gyrB allele sequence: id-368
Contig position
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- length
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- orientation
- reverse
- complete
- yes
- method
- Illumina
Sequence
CCGACCGACG TGAAGATGAA CGACAAGCAC GAACCGAAGC GCAGCGCCGC CGAGATCGTG ATGACCGAGC TGCATGCGGG CGGCAAGTTC GATCAGAACA GCTACAAGGT GTCGGGCGGG TTGCACGGCG TCGGCGTGTC GTGCGTGAAC GCGCTGTCGA GCTGGCTGCG CCTCACCGTG CGCCGCAACG GCAAGAAGCA CTTCATGGAG TTCCATCGCG GTGTCGCACA GGATCGCGTG ATCGAGGTCG TCGACGGCGA GGAAGTGTCG CCGATGCAGG TGATCGGCGA TACCGAGAAC CGCGGCACCG AAGTGCACTT CATGGCCGAT CCGACGATCT TCGGCACGGT CGAGTACCAC TACGACATCC TCGCGAAGCG GATGCGCGAG CTCTCGTTCC TGAACAACGG CGTGCGGATC CGCCTGACCG ACCTGCGTTC GGGCAAGGAA GACGATTTCG CGTTCGCCGG CGGCGTGAAG GGCTTCGTCG AGTACATCAA CAAGACGAAG AGCAACCTGC ACCCGACGAT CTTCCACGTG ATCGGCGAGA AGGACGGCGT GGGCGTCGAA GTCGCGATGC AGTGGAACGA CAGCTACAAC GAGAACGTGC TGTGCTTCAC GAACAACATT CCGCAGCGCG ACGGCGGCAC GCAC
Translation
P T D V K M N D K H E P K R S A A E I V M T E L H A G G K F D Q N S F1
R P T * R * T T S T N R S A A P P R S * * P S C M R A A S S I R T F2
D R R E D E R Q A R T E A Q R R R D R D D R A A C G R Q V R S E Q F3
1 CCGACCGACGTGAAGATGAACGACAAGCACGAACCGAAGCGCAGCGCCGCCGAGATCGTGATGACCGAGCTGCATGCGGGCGGCAAGTTCGATCAGAACA 100
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Y K V S G G L H G V G V S C V N A L S S W L R L T V R R N G K K H F1
A T R C R A G C T A S A C R A * T R C R A G C A S P C A A T A R S T F2
L Q G V G R V A R R R R V V R E R A V E L A A P H R A P Q R Q E A F3
101 GCTACAAGGTGTCGGGCGGGTTGCACGGCGTCGGCGTGTCGTGCGTGAACGCGCTGTCGAGCTGGCTGCGCCTCACCGTGCGCCGCAACGGCAAGAAGCA 200
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F M E F H R G V A Q D R V I E V V D G E E V S P M Q V I G D T E N F1
S W S S I A V S H R I A * S R S S T A R K C R R C R * S A I P R T F2
L H G V P S R C R T G S R D R G R R R R G S V A D A G D R R Y R E P F3
201 CTTCATGGAGTTCCATCGCGGTGTCGCACAGGATCGCGTGATCGAGGTCGTCGACGGCGAGGAAGTGTCGCCGATGCAGGTGATCGGCGATACCGAGAAC 300
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R G T E V H F M A D P T I F G T V E Y H Y D I L A K R M R E L S F L F1
A A P K C T S W P I R R S S A R S S T T T T S S R S G C A S S R S F2
R H R S A L H G R S D D L R H G R V P L R H P R E A D A R A L V P F3
301 CGCGGCACCGAAGTGCACTTCATGGCCGATCCGACGATCTTCGGCACGGTCGAGTACCACTACGACATCCTCGCGAAGCGGATGCGCGAGCTCTCGTTCC 400
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N N G V R I R L T D L R S G K E D D F A F A G G V K G F V E Y I N F1
* T T A C G S A * P T C V R A R K T I S R S P A A * R A S S S T S T F2
E Q R R A D P P D R P A F G Q G R R F R V R R R R E G L R R V H Q F3
401 TGAACAACGGCGTGCGGATCCGCCTGACCGACCTGCGTTCGGGCAAGGAAGACGATTTCGCGTTCGCCGGCGGCGTGAAGGGCTTCGTCGAGTACATCAA 500
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K T K S N L H P T I F H V I G E K D G V G V E V A M Q W N D S Y N F1
R R R A T C T R R S S T * S A R R T A W A S K S R C S G T T A T T F2
Q D E E Q P A P D D L P R D R R E G R R G R R S R D A V E R Q L Q R F3
501 CAAGACGAAGAGCAACCTGCACCCGACGATCTTCCACGTGATCGGCGAGAAGGACGGCGTGGGCGTCGAAGTCGCGATGCAGTGGAACGACAGCTACAAC 600
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E N V L C F T N N I P Q R D G G T H F1
R T C C A S R T T F R S A T A A R T F2
E R A V L H E Q H S A A R R R H A X F3
601 GAGAACGTGCTGTGCTTCACGAACAACATTCCGCAGCGCGACGGCGGCACGCAC 654
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