BACT000011 (rpsK) allele sequence: id-72
Contig position
- sequence bin id
- 3332
- contig length
- 61718
- start
- 29904
- end
- 30305
- length
- 402
- orientation
- reverse
- complete
- yes
- method
- Illumina
Sequence
GGTCAGCGTA CGCGTACGAA CGCACGTACC CGCAAGGGTC CGCGTCGTGC AGCGCAAGCG CTGAAGAAGT AAGCGGAACT GACAGTTACA GGAAAACGTA ATGGCTAAGG CTTCGAACAC CGCGGCGCAA CGCGTTCGCA AGAAGGTCAA GAAGAACGTC GCTGAAGGCG TGGTGCACGT TCACGCGTCG TTCAACAACA CGATCATCAC GATCACCGAT CGTCAGGGCA ATGCTCTGGC ATGGGCGACG TCGGGCGGCC AGGGCTTCAA GGGCTCGCGC AAGTCGACGC CGTTCGCTGC TCAGGTTGCT GCTGAGTCGG CCGGTCGTGT GGCGATGGAA TATGGCGTGA AGAATCTGGA AGTGCGGATC AAGGGCCCGG GCCCGGGTCG TGAGTCGGCA GTGCGCGCAC TGCACGGCCT CGGCATCAAG ATCACCGCGA TTTCGGACGT CACCCCGATT CCGCACAACG GCTGCCGTCC GCCGAAGCGC CGTCGTATCT AAGAATGCTG CTGGCACGTT CGTGCTGGCG CATTGCCTGT CGTCGCATAG CGCCGACGGG CGTTGCTTTT TTGATTGACT AAGCCCACCG TTCGCCCCAA AG
Translation
G Q R T R T N A R T R K G P R R A A Q A L K K * A E L T V T G K R N F1
V S V R V R T H V P A R V R V V Q R K R * R S K R N * Q L Q E N V F2
S A Y A Y E R T Y P Q G S A S C S A S A E E V S G T D S Y R K T * F3
1 GGTCAGCGTACGCGTACGAACGCACGTACCCGCAAGGGTCCGCGTCGTGCAGCGCAAGCGCTGAAGAAGTAAGCGGAACTGACAGTTACAGGAAAACGTA 100
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
G * G F E H R G A T R S Q E G Q E E R R * R R G A R S R V V Q Q H F1
M A K A S N T A A Q R V R K K V K K N V A E G V V H V H A S F N N T F2
W L R L R T P R R N A F A R R S R R T S L K A W C T F T R R S T T F3
101 ATGGCTAAGGCTTCGAACACCGCGGCGCAACGCGTTCGCAAGAAGGTCAAGAAGAACGTCGCTGAAGGCGTGGTGCACGTTCACGCGTCGTTCAACAACA 200
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
D H H D H R S S G Q C S G M G D V G R P G L Q G L A Q V D A V R C F1
I I T I T D R Q G N A L A W A T S G G Q G F K G S R K S T P F A A F2
R S S R S P I V R A M L W H G R R R A A R A S R A R A S R R R S L L F3
201 CGATCATCACGATCACCGATCGTCAGGGCAATGCTCTGGCATGGGCGACGTCGGGCGGCCAGGGCTTCAAGGGCTCGCGCAAGTCGACGCCGTTCGCTGC 300
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
S G C C * V G R S C G D G I W R E E S G S A D Q G P G P G S * V G S F1
Q V A A E S A G R V A M E Y G V K N L E V R I K G P G P G R E S A F2
R L L L S R P V V W R W N M A * R I W K C G S R A R A R V V S R Q F3
301 TCAGGTTGCTGCTGAGTCGGCCGGTCGTGTGGCGATGGAATATGGCGTGAAGAATCTGGAAGTGCGGATCAAGGGCCCGGGCCCGGGTCGTGAGTCGGCA 400
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
A R T A R P R H Q D H R D F G R H P D S A Q R L P S A E A P S Y L F1
V R A L H G L G I K I T A I S D V T P I P H N G C R P P K R R R I * F2
C A H C T A S A S R S P R F R T S P R F R T T A A V R R S A V V S F3
401 GTGCGCGCACTGCACGGCCTCGGCATCAAGATCACCGCGATTTCGGACGTCACCCCGATTCCGCACAACGGCTGCCGTCCGCCGAAGCGCCGTCGTATCT 500
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
R M L L A R S C W R I A C R R I A P T G V A F L I D * A H R S P Q F1
E C C W H V R A G A L P V V A * R R R A L L F * L T K P T V R P K F2
K N A A G T F V L A H C L S S H S A D G R C F F D * L S P P F A P K F3
501 AAGAATGCTGCTGGCACGTTCGTGCTGGCGCATTGCCTGTCGTCGCATAGCGCCGACGGGCGTTGCTTTTTTGATTGACTAAGCCCACCGTTCGCCCCAA 600
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
X F1
X F2
F3
601 AG 602
--