BACT000005 (rpsE) allele sequence: id-72
Contig position
- sequence bin id
- 3332
- contig length
- 61718
- start
- 33154
- end
- 33672
- length
- 519
- orientation
- reverse
- complete
- yes
- method
- Illumina
Sequence
CGCCTTCGAC CGCTCGGGCT TCCGCTACCA CGGCCGCGTC AAGGCGCTGG CTGAGGCAGC TCGCGAAGCT GGGCTCAAGT TCTAAGGGAA GGAATTCGTC ATGGCAAAGA TGCAAGCGAA AGTTCAGGCT GACGAACGCG ACGACGGCCT TCGCGAAAAG ATGATTTCGG TCAATCGCGT GACCAAGGTC GTGAAGGGTG GCCGTATTCT CGGCTTCGCC GCACTGACCG TGGTCGGCGA TGGTGATGGC CGCATCGGTA TGGGCAAGGG CAAGGCGAAG GAAGTGCCGG TCGCTGTCCA GAAGGCAATG GAACAGGCTC GCCGCAACAT GTTCAAGGTG CCGCTCAAGA ACGGCACGCT GCAGCACGAA GTGCACGGCA AGCATGGCGC ATCCGCAGTC CTCCTCGCTC CGGCGAAGGC AGGTACGGGC GTGATCGCCG GCGGCCCGAT GCGCGCAGTG TTCGACGTGA TGGGCGTGCA GAACGTCGTG GCGAAGAGCC ACGGTTCGAC GAACCCGTAC AACCTCGTTC GCGCCACGCT GGACGGTCTG CGCAAGCAGT CGACCCCGGC AGACATCGCG GCGAAGCGCG GCAAGTCCGT CGAAGATATT TTGGGCTAAG CCCGGGTGGT CACCATGTCT GAAAAAACTG TCAAGGTTCA GCTCGTGAAG AGCCTGATCG GGACCCGCGA ATCGCACCGT GCGACCGTGC GTGGCCTGG
Translation
R L R P L G L P L P R P R Q G A G * G S S R S W A Q V L R E G I R H F1
A F D R S G F R Y H G R V K A L A E A A R E A G L K F * G K E F V F2
P S T A R A S A T T A A S R R W L R Q L A K L G S S S K G R N S S F3
1 CGCCTTCGACCGCTCGGGCTTCCGCTACCACGGCCGCGTCAAGGCGCTGGCTGAGGCAGCTCGCGAAGCTGGGCTCAAGTTCTAAGGGAAGGAATTCGTC 100
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G K D A S E S S G * R T R R R P S R K D D F G Q S R D Q G R E G W F1
M A K M Q A K V Q A D E R D D G L R E K M I S V N R V T K V V K G G F2
W Q R C K R K F R L T N A T T A F A K R * F R S I A * P R S * R V F3
101 ATGGCAAAGATGCAAGCGAAAGTTCAGGCTGACGAACGCGACGACGGCCTTCGCGAAAAGATGATTTCGGTCAATCGCGTGACCAAGGTCGTGAAGGGTG 200
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P Y S R L R R T D R G R R W * W P H R Y G Q G Q G E G S A G R C P F1
R I L G F A A L T V V G D G D G R I G M G K G K A K E V P V A V Q F2
A V F S A S P H * P W S A M V M A A S V W A R A R R R K C R S L S R F3
201 GCCGTATTCTCGGCTTCGCCGCACTGACCGTGGTCGGCGATGGTGATGGCCGCATCGGTATGGGCAAGGGCAAGGCGAAGGAAGTGCCGGTCGCTGTCCA 300
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E G N G T G S P Q H V Q G A A Q E R H A A A R S A R Q A W R I R S P F1
K A M E Q A R R N M F K V P L K N G T L Q H E V H G K H G A S A V F2
R Q W N R L A A T C S R C R S R T A R C S T K C T A S M A H P Q S F3
301 GAAGGCAATGGAACAGGCTCGCCGCAACATGTTCAAGGTGCCGCTCAAGAACGGCACGCTGCAGCACGAAGTGCACGGCAAGCATGGCGCATCCGCAGTC 400
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P R S G E G R Y G R D R R R P D A R S V R R D G R A E R R G E E P F1
L L A P A K A G T G V I A G G P M R A V F D V M G V Q N V V A K S H F2
S S L R R R Q V R A * S P A A R C A Q C S T * W A C R T S W R R A F3
401 CTCCTCGCTCCGGCGAAGGCAGGTACGGGCGTGATCGCCGGCGGCCCGATGCGCGCAGTGTTCGACGTGATGGGCGTGCAGAACGTCGTGGCGAAGAGCC 500
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R F D E P V Q P R S R H A G R S A Q A V D P G R H R G E A R Q V R F1
G S T N P Y N L V R A T L D G L R K Q S T P A D I A A K R G K S V F2
T V R R T R T T S F A P R W T V C A S S R P R Q T S R R S A A S P S F3
501 ACGGTTCGACGAACCCGTACAACCTCGTTCGCGCCACGCTGGACGGTCTGCGCAAGCAGTCGACCCCGGCAGACATCGCGGCGAAGCGCGGCAAGTCCGT 600
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R R Y F G L S P G G H H V * K N C Q G S A R E E P D R D P R I A P C F1
E D I L G * A R V V T M S E K T V K V Q L V K S L I G T R E S H R F2
K I F W A K P G W S P C L K K L S R F S S * R A * S G P A N R T V F3
601 CGAAGATATTTTGGGCTAAGCCCGGGTGGTCACCATGTCTGAAAAAACTGTCAAGGTTCAGCTCGTGAAGAGCCTGATCGGGACCCGCGAATCGCACCGT 700
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D R A W P G F1
A T V R G L X F2
R P C V A W F3
701 GCGACCGTGCGTGGCCTGG 719
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