BACT000003 (rpsC) allele sequence: id-72
Contig position
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- Illumina
Sequence
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Translation
R S S V S P R A P R A A V T A S R S N P V T S L * R S G I K E P Y D F1
A Q A F H R A R Q G P R * P H R E A I L S H H C D G R E L R S H T F2
L K R F T A R A K G R G N R I E K Q S C H I T V T V G N * G A I R F3
1 CGCTCAAGCGTTTCACCGCGCGCGCCAAGGGCCGCGGTAACCGCATCGAGAAGCAATCCTGTCACATCACTGTGACGGTCGGGAATTAAGGAGCCATACG 100
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G T E N S S D W L P P G C Q P Q L G F A L V R E Q Q Q F R G D A A F1
M G Q K I H P T G F R L A V S R N W A S R W Y A N N N N F A A M L Q F2
W D R K F I R L A S A W L S A A I G L R V G T R T T T I S R R C C F3
101 ATGGGACAGAAAATTCATCCGACTGGCTTCCGCCTGGCTGTCAGCCGCAATTGGGCTTCGCGTTGGTACGCGAACAACAACAATTTCGCGGCGATGCTGC 200
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G R H R C S * I P E E E A E E R F G R S G R H R A S G K E R A H H F1
E D I G V R E Y L K K K L K N A S V G R V V I E R P A K N A R I T F2
R K T S V F V N T * R R S * R T L R S V G S S S S V R Q R T R A S R F3
201 AGGAAGACATCGGTGTTCGTGAATACCTGAAGAAGAAGCTGAAGAACGCTTCGGTCGGTCGGGTCGTCATCGAGCGTCCGGCAAAGAACGCGCGCATCAC 300
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D L Q L A S G R R H R Q E G R G Y R T A E D G T A T P H G R A G S R F1
I Y S S R P G V V I G K K G E D I E Q L K T E L Q R R M G V P V H F2
F T A R V R A S S S A R R A R I S N S * R R N C N A A W A C R F T F3
301 GATTTACAGCTCGCGTCCGGGCGTCGTCATCGGCAAGAAGGGCGAGGATATCGAACAGCTGAAGACGGAACTGCAACGCCGCATGGGCGTGCCGGTTCAC 400
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Q H R R D P Q A G N R C S T D R * L D H A T A R A P D H V P S R D F1
V N I E E I R K P E T D A Q L I A D S I T Q Q L E R R I M F R R A M F2
S T S K R S A S R K P M L N * S L T R S R N S S S A G S C S V A R F3
401 GTCAACATCGAAGAGATCCGCAAGCCGGAAACCGATGCTCAACTGATCGCTGACTCGATCACGCAACAGCTCGAGCGCCGGATCATGTTCCGTCGCGCGA 500
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E A C D A E R D A S G C P G H Q D H E R R P S E R Y R N R S Y G V F1
K R A M Q N A M R L G A Q G I K I M S A G R L N G I E I A R T E W F2
* S V R C R T R C V W V P R A S R S * A Q A V * T V S K S L V R S G F3
501 TGAAGCGTGCGATGCAGAACGCGATGCGTCTGGGTGCCCAGGGCATCAAGATCATGAGCGCAGGCCGTCTGAACGGTATCGAAATCGCTCGTACGGAGTG 600
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V S R R S R A P S H A A R R Y R L R N L G S E D D L R H H R C Q G L F1
Y R E G R V P L H T L R A D I D Y A T S E A K T T Y G I I G V K V F2
I A K V A C P F T R C A P I S T T Q P R K R R R P T A S S V S R F F3
601 GTATCGCGAAGGTCGCGTGCCCCTTCACACGCTGCGCGCCGATATCGACTACGCAACCTCGGAAGCGAAGACGACCTACGGCATCATCGGTGTCAAGGTT 700
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G L Q G R H A R P Q * R A G G R R S S R R Q A S A S Q C A S G R P F1
W V Y K G D T L G R N D A P V V E E V A E D K R P R R N A R P G D R F2
G F T R A T R S A A M T R R W S K K * P K T S V R V A M R V R A T F3
701 TGGGTTTACAAGGGCGACACGCTCGGCCGCAATGACGCGCCGGTGGTCGAAGAAGTAGCCGAAGACAAGCGTCCGCGTCGCAATGCGCGTCCGGGCGACC 800
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S S A P * R R R R R S G C S S W R T A P R R R Q A G R R Q D W R I F1
R P R R D G E G G A P G A R R G A P R R G A G K P E D G K T G E * F2
V V R A V T A K A A L R V L V V A H R A A A P A S R K T A R L E N N F3
801 GTCGTCCGCGCCGTGACGGCGAAGGCGGCGCTCCGGGTGCTCGTCGTGGCGCACCGCGCCGCGGCGCCGGCAAGCCGGAAGACGGCAAGACTGGAGAATA 900
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T M L Q P K R R K Y R K E Q K G R N T G K A T R G N A V S F G E F G F1
R C C N R N A G S I A K S R R V V T P A R R R A A T R C R S V N S F2
D A A T E T Q E V S Q R A E G S * H R Q G D A R Q R G V V R * I R F3
901 ACGATGCTGCAACCGAAACGCAGGAAGTATCGCAAAGAGCAGAAGGGTCGTAACACCGGCAAGGCGACGCGCGGCAACGCGGTGTCGTTCGGTGAATTCG 1000
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F1
X F2
F3
1001 G 1001
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