BACT000010 (rpsJ) allele sequence: id-72
Contig position
- sequence bin id
- 3332
- contig length
- 61718
- start
- 41812
- end
- 42123
- length
- 312
- orientation
- reverse
- complete
- yes
- method
- Illumina
Sequence
CCGTTCGGGA CGTGTCGCCT CGCTCCCCGC AGGCAACAGG TCTCGCGTTC TTTTAGTGTC CGGCGATGCA AGATCGCCTC GCTCTTTTCA AGGAATCGTC ATGCAGCAAC AGAAAATCCG CATTCGCCTG AAGGCTTTCG ACTATCGTCT GATCGATCAA TCGGCTGCCG AAATCGTCGA TACCGCGAAG CGGACTGGCG CAATCGTCCG TGGCCCGGTG CCGCTGCCGA CGCGCATTCA GCGTTTTGAC ATTCTGCGTT CGCCGCACGT CAACAAGACG TCGCGCGATC AGCTCGAAAT CCGTACCCAC CAGCGCCTGA TGGACATCGT CGACCCGACG GACAAGACGG TTGACGCGCT GATGAAGCTC GATCTGCCGG CAGGCGTCGA CGTGGAAATC AAGCTGCAGT AAGGCTTCCG GCGCCGCCGG GCTTGCCGGG CGGTGCTAAG TCTTTGTATT GCTTGCGGAA ATCGAAGGGT CGGGCTATAC TGCTTGGCTT TTCGCGCATT CG
Translation
P F G T C R L A P R R Q Q V S R S F S V R R C K I A S L F S R N R H F1
R S G R V A S L P A G N R S R V L L V S G D A R S P R S F Q G I V F2
V R D V S P R S P Q A T G L A F F * C P A M Q D R L A L F K E S S F3
1 CCGTTCGGGACGTGTCGCCTCGCTCCCCGCAGGCAACAGGTCTCGCGTTCTTTTAGTGTCCGGCGATGCAAGATCGCCTCGCTCTTTTCAAGGAATCGTC 100
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
A A T E N P H S P E G F R L S S D R S I G C R N R R Y R E A D W R F1
M Q Q Q K I R I R L K A F D Y R L I D Q S A A E I V D T A K R T G A F2
C S N R K S A F A * R L S T I V * S I N R L P K S S I P R S G L A F3
101 ATGCAGCAACAGAAAATCCGCATTCGCCTGAAGGCTTTCGACTATCGTCTGATCGATCAATCGGCTGCCGAAATCGTCGATACCGCGAAGCGGACTGGCG 200
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
N R P W P G A A A D A H S A F * H S A F A A R Q Q D V A R S A R N F1
I V R G P V P L P T R I Q R F D I L R S P H V N K T S R D Q L E I F2
Q S S V A R C R C R R A F S V L T F C V R R T S T R R R A I S S K S F3
201 CAATCGTCCGTGGCCCGGTGCCGCTGCCGACGCGCATTCAGCGTTTTGACATTCTGCGTTCGCCGCACGTCAACAAGACGTCGCGCGATCAGCTCGAAAT 300
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
P Y P P A P D G H R R P D G Q D G * R A D E A R S A G R R R R G N Q F1
R T H Q R L M D I V D P T D K T V D A L M K L D L P A G V D V E I F2
V P T S A * W T S S T R R T R R L T R * * S S I C R Q A S T W K S F3
301 CCGTACCCACCAGCGCCTGATGGACATCGTCGACCCGACGGACAAGACGGTTGACGCGCTGATGAAGCTCGATCTGCCGGCAGGCGTCGACGTGGAAATC 400
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
A A V R L P A P P G L P G G A K S L Y C L R K S K G R A I L L G F F1
K L Q * G F R R R R A C R A V L S L C I A C G N R R V G L Y C L A F F2
S C S K A S G A A G L A G R C * V F V L L A E I E G S G Y T A W L F3
401 AAGCTGCAGTAAGGCTTCCGGCGCCGCCGGGCTTGCCGGGCGGTGCTAAGTCTTTGTATTGCTTGCGGAAATCGAAGGGTCGGGCTATACTGCTTGGCTT 500
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
S R I R F1
R A F X F2
F A H S F3
501 TTCGCGCATTCG 512
----:----|--