BACT000008 (rpsH) allele sequence: id-72
Contig position
- sequence bin id
- 3332
- contig length
- 61718
- start
- 34615
- end
- 35010
- length
- 396
- orientation
- reverse
- complete
- yes
- method
- Illumina
Sequence
TCCGTAAATT CGGCCTCGCG CGCAACAAGA TTCGTGAAAT CGCATTCCGT GGCGAGATTC CTGGCCTGAC CAAGGCGAGC TGGTAATAGG AGAAACGTAA ATGAGCATGA GTGATCCTAT CGCCGATATG CTGACTCGCA TCCGCAACGC GCAGATGGTC GAGAAGGTAT CGGTCGCGAT GCCCTCGTCG AAGGTCAAGG TTGCAATCGC GCAAGTCCTG AAGGACGAAG GTTATATCGA CGATTTCGCC GTGAAGGCGG AAGGTGCGAA GTCCGAACTG AATATCGCGC TGAAGTACTA CGCAGGTCGC CCGGTCATCG AACGCCTCGA GCGCGTGTCG AAGCCTGGTC TGCGCGTGTA CCGCGGTCGT AACGACATTC CGCAGGTCAT GAACGGCCTG GGCGTGGCAA TCGTTTCGAC GCCGAAGGGC GTGATGACCG ACCGCAAGGC GCGCGCTACC GGCGTCGGCG GCGAAGTCAT CTGCTACGTC GCTTAAAGCC GAGGAGAGAG AAACATGTCT CGAGTAGGTA AGAGCCCGAT CGCGCTGCAA GGCGCGGAAG TCAAGCTGGC CGACGGTGCG ATCACCGTCA AGGGCC
Translation
S V N S A S R A T R F V K S H S V A R F L A * P R R A G N R R N V N F1
P * I R P R A Q Q D S * N R I P W R D S W P D Q G E L V I G E T * F2
R K F G L A R N K I R E I A F R G E I P G L T K A S W * * E K R K F3
1 TCCGTAAATTCGGCCTCGCGCGCAACAAGATTCGTGAAATCGCATTCCGTGGCGAGATTCCTGGCCTGACCAAGGCGAGCTGGTAATAGGAGAAACGTAA 100
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E H E * S Y R R Y A D S H P Q R A D G R E G I G R D A L V E G Q G F1
M S M S D P I A D M L T R I R N A Q M V E K V S V A M P S S K V K V F2
* A * V I L S P I C * L A S A T R R W S R R Y R S R C P R R R S R F3
101 ATGAGCATGAGTGATCCTATCGCCGATATGCTGACTCGCATCCGCAACGCGCAGATGGTCGAGAAGGTATCGGTCGCGATGCCCTCGTCGAAGGTCAAGG 200
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C N R A S P E G R R L Y R R F R R E G G R C E V R T E Y R A E V L F1
A I A Q V L K D E G Y I D D F A V K A E G A K S E L N I A L K Y Y F2
L Q S R K S * R T K V I S T I S P * R R K V R S P N * I S R * S T T F3
201 TTGCAATCGCGCAAGTCCTGAAGGACGAAGGTTATATCGACGATTTCGCCGTGAAGGCGGAAGGTGCGAAGTCCGAACTGAATATCGCGCTGAAGTACTA 300
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R R S P G H R T P R A R V E A W S A R V P R S * R H S A G H E R P G F1
A G R P V I E R L E R V S K P G L R V Y R G R N D I P Q V M N G L F2
Q V A R S S N A S S A C R S L V C A C T A V V T T F R R S * T A W F3
301 CGCAGGTCGCCCGGTCATCGAACGCCTCGAGCGCGTGTCGAAGCCTGGTCTGCGCGTGTACCGCGGTCGTAACGACATTCCGCAGGTCATGAACGGCCTG 400
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R G N R F D A E G R D D R P Q G A R Y R R R R R S H L L R R L K P F1
G V A I V S T P K G V M T D R K A R A T G V G G E V I C Y V A * S R F2
A W Q S F R R R R A * * P T A R R A L P A S A A K S S A T S L K A F3
401 GGCGTGGCAATCGTTTCGACGCCGAAGGGCGTGATGACCGACCGCAAGGCGCGCGCTACCGGCGTCGGCGGCGAAGTCATCTGCTACGTCGCTTAAAGCC 500
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R R E K H V S S R * E P D R A A R R G S Q A G R R C D H R Q G P F1
G E R N M S R V G K S P I A L Q G A E V K L A D G A I T V K G X F2
E E R E T C L E * V R A R S R C K A R K S S W P T V R S P S R A F3
501 GAGGAGAGAGAAACATGTCTCGAGTAGGTAAGAGCCCGATCGCGCTGCAAGGCGCGGAAGTCAAGCTGGCCGACGGTGCGATCACCGTCAAGGGCC 596
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