BACT000009 (rpsI) allele sequence: id-72
Contig position
- sequence bin id
- 3356
- contig length
- 316436
- start
- 139457
- end
- 139849
- length
- 393
- orientation
- forward
- complete
- yes
- method
- Illumina
Sequence
TCGGCTACGC GATGATCAAG AAGCTGAAGG TCTACGCAGA AGCGACGCAT CCGCACTCGG CTCAACAGCC GAAGGCGCTC GAGATCTAAG GGGAGCCCAC ATGATCGGTA ACTGGAACTA CGGTACGGGC CGCCGCAAGA GCGCAGTCGC ACGTGTCTTC ATCAAGGCTG GCAAGGGCGA CATCATCGTC AACGGCAAGC CCATCGCCGA CTACTTCTCG CGCGAAACGT CGCTGATGAT CGTGCGTCAA CCGCTGGAAC TCACGAACCA CGGCCAGACG TTCGACATCA AGGTCAACGT CAACGGCGGC GGTGAAACGG GTCAGGCAGG CGCAGTGCGT CACGGCATCA CCCGTGCACT GATCGACTAC GATGCGACGC TCAAGCCGTC GCTGTCGAAC GCAGGCTTCG TCACGCGCGA TGCGCGTGAA GTCGAGCGTA AGAAGGTCGG TCTGCGCAAG GCACGCCGCG CAAAGCAGTT CTCGAAGCGT TAATTCTGCT TCATGGCCAC GCCGCTTTCG GGCGGTGTCC GCCGAAAAAA CCGCCAGCTT TCACGCTGGC GGTTTTTTTA TGCCCGCTCG ACGCGGGTGC CCA
Translation
S A T R * S R S * R S T Q K R R I R T R L N S R R R S R S K G S P H F1
R L R D D Q E A E G L R R S D A S A L G S T A E G A R D L R G A H F2
G Y A M I K K L K V Y A E A T H P H S A Q Q P K A L E I * G E P T F3
1 TCGGCTACGCGATGATCAAGAAGCTGAAGGTCTACGCAGAAGCGACGCATCCGCACTCGGCTCAACAGCCGAAGGCGCTCGAGATCTAAGGGGAGCCCAC 100
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D R * L E L R Y G P P Q E R S R T C L H Q G W Q G R H H R Q R Q A F1
M I G N W N Y G T G R R K S A V A R V F I K A G K G D I I V N G K P F2
* S V T G T T V R A A A R A Q S H V S S S R L A R A T S S S T A S F3
101 ATGATCGGTAACTGGAACTACGGTACGGGCCGCCGCAAGAGCGCAGTCGCACGTGTCTTCATCAAGGCTGGCAAGGGCGACATCATCGTCAACGGCAAGC 200
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H R R L L L A R N V A D D R A S T A G T H E P R P D V R H Q G Q R F1
I A D Y F S R E T S L M I V R Q P L E L T N H G Q T F D I K V N V F2
P S P T T S R A K R R * * S C V N R W N S R T T A R R S T S R S T S F3
201 CCATCGCCGACTACTTCTCGCGCGAAACGTCGCTGATGATCGTGCGTCAACCGCTGGAACTCACGAACCACGGCCAGACGTTCGACATCAAGGTCAACGT 300
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Q R R R * N G S G R R S A S R H H P C T D R L R C D A Q A V A V E R F1
N G G G E T G Q A G A V R H G I T R A L I D Y D A T L K P S L S N F2
T A A V K R V R Q A Q C V T A S P V H * S T T M R R S S R R C R T F3
301 CAACGGCGGCGGTGAAACGGGTCAGGCAGGCGCAGTGCGTCACGGCATCACCCGTGCACTGATCGACTACGATGCGACGCTCAAGCCGTCGCTGTCGAAC 400
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R L R H A R C A * S R A * E G R S A Q G T P R K A V L E A L I L L F1
A G F V T R D A R E V E R K K V G L R K A R R A K Q F S K R * F C F F2
Q A S S R A M R V K S S V R R S V C A R H A A Q S S S R S V N S A F3
401 GCAGGCTTCGTCACGCGCGATGCGCGTGAAGTCGAGCGTAAGAAGGTCGGTCTGCGCAAGGCACGCCGCGCAAAGCAGTTCTCGAAGCGTTAATTCTGCT 500
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H G H A A F G R C P P K K P P A F T L A V F L C P L D A G A X F1
M A T P L S G G V R R K N R Q L S R W R F F Y A R S T R V P X F2
S W P R R F R A V S A E K T A S F H A G G F F M P A R R G C P F3
501 TCATGGCCACGCCGCTTTCGGGCGGTGTCCGCCGAAAAAACCGCCAGCTTTCACGCTGGCGGTTTTTTTATGCCCGCTCGACGCGGGTGCCCA 593
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