BACT000002 (rpsB) allele sequence: id-72
Contig position
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- yes
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- Illumina
Sequence
GCGCAACCAG GGTGCCGGCC GCGCGGAATG GCGGTCCTTC GGGGCGCTCG CGCGGCGGTA CGGCAGCCGG CTTAAGACCC AACCCTCGTG GAGAATTTAC ATGGCAGTCA CGATGCGCCA AATGCTGGAA GCAGGTGTCC ACTTCGGTCA CCAGACGCGC TTCTGGAACC CGAAGATGGC TCCGTTCATT TTCGGTCACC GCAACAAGAT TCACATCATC AACCTCGAAA AGACGCTGCC GATGTTCACG GACGCACAGA AGTACGTGCG CCAGCTGGCA GCGAACCGCG GCACGATCCT GTTCGTCGGC ACGAAGCGCC AGTCGCGTGA CACGATCGCC CAGGAAGCGC AACGTGCGGG CATGCCGTAC GTCAACGCGC GCTGGCTCGG CGGCATGATG ACCAACTTCA AGACGCTGAA GGTGTCGATC AAGCGCCTGA AGGACATGGA AGCGGCCGTC GAAGCGGGTG AAACCGAAAA GATGAGCAAG AAGGAAGCGC TGCTGTTCGA ACGCGAAATC GCCAAGCTGC AAAAGTCGAT CGGCGGAGTG AAGGACATGG GCGGCATTCC GGACGCGATC TTCGTGATCG ACGTCGGCTA CCACAAGATT GCCGTCACCG AAGCGAACAA GCTGGGCGTG CCGGTCATCG CCGTGGTCGA CACGAACCAC TCGCCGGAAG GTGTGGACTA CGTGATCCCG GGTAACGACG ACTCGAGCAA GGCCGTTGCG CTGTACGCGC AAGGCGTGGC CGACGCGATC CTCGAAGGCC GTGCGAACGC GGTCAACGAA GTGGTCCAGG CCGTGCGCGG CGACGACGAA TACGTCGAGG AAAACGCGTA ACTGGCCCCG AGCCGGCGCA AAAAGGGGGC TCTCAACAGG CCCCCTTTTT TTAAGCTTGT GCGCCGGACC TGATCGCGCC GAAACGGCGC GGGTCCGGAA A
Translation
A Q P G C R P R G M A V L R G A R A A V R Q P A * D P T L V E N L H F1
R N Q G A G R A E W R S F G A L A R R Y G S R L K T Q P S W R I Y F2
A T R V P A A R N G G P S G R S R G G T A A G L R P N P R G E F T F3
1 GCGCAACCAGGGTGCCGGCCGCGCGGAATGGCGGTCCTTCGGGGCGCTCGCGCGGCGGTACGGCAGCCGGCTTAAGACCCAACCCTCGTGGAGAATTTAC 100
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G S H D A P N A G S R C P L R S P D A L L E P E D G S V H F R S P F1
M A V T M R Q M L E A G V H F G H Q T R F W N P K M A P F I F G H R F2
W Q S R C A K C W K Q V S T S V T R R A S G T R R W L R S F S V T F3
101 ATGGCAGTCACGATGCGCCAAATGCTGGAAGCAGGTGTCCACTTCGGTCACCAGACGCGCTTCTGGAACCCGAAGATGGCTCCGTTCATTTTCGGTCACC 200
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Q Q D S H H Q P R K D A A D V H G R T E V R A P A G S E P R H D P F1
N K I H I I N L E K T L P M F T D A Q K Y V R Q L A A N R G T I L F2
A T R F T S S T S K R R C R C S R T H R S T C A S W Q R T A A R S C F3
201 GCAACAAGATTCACATCATCAACCTCGAAAAGACGCTGCCGATGTTCACGGACGCACAGAAGTACGTGCGCCAGCTGGCAGCGAACCGCGGCACGATCCT 300
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V R R H E A P V A * H D R P G S A T C G H A V R Q R A L A R R H D D F1
F V G T K R Q S R D T I A Q E A Q R A G M P Y V N A R W L G G M M F2
S S A R S A S R V T R S P R K R N V R A C R T S T R A G S A A * * F3
301 GTTCGTCGGCACGAAGCGCCAGTCGCGTGACACGATCGCCCAGGAAGCGCAACGTGCGGGCATGCCGTACGTCAACGCGCGCTGGCTCGGCGGCATGATG 400
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Q L Q D A E G V D Q A P E G H G S G R R S G * N R K D E Q E G S A F1
T N F K T L K V S I K R L K D M E A A V E A G E T E K M S K K E A L F2
P T S R R * R C R S S A * R T W K R P S K R V K P K R * A R R K R F3
401 ACCAACTTCAAGACGCTGAAGGTGTCGATCAAGCGCCTGAAGGACATGGAAGCGGCCGTCGAAGCGGGTGAAACCGAAAAGATGAGCAAGAAGGAAGCGC 500
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A V R T R N R Q A A K V D R R S E G H G R H S G R D L R D R R R L F1
L F E R E I A K L Q K S I G G V K D M G G I P D A I F V I D V G Y F2
C C S N A K S P S C K S R S A E * R T W A A F R T R S S * S T S A T F3
501 TGCTGTTCGAACGCGAAATCGCCAAGCTGCAAAAGTCGATCGGCGGAGTGAAGGACATGGGCGGCATTCCGGACGCGATCTTCGTGATCGACGTCGGCTA 600
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P Q D C R H R S E Q A G R A G H R R G R H E P L A G R C G L R D P G F1
H K I A V T E A N K L G V P V I A V V D T N H S P E G V D Y V I P F2
T R L P S P K R T S W A C R S S P W S T R T T R R K V W T T * S R F3
601 CCACAAGATTGCCGTCACCGAAGCGAACAAGCTGGGCGTGCCGGTCATCGCCGTGGTCGACACGAACCACTCGCCGGAAGGTGTGGACTACGTGATCCCG 700
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* R R L E Q G R C A V R A R R G R R D P R R P C E R G Q R S G P G F1
G N D D S S K A V A L Y A Q G V A D A I L E G R A N A V N E V V Q A F2
V T T T R A R P L R C T R K A W P T R S S K A V R T R S T K W S R F3
701 GGTAACGACGACTCGAGCAAGGCCGTTGCGCTGTACGCGCAAGGCGTGGCCGACGCGATCCTCGAAGGCCGTGCGAACGCGGTCAACGAAGTGGTCCAGG 800
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R A R R R R I R R G K R V T G P E P A Q K G G S Q Q A P F F * A C F1
V R G D D E Y V E E N A * L A P S R R K K G A L N R P P F F K L V F2
P C A A T T N T S R K T R N W P R A G A K R G L S T G P L F L S L C F3
801 CCGTGCGCGGCGACGACGAATACGTCGAGGAAAACGCGTAACTGGCCCCGAGCCGGCGCAAAAAGGGGGCTCTCAACAGGCCCCCTTTTTTTAAGCTTGT 900
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A P D L I A P K R R G S G X F1
R R T * S R R N G A G P E X F2
A G P D R A E T A R V R K F3
901 GCGCCGGACCTGATCGCGCCGAAACGGCGCGGGTCCGGAAA 941
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