BACT000063 (rpmH) allele sequence: id-368
Contig position
- sequence bin id
- 3677
- contig length
- 231795
- start
- 179114
- end
- 179248
- length
- 135
- orientation
- forward
- complete
- yes
- method
- Illumina
Sequence
AAACCAATCC TGTATTTCCG GCGATTGCGT TCGCCCGAAG GCGTCCGGTA AGGGCACGCG GTCCCCTGAA TTTCGACATT CTCGAACAAG TGAGAGCATC ATGAAACGTA CTTACCAACC GTCCGTGACG CGCCGCAAGC GCACCCATGG CTTCCGTGTC CGCATGAAGA CGGCAGGCGG CCGCAAGGTC ATCAACGCTC GCCGCGCGAA GGGCCGCAAG CGTCTCGCCA TCTAAGGCGG GTTGCGCGCT GTGTCCGCCG TCCGCAGCCC TGCGGAGGGT GCCGTCGAAC CGGGTGCGAA TCCGTTGCAG ACGAAAGCCG CCTTCCCGAA AGCTG
Translation
K P I L Y F R R L R S P E G V R * G H A V P * I S T F S N K * E H H F1
N Q S C I S G D C V R P K A S G K G T R S P E F R H S R T S E S I F2
T N P V F P A I A F A R R R P V R A R G P L N F D I L E Q V R A S F3
1 AAACCAATCCTGTATTTCCGGCGATTGCGTTCGCCCGAAGGCGTCCGGTAAGGGCACGCGGTCCCCTGAATTTCGACATTCTCGAACAAGTGAGAGCATC 100
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E T Y L P T V R D A P Q A H P W L P C P H E D G R R P Q G H Q R S F1
M K R T Y Q P S V T R R K R T H G F R V R M K T A G G R K V I N A R F2
* N V L T N R P * R A A S A P M A S V S A * R R Q A A A R S S T L F3
101 ATGAAACGTACTTACCAACCGTCCGTGACGCGCCGCAAGCGCACCCATGGCTTCCGTGTCCGCATGAAGACGGCAGGCGGCCGCAAGGTCATCAACGCTC 200
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P R E G P Q A S R H L R R V A R C V R R P Q P C G G C R R T G C E F1
R A K G R K R L A I * G G L R A V S A V R S P A E G A V E P G A N F2
A A R R A A S V S P S K A G C A L C P P S A A L R R V P S N R V R I F3
201 GCCGCGCGAAGGGCCGCAAGCGTCTCGCCATCTAAGGCGGGTTGCGCGCTGTGTCCGCCGTCCGCAGCCCTGCGGAGGGTGCCGTCGAACCGGGTGCGAA 300
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S V A D E S R L P E S X F1
P L Q T K A A F P K A X F2
R C R R K P P S R K L F3
301 TCCGTTGCAGACGAAAGCCGCCTTCCCGAAAGCTG 335
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