BACT000007 (rpsG) allele sequence: id-72
Contig position
- sequence bin id
- 3332
- contig length
- 61718
- start
- 45863
- end
- 46333
- length
- 471
- orientation
- reverse
- complete
- yes
- method
- Illumina
Sequence
TGGTCACCCG GCCAAGCTGG TTAGTCGTGA AGATGTGATC GGGTTTGTTG GTGGCCGCGG AGCTGGATGC AGCTCCAACT GAACAGGTAA AGGAAGAATC ATGCCGCGTC GTCGCGAAGT CCCCAAGCGG GAAGTGTTGC CGGATCCGAA GTTCGGCAAC GTTGATGTAG CCAAGTTCAT GAACATGCTG ATGCTGTCCG GCAAGAAGTC GGTTGCAGAA CGCATCGTTT ATGGCGCATT CGAACAGATC CAGACCAAGG GTGGCAAGGA CCCGCTGGAA GTGTTCACCG TTGCGCTCAA CAACGTGAAG CCGGTGGTCG AAGTGAAGAG CCGCCGCGTT GGTGGTGCCA ACTATCAAGT TCCGGTCGAA GTGCGCCCGT CGCGTCGTAT GGCATTGGCG ATGCGCTGGC TGCGTGAGGC TGCGAAGAAG CGCAGCGAGA AGTCGATGGC TCTGCGTCTG GCAGGCGAAC TCTCCGAAGC GGCCGAAGGC CGTGGCGGCG CGATGAAGAA GCGCGATGAA GTTCACCGCA TGGCAGAAGC CAACCGCGCG TTCTCGCATT TCCGTTTCTA AGCGCCTGGC TGGGCTGTAG CGGAAATAAA TTCCGGGCGG GTGCGCTTTT CAGGCGCCTC GCCCGTTTGT GTTGAGGCGT GATGCAGCAG GGCTGCGTCA C
Translation
W S P G Q A G * S * R C D R V C W W P R S W M Q L Q L N R * R K N H F1
G H P A K L V S R E D V I G F V G G R G A G C S S N * T G K G R I F2
V T R P S W L V V K M * S G L L V A A E L D A A P T E Q V K E E S F3
1 TGGTCACCCGGCCAAGCTGGTTAGTCGTGAAGATGTGATCGGGTTTGTTGGTGGCCGCGGAGCTGGATGCAGCTCCAACTGAACAGGTAAAGGAAGAATC 100
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A A S S R S P Q A G S V A G S E V R Q R * C S Q V H E H A D A V R F1
M P R R R E V P K R E V L P D P K F G N V D V A K F M N M L M L S G F2
C R V V A K S P S G K C C R I R S S A T L M * P S S * T C * C C P F3
101 ATGCCGCGTCGTCGCGAAGTCCCCAAGCGGGAAGTGTTGCCGGATCCGAAGTTCGGCAACGTTGATGTAGCCAAGTTCATGAACATGCTGATGCTGTCCG 200
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Q E V G C R T H R L W R I R T D P D Q G W Q G P A G S V H R C A Q F1
K K S V A E R I V Y G A F E Q I Q T K G G K D P L E V F T V A L N F2
A R S R L Q N A S F M A H S N R S R P R V A R T R W K C S P L R S T F3
201 GCAAGAAGTCGGTTGCAGAACGCATCGTTTATGGCGCATTCGAACAGATCCAGACCAAGGGTGGCAAGGACCCGCTGGAAGTGTTCACCGTTGCGCTCAA 300
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Q R E A G G R S E E P P R W W C Q L S S S G R S A P V A S Y G I G D F1
N V K P V V E V K S R R V G G A N Y Q V P V E V R P S R R M A L A F2
T * S R W S K * R A A A L V V P T I K F R S K C A R R V V W H W R F3
301 CAACGTGAAGCCGGTGGTCGAAGTGAAGAGCCGCCGCGTTGGTGGTGCCAACTATCAAGTTCCGGTCGAAGTGCGCCCGTCGCGTCGTATGGCATTGGCG 400
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A L A A * G C E E A Q R E V D G S A S G R R T L R S G R R P W R R F1
M R W L R E A A K K R S E K S M A L R L A G E L S E A A E G R G G A F2
C A G C V R L R R S A A R S R W L C V W Q A N S P K R P K A V A A F3
401 ATGCGCTGGCTGCGTGAGGCTGCGAAGAAGCGCAGCGAGAAGTCGATGGCTCTGCGTCTGGCAGGCGAACTCTCCGAAGCGGCCGAAGGCCGTGGCGGCG 500
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D E E A R * S S P H G R S Q P R V L A F P F L S A W L G C S G N K F1
M K K R D E V H R M A E A N R A F S H F R F * A P G W A V A E I N F2
R * R S A M K F T A W Q K P T A R S R I S V S K R L A G L * R K * I F3
501 CGATGAAGAAGCGCGATGAAGTTCACCGCATGGCAGAAGCCAACCGCGCGTTCTCGCATTTCCGTTTCTAAGCGCCTGGCTGGGCTGTAGCGGAAATAAA 600
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F R A G A L F R R L A R L C * G V M Q Q G C V T F1
S G R V R F S G A S P V C V E A * C S R A A S X F2
P G G C A F Q A P R P F V L R R D A A G L R H F3
601 TTCCGGGCGGGTGCGCTTTTCAGGCGCCTCGCCCGTTTGTGTTGAGGCGTGATGCAGCAGGGCTGCGTCAC 671
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