trpB allele sequence: id-368
Contig position
- sequence bin id
- 3698
- contig length
- 145849
- start
- 119935
- end
- 120235
- length
- 301
- orientation
- reverse
- complete
- yes
- method
- Illumina
Sequence
GCGACCGTCG TGCCGGTCGA ATCGGGTTCG CGCACGCTGA AGGACGCGCT GAACGAGGCG ATGCGCGACT GGGTCACGAA CATCGAGAAC ACGTTCTACA TCATCGGCAC GGTCGCGGGC CCGCACCCGT ATCCGATGAT GGTGCGCGAC TTCCAGCGCG TGATCGGCGA CGAATGCAAG GTGCAGATGC CCGAACTCGC CGGGCGCCAG CCCGACGCGG TGATCGCCTG CGTCGGCGGC GGCTCGAATG CGATGGGGAT CTTCTATCCG TACATCGACG ACGCGTCGGT GCAACTGATC GGCGTCGAAG CCGCGGGCGA CGGCCTCGAC ACCGGCCATC ACGCGGCCTC GCTGATCGCC GGCAGCCCGG GCGTGCTGCA CGGCAACCGC ACCTATCTGC TGCAGGACGA CAACGGTCAG ATCATCGAGA CGCATTCGGT GTCGGCCGGC CTCGACTATC CGGGCGTCGG TCCCGAGCAC GCATGGCTGA AGGACAGCGG C
Translation
A T V V P V E S G S R T L K D A L N E A M R D W V T N I E N T F Y I F1
R P S C R S N R V R A R * R T R * T R R C A T G S R T S R T R S T F2
D R R A G R I G F A H A E G R A E R G D A R L G H E H R E H V L H F3
1 GCGACCGTCGTGCCGGTCGAATCGGGTTCGCGCACGCTGAAGGACGCGCTGAACGAGGCGATGCGCGACTGGGTCACGAACATCGAGAACACGTTCTACA 100
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I G T V A G P H P Y P M M V R D F Q R V I G D E C K V Q M P E L A F1
S S A R S R A R T R I R * W C A T S S A * S A T N A R C R C P N S P F2
H R H G R G P A P V S D D G A R L P A R D R R R M Q G A D A R T R F3
101 TCATCGGCACGGTCGCGGGCCCGCACCCGTATCCGATGATGGTGCGCGACTTCCAGCGCGTGATCGGCGACGAATGCAAGGTGCAGATGCCCGAACTCGC 200
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G R Q P D A V I A C V G G G S N A M G I F Y P Y I D D A S V Q L I F1
G A S P T R * S P A S A A A R M R W G S S I R T S T T R R C N * S F2
R A P A R R G D R L R R R R L E C D G D L L S V H R R R V G A T D R F3
201 CGGGCGCCAGCCCGACGCGGTGATCGCCTGCGTCGGCGGCGGCTCGAATGCGATGGGGATCTTCTATCCGTACATCGACGACGCGTCGGTGCAACTGATC 300
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G V E A A G D G L D T G H H A A S L I A G S P G V L H G N R T Y L L F1
A S K P R A T A S T P A I T R P R * S P A A R A C C T A T A P I C F2
R R S R G R R P R H R P S R G L A D R R Q P G R A A R Q P H L S A F3
301 GGCGTCGAAGCCGCGGGCGACGGCCTCGACACCGGCCATCACGCGGCCTCGCTGATCGCCGGCAGCCCGGGCGTGCTGCACGGCAACCGCACCTATCTGC 400
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Q D D N G Q I I E T H S V S A G L D Y P G V G P E H A W L K D S G F1
C R T T T V R S S R R I R C R P A S T I R A S V P S T H G * R T A A F2
A G R Q R S D H R D A F G V G R P R L S G R R S R A R M A E G Q R F3
401 TGCAGGACGACAACGGTCAGATCATCGAGACGCATTCGGTGTCGGCCGGCCTCGACTATCCGGGCGTCGGTCCCGAGCACGCATGGCTGAAGGACAGCGG 500
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F1
F2
X F3
501 C 501
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