lepA allele sequence: id-368

Contig position

sequence bin id
3699
contig length
169758
start
62055
end
62451
length
397
orientation
forward
complete
yes
method
Illumina
Options

Sequence

CATCGGCGTG TTCACGCCGA AGTCGCGCAA CCTGGAATCG CTGTCGGCAG GGCAGGTGGG CTTCATCATC GCCGGCATCA AGGAGCTGAC GGCCGCGAAG GTCGGCGATA CGGTCACGCA CGCGACGAAG GCCGCGGCCG AGCCGCTGCC GGGCTTCAAG GAAGTGAAGC CGCAGGTGTT CGCGGGCCTC TATCCGGTCG AGGCGAACCA GTACGACGCG CTGCGCGAAT CGCTCGAGAA GCTGAAGCTC AACGACGCAT CGCTGCAGTA CGAGCCGGAA GTGTCGCAGG CGCTCGGCTT CGGTTTCCGC TGCGGCTTCC TCGGGCTGCT GCACATGGAA ATCGTGCAGG AGCGGCTCGA GCGCGAATTC GACATGGACC TCATCACGAC CGCACCGACG GTCGTCTACG AGGTCGTGCA GAGCGACGGC TCGACGATCA TGGTCGAGAA CCCGGCGAAG ATGCCGGAGC CCGCGCGCAT CGCCGAGATC CGCGAGCCGA TCGTCACCGT GAACCTCTAC ATGCCGCAGG ACTACGTCGG CTCGGTGATC ACGCTGTGCG AGCAGAAGCG CGGCACGCAG ATCAACATGC AGTATCA

Translation


          H  R  R  V  H  A  E  V  A  Q  P  G  I  A  V  G  R  A  G  G  L  H  H  R  R  H  Q  G  A  D  G  R  E  G   F1
           I  G  V  F  T  P  K  S  R  N  L  E  S  L  S  A  G  Q  V  G  F  I  I  A  G  I  K  E  L  T  A  A  K     F2
            S  A  C  S  R  R  S  R  A  T  W  N  R  C  R  Q  G  R  W  A  S  S  S  P  A  S  R  S  *  R  P  R  R    F3
        1 CATCGGCGTGTTCACGCCGAAGTCGCGCAACCTGGAATCGCTGTCGGCAGGGCAGGTGGGCTTCATCATCGCCGGCATCAAGGAGCTGACGGCCGCGAAG 100
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            R  R  Y  G  H  A  R  D  E  G  R  G  R  A  A  A  G  L  Q  G  S  E  A  A  G  V  R  G  P  L  S  G  R    F1
          V  G  D  T  V  T  H  A  T  K  A  A  A  E  P  L  P  G  F  K  E  V  K  P  Q  V  F  A  G  L  Y  P  V  E   F2
           S  A  I  R  S  R  T  R  R  R  P  R  P  S  R  C  R  A  S  R  K  *  S  R  R  C  S  R  A  S  I  R  S     F3
      101 GTCGGCGATACGGTCACGCACGCGACGAAGGCCGCGGCCGAGCCGCTGCCGGGCTTCAAGGAAGTGAAGCCGCAGGTGTTCGCGGGCCTCTATCCGGTCG 200
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           G  E  P  V  R  R  A  A  R  I  A  R  E  A  E  A  Q  R  R  I  A  A  V  R  A  G  S  V  A  G  A  R  L     F1
            A  N  Q  Y  D  A  L  R  E  S  L  E  K  L  K  L  N  D  A  S  L  Q  Y  E  P  E  V  S  Q  A  L  G  F    F2
          R  R  T  S  T  T  R  C  A  N  R  S  R  S  *  S  S  T  T  H  R  C  S  T  S  R  K  C  R  R  R  S  A  S   F3
      201 AGGCGAACCAGTACGACGCGCTGCGCGAATCGCTCGAGAAGCTGAAGCTCAACGACGCATCGCTGCAGTACGAGCCGGAAGTGTCGCAGGCGCTCGGCTT 300
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          R  F  P  L  R  L  P  R  A  A  A  H  G  N  R  A  G  A  A  R  A  R  I  R  H  G  P  H  H  D  R  T  D  G   F1
           G  F  R  C  G  F  L  G  L  L  H  M  E  I  V  Q  E  R  L  E  R  E  F  D  M  D  L  I  T  T  A  P  T     F2
            V  S  A  A  A  S  S  G  C  C  T  W  K  S  C  R  S  G  S  S  A  N  S  T  W  T  S  S  R  P  H  R  R    F3
      301 CGGTTTCCGCTGCGGCTTCCTCGGGCTGCTGCACATGGAAATCGTGCAGGAGCGGCTCGAGCGCGAATTCGACATGGACCTCATCACGACCGCACCGACG 400
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            R  L  R  G  R  A  E  R  R  L  D  D  H  G  R  E  P  G  E  D  A  G  A  R  A  H  R  R  D  P  R  A  D    F1
          V  V  Y  E  V  V  Q  S  D  G  S  T  I  M  V  E  N  P  A  K  M  P  E  P  A  R  I  A  E  I  R  E  P  I   F2
           S  S  T  R  S  C  R  A  T  A  R  R  S  W  S  R  T  R  R  R  C  R  S  P  R  A  S  P  R  S  A  S  R     F3
      401 GTCGTCTACGAGGTCGTGCAGAGCGACGGCTCGACGATCATGGTCGAGAACCCGGCGAAGATGCCGGAGCCCGCGCGCATCGCCGAGATCCGCGAGCCGA 500
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           R  H  R  E  P  L  H  A  A  G  L  R  R  L  G  D  H  A  V  R  A  E  A  R  H  A  D  Q  H  A  V  S        F1
            V  T  V  N  L  Y  M  P  Q  D  Y  V  G  S  V  I  T  L  C  E  Q  K  R  G  T  Q  I  N  M  Q  Y  X       F2
          S  S  P  *  T  S  T  C  R  R  T  T  S  A  R  *  S  R  C  A  S  R  S  A  A  R  R  S  T  C  S  I  X      F3
      501 TCGTCACCGTGAACCTCTACATGCCGCAGGACTACGTCGGCTCGGTGATCACGCTGTGCGAGCAGAAGCGCGGCACGCAGATCAACATGCAGTATCA 597
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