BACT000006 (rpsF) allele sequence: id-72
Contig position
- sequence bin id
- 3376
- contig length
- 227887
- start
- 154220
- end
- 154594
- length
- 375
- orientation
- reverse
- complete
- yes
- method
- Illumina
Sequence
CGGTGTTGCA TGCGGCCCGT ATCCGGGTTA GAATCTTCGG CTTCTCACTT GCCACACCGG TTCAGACGCC CGGGTGGCTT CAATCCACAA GGAGTGTGTA ATGCGTCATT ACGAAATCGT ATTCATCGTG CACCCGGATC AGAGCGAGCA AGTGCCCGCG ATGATCGAGC GTTACAAGAC CACGATCACG ACGCACGGCG GCCAGATCCA CCGTGTCGAA GACTGGGGCC GTCGCCAGCT GGCCTACATG ATCGAGAAAC TCGCGAAGGC TCACTACGTC TGCATGAACA TCGAGTGCGA CCAGACGACG CTCGACGAAC TCGAACACGC GTTCAAGTTC AACGACGCCG TGCTGCGCCA CCTCATCGTC AAGATGAAGA AGGCCGAAAC CGGCCCGTCG CCGATGATGA AGGAAGTTCA GCGCGAAGAA GCCAAGAAGG CGGCTGCAGC TCAGCCGACC GAAGCGCAGG CTTAAGTTCG TCACTCATTA AGCCATCAAG GAGCGCGCCC CTCACGTGAA CAGGTTGCAA TTGACGGCGA GCGTCGTCGA ACGCGCACCG GTGCGATATA CGCCG
Translation
R C C M R P V S G L E S S A S H L P H R F R R P G G F N P Q G V C N F1
G V A C G P Y P G * N L R L L T C H T G S D A R V A S I H K E C V F2
V L H A A R I R V R I F G F S L A T P V Q T P G W L Q S T R S V * F3
1 CGGTGTTGCATGCGGCCCGTATCCGGGTTAGAATCTTCGGCTTCTCACTTGCCACACCGGTTCAGACGCCCGGGTGGCTTCAATCCACAAGGAGTGTGTA 100
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A S L R N R I H R A P G S E R A S A R D D R A L Q D H D H D A R R F1
M R H Y E I V F I V H P D Q S E Q V P A M I E R Y K T T I T T H G G F2
C V I T K S Y S S C T R I R A S K C P R * S S V T R P R S R R T A F3
101 ATGCGTCATTACGAAATCGTATTCATCGTGCACCCGGATCAGAGCGAGCAAGTGCCCGCGATGATCGAGCGTTACAAGACCACGATCACGACGCACGGCG 200
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P D P P C R R L G P S P A G L H D R E T R E G S L R L H E H R V R F1
Q I H R V E D W G R R Q L A Y M I E K L A K A H Y V C M N I E C D F2
A R S T V S K T G A V A S W P T * S R N S R R L T T S A * T S S A T F3
201 GCCAGATCCACCGTGTCGAAGACTGGGGCCGTCGCCAGCTGGCCTACATGATCGAGAAACTCGCGAAGGCTCACTACGTCTGCATGAACATCGAGTGCGA 300
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P D D A R R T R T R V Q V Q R R R A A P P H R Q D E E G R N R P V A F1
Q T T L D E L E H A F K F N D A V L R H L I V K M K K A E T G P S F2
R R R S T N S N T R S S S T T P C C A T S S S R * R R P K P A R R F3
301 CCAGACGACGCTCGACGAACTCGAACACGCGTTCAAGTTCAACGACGCCGTGCTGCGCCACCTCATCGTCAAGATGAAGAAGGCCGAAACCGGCCCGTCG 400
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D D E G S S A R R S Q E G G C S S A D R S A G L S S S L I K P S R F1
P M M K E V Q R E E A K K A A A A Q P T E A Q A * V R H S L S H Q G F2
R * * R K F S A K K P R R R L Q L S R P K R R L K F V T H * A I K F3
401 CCGATGATGAAGGAAGTTCAGCGCGAAGAAGCCAAGAAGGCGGCTGCAGCTCAGCCGACCGAAGCGCAGGCTTAAGTTCGTCACTCATTAAGCCATCAAG 500
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S A P L T * T G C N * R R A S S N A H R C D I R R F1
A R P S R E Q V A I D G E R R R T R T G A I Y A X F2
E R A P H V N R L Q L T A S V V E R A P V R Y T P F3
501 GAGCGCGCCCCTCACGTGAACAGGTTGCAATTGACGGCGAGCGTCGTCGAACGCGCACCGGTGCGATATACGCCG 575
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