gltB allele sequence: id-368

Contig position

sequence bin id
3702
contig length
204182
start
47033
end
47432
length
400
orientation
forward
complete
yes
method
Illumina
Options

Sequence

CGGTGCTGCG TGCGAAGTTC AAGGGCCAGC CCGAGCACGT CGTCAACTAC TTCTTCTTCG TCGCCGAGGA AGTGCGCGAG ATCATGGCGC AGCTCGGCAT CGCGAAGTTC GACGACCTGA TCGGCCGCGC GGATCTGCTC GACATGCGCA AGGGCATCGA GCACTGGAAG GCGAAGGGGC TCGACTTCTC GCGCGTGTTC TACCAGCCGG AAGGCTGCGA GGAGGTCGCC CGCCGCCACG TCGAAAGCCA GGATCACGGG CTCGAGCGCG CGCTCGACCA CGTGCTGATC GAGAAGGCGA AGGCGGCGAT CGAGAACGGC GAGCATGTGT CGTTCATCCA GCCGGTGCGC AACGTGAACC GCACGGTCGG CGCGATGCTG TCGGGCGTGA TCGCGAAGAA GCACGGCCAC GACGGTCTTG CGGACGACGC CGTGCACATC CAGCTGAAGG GCACGGCCGG CCAGAGCTTC GGTGCGTTCC TCGCGAAGGG CGTCACGCTC GATCTCGTCG GCGACGGCAA CGACTACGTC GGCAAGGGGC TGTCGGGCGG CCGCATCATC ATTCGTCCGA CCAACGACTT CCGCGGCAAG TCCGAGGAAA

Translation


          R  C  C  V  R  S  S  R  A  S  P  S  T  S  S  T  T  S  S  S  S  P  R  K  C  A  R  S  W  R  S  S  A  S   F1
           G  A  A  C  E  V  Q  G  P  A  R  A  R  R  Q  L  L  L  L  R  R  R  G  S  A  R  D  H  G  A  A  R  H     F2
            V  L  R  A  K  F  K  G  Q  P  E  H  V  V  N  Y  F  F  F  V  A  E  E  V  R  E  I  M  A  Q  L  G  I    F3
        1 CGGTGCTGCGTGCGAAGTTCAAGGGCCAGCCCGAGCACGTCGTCAACTACTTCTTCTTCGTCGCCGAGGAAGTGCGCGAGATCATGGCGCAGCTCGGCAT 100
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            R  S  S  T  T  *  S  A  A  R  I  C  S  T  C  A  R  A  S  S  T  G  R  R  R  G  S  T  S  R  A  C  S    F1
          R  E  V  R  R  P  D  R  P  R  G  S  A  R  H  A  Q  G  H  R  A  L  E  G  E  G  A  R  L  L  A  R  V  L   F2
           A  K  F  D  D  L  I  G  R  A  D  L  L  D  M  R  K  G  I  E  H  W  K  A  K  G  L  D  F  S  R  V  F     F3
      101 CGCGAAGTTCGACGACCTGATCGGCCGCGCGGATCTGCTCGACATGCGCAAGGGCATCGAGCACTGGAAGGCGAAGGGGCTCGACTTCTCGCGCGTGTTC 200
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           T  S  R  K  A  A  R  R  S  P  A  A  T  S  K  A  R  I  T  G  S  S  A  R  S  T  T  C  *  S  R  R  R     F1
            P  A  G  R  L  R  G  G  R  P  P  P  R  R  K  P  G  S  R  A  R  A  R  A  R  P  R  A  D  R  E  G  E    F2
          Y  Q  P  E  G  C  E  E  V  A  R  R  H  V  E  S  Q  D  H  G  L  E  R  A  L  D  H  V  L  I  E  K  A  K   F3
      201 TACCAGCCGGAAGGCTGCGAGGAGGTCGCCCGCCGCCACGTCGAAAGCCAGGATCACGGGCTCGAGCGCGCGCTCGACCACGTGCTGATCGAGAAGGCGA 300
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          R  R  R  S  R  T  A  S  M  C  R  S  S  S  R  C  A  T  *  T  A  R  S  A  R  C  C  R  A  *  S  R  R  S   F1
           G  G  D  R  E  R  R  A  C  V  V  H  P  A  G  A  Q  R  E  P  H  G  R  R  D  A  V  G  R  D  R  E  E     F2
            A  A  I  E  N  G  E  H  V  S  F  I  Q  P  V  R  N  V  N  R  T  V  G  A  M  L  S  G  V  I  A  K  K    F3
      301 AGGCGGCGATCGAGAACGGCGAGCATGTGTCGTTCATCCAGCCGGTGCGCAACGTGAACCGCACGGTCGGCGCGATGCTGTCGGGCGTGATCGCGAAGAA 400
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            T  A  T  T  V  L  R  T  T  P  C  T  S  S  *  R  A  R  P  A  R  A  S  V  R  S  S  R  R  A  S  R  S    F1
          A  R  P  R  R  S  C  G  R  R  R  A  H  P  A  E  G  H  G  R  P  E  L  R  C  V  P  R  E  G  R  H  A  R   F2
           H  G  H  D  G  L  A  D  D  A  V  H  I  Q  L  K  G  T  A  G  Q  S  F  G  A  F  L  A  K  G  V  T  L     F3
      401 GCACGGCCACGACGGTCTTGCGGACGACGCCGTGCACATCCAGCTGAAGGGCACGGCCGGCCAGAGCTTCGGTGCGTTCCTCGCGAAGGGCGTCACGCTC 500
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           I  S  S  A  T  A  T  T  T  S  A  R  G  C  R  A  A  A  S  S  F  V  R  P  T  T  S  A  A  S  P  R  K     F1
            S  R  R  R  R  Q  R  L  R  R  Q  G  A  V  G  R  P  H  H  H  S  S  D  Q  R  L  P  R  Q  V  R  G  X    F2
          D  L  V  G  D  G  N  D  Y  V  G  K  G  L  S  G  G  R  I  I  I  R  P  T  N  D  F  R  G  K  S  E  E  X   F3
      501 GATCTCGTCGGCGACGGCAACGACTACGTCGGCAAGGGGCTGTCGGGCGGCCGCATCATCATTCGTCCGACCAACGACTTCCGCGGCAAGTCCGAGGAAA 600
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|