGATCAGGGAT 500
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A A G R S R R E C R I A G A V E * V V T R P S W L V V F1
P Q G G Q G G S A G L P V L S S K W S P G Q A G * S X F2
R R R A V K A G V P D C R C C R V S G H P A K L V S R F3
501 CGCCGCAGGGCGGTCAAGGCGGGAGTGCCGGATTGCCGGTGCTGTCGAGTAAGTGGTCACCCGGCCAAGCTGGTTAGTCGT 581
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