recA allele sequence: id-368
Contig position
- sequence bin id
- 3680
- contig length
- 847125
- start
- 525817
- end
- 526209
- length
- 393
- orientation
- forward
- complete
- yes
- method
- Illumina
Sequence
GAAAGCGGGC GCGCCTGTTA CAGACGCTGC TCATCATAGC AAAGGACGAT TCATGGAAGA AAGCAAGAAG GGCTCCGGGA TGACCGCCGA GAAGAGCAAG GCGCTGGCTG CCGCACTCGC GCAGATCGAG AAGCAGTTCG GCAAAGGGTC GATCATGCGC ATGGGCGACG GCGAGGCGGC CGAGGACATC CAGGTCGTGT CCACGGGCTC GCTCGGGCTC GACATCGCAT TGGGCGTCGG CGGCCTGCCG CGCGGCCGCG TGGTCGAGAT CTACGGGCCG GAATCGTCCG GCAAGACCAC GCTCACGCTG CAGGTCATCG CCGAGCTGCA GAAGCTGGGC GGCACCGCGG CGTTCATCGA CGCCGAGCAC GCGCTCGACG TCCAGTACGC GGCGAAGCTC GGCGTCAACG TGCCGGATCT GCTGATCTCG CAGCCGGACA CCGGCGAGCA GGCGCTCGAA ATCACCGACG CGCTGGTGCG CTCGGGCTCG ATCGACATGA TCGTCATCGA CTCGGTCGCG GCGCTCGTGC CGAAGGCCGA AATCGAAGGC GAGATGGGCG ATTCGCTGCC GGGCCTGCAG GCGCGCCTGA TGT
Translation
E S G R A C Y R R C S S * Q R T I H G R K Q E G L R D D R R E E Q G F1
K A G A P V T D A A H H S K G R F M E E S K K G S G M T A E K S K F2
K R A R L L Q T L L I I A K D D S W K K A R R A P G * P P R R A R F3
1 GAAAGCGGGCGCGCCTGTTACAGACGCTGCTCATCATAGCAAAGGACGATTCATGGAAGAAAGCAAGAAGGGCTCCGGGATGACCGCCGAGAAGAGCAAG 100
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
A G C R T R A D R E A V R Q R V D H A H G R R R G G R G H P G R V F1
A L A A A L A Q I E K Q F G K G S I M R M G D G E A A E D I Q V V S F2
R W L P H S R R S R S S S A K G R S C A W A T A R R P R T S R S C F3
101 GCGCTGGCTGCCGCACTCGCGCAGATCGAGAAGCAGTTCGGCAAAGGGTCGATCATGCGCATGGGCGACGGCGAGGCGGCCGAGGACATCCAGGTCGTGT 200
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
H G L A R A R H R I G R R R P A A R P R G R D L R A G I V R Q D H F1
T G S L G L D I A L G V G G L P R G R V V E I Y G P E S S G K T T F2
P R A R S G S T S H W A S A A C R A A A W S R S T G R N R P A R P R F3
201 CCACGGGCTCGCTCGGGCTCGACATCGCATTGGGCGTCGGCGGCCTGCCGCGCGGCCGCGTGGTCGAGATCTACGGGCCGGAATCGTCCGGCAAGACCAC 300
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
A H A A G H R R A A E A G R H R G V H R R R A R A R R P V R G E A R F1
L T L Q V I A E L Q K L G G T A A F I D A E H A L D V Q Y A A K L F2
S R C R S S P S C R S W A A P R R S S T P S T R S T S S T R R S S F3
301 GCTCACGCTGCAGGTCATCGCCGAGCTGCAGAAGCTGGGCGGCACCGCGGCGTTCATCGACGCCGAGCACGCGCTCGACGTCCAGTACGCGGCGAAGCTC 400
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
R Q R A G S A D L A A G H R R A G A R N H R R A G A L G L D R H D F1
G V N V P D L L I S Q P D T G E Q A L E I T D A L V R S G S I D M I F2
A S T C R I C * S R S R T P A S R R S K S P T R W C A R A R S T * F3
401 GGCGTCAACGTGCCGGATCTGCTGATCTCGCAGCCGGACACCGGCGAGCAGGCGCTCGAAATCACCGACGCGCTGGTGCGCTCGGGCTCGATCGACATGA 500
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
R H R L G R G A R A E G R N R R R D G R F A A G P A G A P D V F1
V I D S V A A L V P K A E I E G E M G D S L P G L Q A R L M X F2
S S S T R S R R S C R R P K S K A R W A I R C R A C R R A * C F3
501 TCGTCATCGACTCGGTCGCGGCGCTCGTGCCGAAGGCCGAAATCGAAGGCGAGATGGGCGATTCGCTGCCGGGCCTGCAGGCGCGCCTGATGT 593
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|---