BACT000064 (rpmI) allele sequence: id-368
Contig position
- sequence bin id
- 3689
- contig length
- 406678
- start
- 384820
- end
- 385017
- length
- 198
- orientation
- reverse
- complete
- yes
- method
- Illumina
Sequence
GCAGCGCGCC GTACACAAGT GGACTGGGTT TCGAAGGGCG GGTCAGGGGC GCAAGCCAAC CGCACACCCA TCGCCATCTA ATAAACTGGA GTTGTTCGTC ATGCCTAAGA TGAAGACCAA GAAGAGCGCC GCAAAGCGCT TCGTGGTGCG TCCGGGCGGT ACCGTCAAGC GCGGTCAAGC CTTCAAGCGC CACATCCTCA CCAAGAAAAC CACGAAGAAC AAGCGTCACC TGCGCGGCGC CACGGCAGTT CATGATTCCG ATCTGAACTC CGTCCGCGCG ATGCTCCCGT TCGCGTAACC CCTCAACCGA TACTCTAAGG AGAGAAACAT GCCTCGAGTC AAACGTGGGG TAACCGCACG GGCCCGTCAC AAGAAGATCA TCAACCTGGC CAAGGGTT
Translation
A A R R T Q V D W V S K G G S G A Q A N R T P I A I * * T G V V R H F1
Q R A V H K W T G F R R A G Q G R K P T A H P S P S N K L E L F V F2
S A P Y T S G L G F E G R V R G A S Q P H T H R H L I N W S C S S F3
1 GCAGCGCGCCGTACACAAGTGGACTGGGTTTCGAAGGGCGGGTCAGGGGCGCAAGCCAACCGCACACCCATCGCCATCTAATAAACTGGAGTTGTTCGTC 100
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A * D E D Q E E R R K A L R G A S G R Y R Q A R S S L Q A P H P H F1
M P K M K T K K S A A K R F V V R P G G T V K R G Q A F K R H I L T F2
C L R * R P R R A P Q S A S W C V R A V P S S A V K P S S A T S S F3
101 ATGCCTAAGATGAAGACCAAGAAGAGCGCCGCAAAGCGCTTCGTGGTGCGTCCGGGCGGTACCGTCAAGCGCGGTCAAGCCTTCAAGCGCCACATCCTCA 200
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Q E N H E E Q A S P A R R H G S S * F R S E L R P R D A P V R V T F1
K K T T K N K R H L R G A T A V H D S D L N S V R A M L P F A * P F2
P R K P R R T S V T C A A P R Q F M I P I * T P S A R C S R S R N P F3
201 CCAAGAAAACCACGAAGAACAAGCGTCACCTGCGCGGCGCCACGGCAGTTCATGATTCCGATCTGAACTCCGTCCGCGCGATGCTCCCGTTCGCGTAACC 300
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P Q P I L * G E K H A S S Q T W G N R T G P S Q E D H Q P G Q G X F1
L N R Y S K E R N M P R V K R G V T A R A R H K K I I N L A K G X F2
S T D T L R R E T C L E S N V G * P H G P V T R R S S T W P R V F3
301 CCTCAACCGATACTCTAAGGAGAGAAACATGCCTCGAGTCAAACGTGGGGTAACCGCACGGGCCCGTCACAAGAAGATCATCAACCTGGCCAAGGGTT 398
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