BACT000061 (rpmF) allele sequence: id-368
Contig position
- sequence bin id
- 3699
- contig length
- 169758
- start
- 50330
- end
- 50509
- length
- 180
- orientation
- forward
- complete
- yes
- method
- Illumina
Sequence
CTGAGCAGTG TGGCGCGGGA AGGCGTAAGG GCCGTGGGCC AGGGTAGTTA AGCGCCGGAT CGGGCTGTGT TAGAATCCGG AAAATTTTTA GGAGTTAGTC ATGGCAGTCC AGCAAAACAA GAAGTCGCCG TCGAAGCGCG GCATGCATCG TTCGCACGAT TTCCTGACGG CAGCGCCGCT GGCAGTCGAG CCGAGCACGG GTGAAGTGCA TCTGCGTCAC CACATCAGCC CGAACGGCTA CTATCGCGGC AAGAAAGTCG TCAAGACGAA GAACGACTAA GCGTCTCCTC GTGCGTTGCG CGTTACGATG GCCGTTCGCG TGACAACTGG TTCGCTTGAC ACTTTCCTGG CTCAACAAAA AGGCGGCATT CAACTGCCGC
Translation
L S S V A R E G V R A V G Q G S * A P D R A V L E S G K F L G V S H F1
* A V W R G K A * G P W A R V V K R R I G L C * N P E N F * E L V F2
E Q C G A G R R K G R G P G * L S A G S G C V R I R K I F R S * S F3
1 CTGAGCAGTGTGGCGCGGGAAGGCGTAAGGGCCGTGGGCCAGGGTAGTTAAGCGCCGGATCGGGCTGTGTTAGAATCCGGAAAATTTTTAGGAGTTAGTC 100
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G S P A K Q E V A V E A R H A S F A R F P D G S A A G S R A E H G F1
M A V Q Q N K K S P S K R G M H R S H D F L T A A P L A V E P S T G F2
W Q S S K T R S R R R S A A C I V R T I S * R Q R R W Q S S R A R F3
101 ATGGCAGTCCAGCAAAACAAGAAGTCGCCGTCGAAGCGCGGCATGCATCGTTCGCACGATTTCCTGACGGCAGCGCCGCTGGCAGTCGAGCCGAGCACGG 200
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* S A S A S P H Q P E R L L S R Q E S R Q D E E R L S V S S C V A F1
E V H L R H H I S P N G Y Y R G K K V V K T K N D * A S P R A L R F2
V K C I C V T T S A R T A T I A A R K S S R R R T T K R L L V R C A F3
201 GTGAAGTGCATCTGCGTCACCACATCAGCCCGAACGGCTACTATCGCGGCAAGAAAGTCGTCAAGACGAAGAACGACTAAGCGTCTCCTCGTGCGTTGCG 300
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R Y D G R S R D N W F A * H F P G S T K R R H S T A A F1
V T M A V R V T T G S L D T F L A Q Q K G G I Q L P X F2
L R W P F A * Q L V R L T L S W L N K K A A F N C R F3
301 CGTTACGATGGCCGTTCGCGTGACAACTGGTTCGCTTGACACTTTCCTGGCTCAACAAAAAGGCGGCATTCAACTGCCGC 380
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