phaC allele sequence: id-368

Contig position

sequence bin id
3689
contig length
406678
start
32519
end
32903
length
385
orientation
forward
complete
yes
method
Illumina
Options

Sequence

GTACGTAACG GGCGGGATGG GCGGCATCGG CACCAGCATC TGCCAGCGTC TGTCGAAAGA CGGCTTCAAG GTGGTCGCAG GCTGCGGCCC GAACTCGCCG CGCCGCGTGA AGTGGCTCGA GGAGCAGAAG GCGCTCGGGT TCGACTTCAT CGCGTCGGAA GGCAACGTCG GCGACTGGGA CTCCACGAAG GCGGCATTCG ACAAGGTCAA GGCCGAAGTC GGCGAAGTCG ACGTGCTGGT GAACAATGCG GGCATTACGC GCGACGTCGT GTTCCGCAAG ATGACGCACG AAGACTGGAC TGCCGTCATC GATACCAACC TGACGAGCCT GTTCAACGTG ACGAAACAGG TGATCGACGG GATGGTCGAG CGTGGCTGGG GCCGCATCAT CAACATTTCG TCGGTGAACG GCCAGAAGGG GCAATTCGGC CAGACCAACT ACTCGACCGC AAAGGCCGGC ATTCACGGCT TCACGATGGC GCTCGCGCAG GAAGTCGCGA CGAAGGGCGT GACCGTCAAC ACCGTGTCGC CCGGTTATAT CGGCACCGAC ATGGTGAAGG CGATCCGCCC CGACGTGCTC GAGAA

Translation


          V  R  N  G  R  D  G  R  H  R  H  Q  H  L  P  A  S  V  E  R  R  L  Q  G  G  R  R  L  R  P  E  L  A  A   F1
           Y  V  T  G  G  M  G  G  I  G  T  S  I  C  Q  R  L  S  K  D  G  F  K  V  V  A  G  C  G  P  N  S  P     F2
            T  *  R  A  G  W  A  A  S  A  P  A  S  A  S  V  C  R  K  T  A  S  R  W  S  Q  A  A  A  R  T  R  R    F3
        1 GTACGTAACGGGCGGGATGGGCGGCATCGGCACCAGCATCTGCCAGCGTCTGTCGAAAGACGGCTTCAAGGTGGTCGCAGGCTGCGGCCCGAACTCGCCG 100
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            P  R  E  V  A  R  G  A  E  G  A  R  V  R  L  H  R  V  G  R  Q  R  R  R  L  G  L  H  E  G  G  I  R    F1
          R  R  V  K  W  L  E  E  Q  K  A  L  G  F  D  F  I  A  S  E  G  N  V  G  D  W  D  S  T  K  A  A  F  D   F2
           A  A  *  S  G  S  R  S  R  R  R  S  G  S  T  S  S  R  R  K  A  T  S  A  T  G  T  P  R  R  R  H  S     F3
      101 CGCCGCGTGAAGTGGCTCGAGGAGCAGAAGGCGCTCGGGTTCGACTTCATCGCGTCGGAAGGCAACGTCGGCGACTGGGACTCCACGAAGGCGGCATTCG 200
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           Q  G  Q  G  R  S  R  R  S  R  R  A  G  E  Q  C  G  H  Y  A  R  R  R  V  P  Q  D  D  A  R  R  L  D     F1
            K  V  K  A  E  V  G  E  V  D  V  L  V  N  N  A  G  I  T  R  D  V  V  F  R  K  M  T  H  E  D  W  T    F2
          T  R  S  R  P  K  S  A  K  S  T  C  W  *  T  M  R  A  L  R  A  T  S  C  S  A  R  *  R  T  K  T  G  L   F3
      201 ACAAGGTCAAGGCCGAAGTCGGCGAAGTCGACGTGCTGGTGAACAATGCGGGCATTACGCGCGACGTCGTGTTCCGCAAGATGACGCACGAAGACTGGAC 300
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          C  R  H  R  Y  Q  P  D  E  P  V  Q  R  D  E  T  G  D  R  R  D  G  R  A  W  L  G  P  H  H  Q  H  F  V   F1
           A  V  I  D  T  N  L  T  S  L  F  N  V  T  K  Q  V  I  D  G  M  V  E  R  G  W  G  R  I  I  N  I  S     F2
            P  S  S  I  P  T  *  R  A  C  S  T  *  R  N  R  *  S  T  G  W  S  S  V  A  G  A  A  S  S  T  F  R    F3
      301 TGCCGTCATCGATACCAACCTGACGAGCCTGTTCAACGTGACGAAACAGGTGATCGACGGGATGGTCGAGCGTGGCTGGGGCCGCATCATCAACATTTCG 400
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            G  E  R  P  E  G  A  I  R  P  D  Q  L  L  D  R  K  G  R  H  S  R  L  H  D  G  A  R  A  G  S  R  D    F1
          S  V  N  G  Q  K  G  Q  F  G  Q  T  N  Y  S  T  A  K  A  G  I  H  G  F  T  M  A  L  A  Q  E  V  A  T   F2
           R  *  T  A  R  R  G  N  S  A  R  P  T  T  R  P  Q  R  P  A  F  T  A  S  R  W  R  S  R  R  K  S  R     F3
      401 TCGGTGAACGGCCAGAAGGGGCAATTCGGCCAGACCAACTACTCGACCGCAAAGGCCGGCATTCACGGCTTCACGATGGCGCTCGCGCAGGAAGTCGCGA 500
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           E  G  R  D  R  Q  H  R  V  A  R  L  Y  R  H  R  H  G  E  G  D  P  P  R  R  A  R  E                    F1
            K  G  V  T  V  N  T  V  S  P  G  Y  I  G  T  D  M  V  K  A  I  R  P  D  V  L  E  X                   F2
          R  R  A  *  P  S  T  P  C  R  P  V  I  S  A  P  T  W  *  R  R  S  A  P  T  C  S  R  X                  F3
      501 CGAAGGGCGTGACCGTCAACACCGTGTCGCCCGGTTATATCGGCACCGACATGGTGAAGGCGATCCGCCCCGACGTGCTCGAGAA 585
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