BACT000062 (rpmG) allele sequence: id-368

Contig position

sequence bin id
3680
contig length
847125
start
685256
end
685423
length
168
orientation
reverse
complete
yes
method
Illumina
Options

Sequence

TTTCGAACGC CGGCCTGCGC CTGATCGACA AGAACGGCAT CGATTCCGTG CTCGCTGACC TGCGCGCACG CGGCGAAGCC TAAGCCCAAG GAGCACAATC ATGGCAAAAG GCGCACGCGA CAAGATCAAG CTCGAGTCGA CCGCTGGTAC GGGTCACTTC TACACGACCA CGAAGAACAA GCGCAACATG CCGGAAAAGA TGGAGATCAT GAAGTTCGAT CCCGTCGCCC GCAAGCATGT GGCGTACAAG GAAACGAAGA TCAAGTAATC TCCGCTTCCT GCAGCCTGTT GACACGAAAA GCCCCGCTCA TGCGGGGCTT TTTGTTTTGC GCGTACGCAG CTTCGCCCGA CGCGGTATGC TCTCCCCT

Translation


          F  R  T  P  A  C  A  *  S  T  R  T  A  S  I  P  C  S  L  T  C  A  H  A  A  K  P  K  P  K  E  H  N  H   F1
           F  E  R  R  P  A  P  D  R  Q  E  R  H  R  F  R  A  R  *  P  A  R  T  R  R  S  L  S  P  R  S  T  I     F2
            S  N  A  G  L  R  L  I  D  K  N  G  I  D  S  V  L  A  D  L  R  A  R  G  E  A  *  A  Q  G  A  Q  S    F3
        1 TTTCGAACGCCGGCCTGCGCCTGATCGACAAGAACGGCATCGATTCCGTGCTCGCTGACCTGCGCGCACGCGGCGAAGCCTAAGCCCAAGGAGCACAATC 100
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            G  K  R  R  T  R  Q  D  Q  A  R  V  D  R  W  Y  G  S  L  L  H  D  H  E  E  Q  A  Q  H  A  G  K  D    F1
          M  A  K  G  A  R  D  K  I  K  L  E  S  T  A  G  T  G  H  F  Y  T  T  T  K  N  K  R  N  M  P  E  K  M   F2
           W  Q  K  A  H  A  T  R  S  S  S  S  R  P  L  V  R  V  T  S  T  R  P  R  R  T  S  A  T  C  R  K  R     F3
      101 ATGGCAAAAGGCGCACGCGACAAGATCAAGCTCGAGTCGACCGCTGGTACGGGTCACTTCTACACGACCACGAAGAACAAGCGCAACATGCCGGAAAAGA 200
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           G  D  H  E  V  R  S  R  R  P  Q  A  C  G  V  Q  G  N  E  D  Q  V  I  S  A  S  C  S  L  L  T  R  K     F1
            E  I  M  K  F  D  P  V  A  R  K  H  V  A  Y  K  E  T  K  I  K  *  S  P  L  P  A  A  C  *  H  E  K    F2
          W  R  S  *  S  S  I  P  S  P  A  S  M  W  R  T  R  K  R  R  S  S  N  L  R  F  L  Q  P  V  D  T  K  S   F3
      201 TGGAGATCATGAAGTTCGATCCCGTCGCCCGCAAGCATGTGGCGTACAAGGAAACGAAGATCAAGTAATCTCCGCTTCCTGCAGCCTGTTGACACGAAAA 300
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          A  P  L  M  R  G  F  L  F  C  A  Y  A  A  S  P  D  A  V  C  S  P  L                                    F1
           P  R  S  C  G  A  F  C  F  A  R  T  Q  L  R  P  T  R  Y  A  L  P  X                                   F2
            P  A  H  A  G  L  F  V  L  R  V  R  S  F  A  R  R  G  M  L  S  P                                     F3
      301 GCCCCGCTCATGCGGGGCTTTTTGTTTTGCGCGTACGCAGCTTCGCCCGACGCGGTATGCTCTCCCCT 368
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:---