BACT000004 (rpsD) allele sequence: id-72
Contig position
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- end
- 29748
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- 624
- orientation
- reverse
- complete
- yes
- method
- Illumina
Sequence
GGGCGTTGCT TTTTTGATTG ACTAAGCCCA CCGTTCGCCC CAAAGGGCGC GAACTAGCGC GGATTTCGAT CCGCGTGACC GATTGATAAA GGAATGCAAC GTGGCACGTT ATATCGGCCC CAAGGCCAAG CTGTCCCGCC GTGAAGGCAC CGACCTGTTC CTGAAGAGCG CGCGCCGCTC GCTCGCCGAC AAGTGCAAGC TCGACAGCAA GCCGGGTCAG CACGGCCGTA CCTCGGGCGC TCGTACGTCC GACTATGGTA CGCAGCTGCG CGAAAAGCAA AAGGTCAAGC GTATCTACGG CGTGCTGGAA CGTCAGTTCC GCCGCTACTT CGCTGAAGCC GACCGCCGCA AGGGCAACAC GGGTGAAAAC CTGCTGCAAC TGCTCGAGTC GCGTCTCGAC AACGTCGTGT ATCGCATGGG CTTCGGCTCG ACCCGCGCAG AAGCGCGTCA GCTGGTGAGC CACAAGTCGA TCACCGTGAA CGGCGTGGTC GCGAACGTGC CGTCGCAACA AGTGAAGGCT GGCGACGTCA TCGCGATCCG CGAAAAGGCG AAGAAGCAGG CGCGTATCAT CGAAGCGCTG TCGCTCGCCG AGCAAGGCGG CATGCCGAGC TGGGTTGCAG TCGATGCGAA GAAGTTCGAA GGCACGTTCA AGCAAATGCC GGAACGCGCT GACATCGCAG GCGACATCAA CGAAAGCCTG ATCGTCGAAT TGTATTCGCG TTAATCCGAT TGACGGCCGA GGTACCCCGA TTGCGTTTCG CAAGGAGGGG CCTCGGCTGT TTATTTTCTG GTTGTTACCG GTCAGCCTTA TCGGTGTAAC GAGC
Translation
G R C F F D * L S P P F A P K G A N * R G F R S A * P I D K G M Q R F1
G V A F L I D * A H R S P Q R A R T S A D F D P R D R L I K E C N F2
A L L F * L T K P T V R P K G R E L A R I S I R V T D * * R N A T F3
1 GGGCGTTGCTTTTTTGATTGACTAAGCCCACCGTTCGCCCCAAAGGGCGCGAACTAGCGCGGATTTCGATCCGCGTGACCGATTGATAAAGGAATGCAAC 100
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G T L Y R P Q G Q A V P P * R H R P V P E E R A P L A R R Q V Q A F1
V A R Y I G P K A K L S R R E G T D L F L K S A R R S L A D K C K L F2
W H V I S A P R P S C P A V K A P T C S * R A R A A R S P T S A S F3
101 GTGGCACGTTATATCGGCCCCAAGGCCAAGCTGTCCCGCCGTGAAGGCACCGACCTGTTCCTGAAGAGCGCGCGCCGCTCGCTCGCCGACAAGTGCAAGC 200
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R Q Q A G S A R P Y L G R S Y V R L W Y A A A R K A K G Q A Y L R F1
D S K P G Q H G R T S G A R T S D Y G T Q L R E K Q K V K R I Y G F2
S T A S R V S T A V P R A L V R P T M V R S C A K S K R S S V S T A F3
201 TCGACAGCAAGCCGGGTCAGCACGGCCGTACCTCGGGCGCTCGTACGTCCGACTATGGTACGCAGCTGCGCGAAAAGCAAAAGGTCAAGCGTATCTACGG 300
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R A G T S V P P L L R * S R P P Q G Q H G * K P A A T A R V A S R Q F1
V L E R Q F R R Y F A E A D R R K G N T G E N L L Q L L E S R L D F2
C W N V S S A A T S L K P T A A R A T R V K T C C N C S S R V S T F3
301 CGTGCTGGAACGTCAGTTCCGCCGCTACTTCGCTGAAGCCGACCGCCGCAAGGGCAACACGGGTGAAAACCTGCTGCAACTGCTCGAGTCGCGTCTCGAC 400
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R R V S H G L R L D P R R S A S A G E P Q V D H R E R R G R E R A F1
N V V Y R M G F G S T R A E A R Q L V S H K S I T V N G V V A N V P F2
T S C I A W A S A R P A Q K R V S W * A T S R S P * T A W S R T C F3
401 AACGTCGTGTATCGCATGGGCTTCGGCTCGACCCGCGCAGAAGCGCGTCAGCTGGTGAGCCACAAGTCGATCACCGTGAACGGCGTGGTCGCGAACGTGC 500
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V A T S E G W R R H R D P R K G E E A G A Y H R S A V A R R A R R F1
S Q Q V K A G D V I A I R E K A K K Q A R I I E A L S L A E Q G G F2
R R N K * R L A T S S R S A K R R R S R R V S S K R C R S P S K A A F3
501 CGTCGCAACAAGTGAAGGCTGGCGACGTCATCGCGATCCGCGAAAAGGCGAAGAAGCAGGCGCGTATCATCGAAGCGCTGTCGCTCGCCGAGCAAGGCGG 600
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H A E L G C S R C E E V R R H V Q A N A G T R * H R R R H Q R K P D F1
M P S W V A V D A K K F E G T F K Q M P E R A D I A G D I N E S L F2
C R A G L Q S M R R S S K A R S S K C R N A L T S Q A T S T K A * F3
601 CATGCCGAGCTGGGTTGCAGTCGATGCGAAGAAGTTCGAAGGCACGTTCAAGCAAATGCCGGAACGCGCTGACATCGCAGGCGACATCAACGAAAGCCTG 700
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R R I V F A L I R L T A E V P R L R F A R R G L G C L F S G C Y R F1
I V E L Y S R * S D * R P R Y P D C V S Q G G A S A V Y F L V V T G F2
S S N C I R V N P I D G R G T P I A F R K E G P R L F I F W L L P F3
701 ATCGTCGAATTGTATTCGCGTTAATCCGATTGACGGCCGAGGTACCCCGATTGCGTTTCGCAAGGAGGGGCCTCGGCTGTTTATTTTCTGGTTGTTACCG 800
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S A L S V * R A F1
Q P Y R C N E X F2
V S L I G V T S F3
801 GTCAGCCTTATCGGTGTAACGAGC 824
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