BACT000060 (rpmE) allele sequence: id-368
Contig position
- sequence bin id
- 3703
- contig length
- 955088
- start
- 488539
- end
- 488802
- length
- 264
- orientation
- forward
- complete
- yes
- method
- Illumina
Sequence
CAAGTGGCTC GCGCCGGGCT TGACGGTCGC CGAAACGCGC ACAGCGCGCC ATTCGGCACG GCAAGCGGCG GGTTGGCTAC CGCTCTCACC AAGGAAAATC ATGAAACCTG GCATTCACCC GGATTACCGC GAAGTCGTCT TCCAAGACAT GTCGAACGGC TTCAAGTTCA TCACGCGTTC GACGATCCAG ACGCGCGAAA CCATCGAGCT CGAAGGCAAG ACCTACCCGC TCGCGAAGAT CGAAGTCTCG TCGGAATCGC ACTCGTTCTA CACGGGTCAG CAAAAGATCA TGGACACGGC CGGCCGCGTC GAGAAGTTCA AGAACAAGTT CGGTTCGCGC GCAAGCGGCA AGGTCGCGAA GTAAGCTTCG CACCGCAGCC GGTGGCTGCA ACGCACCGGT CTCCGCAAAA AAGGGCAGCC TCGGCTGCCC TTTTTTGTCT CCGCGCGTCC GGCCCGCGAG CCCG
Translation
Q V A R A G L D G R R N A H S A P F G T A S G G L A T A L T K E N H F1
K W L A P G L T V A E T R T A R H S A R Q A A G W L P L S P R K I F2
S G S R R A * R S P K R A Q R A I R H G K R R V G Y R S H Q G K S F3
1 CAAGTGGCTCGCGCCGGGCTTGACGGTCGCCGAAACGCGCACAGCGCGCCATTCGGCACGGCAAGCGGCGGGTTGGCTACCGCTCTCACCAAGGAAAATC 100
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E T W H S P G L P R S R L P R H V E R L Q V H H A F D D P D A R N F1
M K P G I H P D Y R E V V F Q D M S N G F K F I T R S T I Q T R E T F2
* N L A F T R I T A K S S S K T C R T A S S S S R V R R S R R A K F3
101 ATGAAACCTGGCATTCACCCGGATTACCGCGAAGTCGTCTTCCAAGACATGTCGAACGGCTTCAAGTTCATCACGCGTTCGACGATCCAGACGCGCGAAA 200
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H R A R R Q D L P A R E D R S L V G I A L V L H G S A K D H G H G F1
I E L E G K T Y P L A K I E V S S E S H S F Y T G Q Q K I M D T A F2
P S S S K A R P T R S R R S K S R R N R T R S T R V S K R S W T R P F3
201 CCATCGAGCTCGAAGGCAAGACCTACCCGCTCGCGAAGATCGAAGTCTCGTCGGAATCGCACTCGTTCTACACGGGTCAGCAAAAGATCATGGACACGGC 300
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R P R R E V Q E Q V R F A R K R Q G R E V S F A P Q P V A A T H R S F1
G R V E K F K N K F G S R A S G K V A K * A S H R S R W L Q R T G F2
A A S R S S R T S S V R A Q A A R S R S K L R T A A G G C N A P V F3
301 CGGCCGCGTCGAGAAGTTCAAGAACAAGTTCGGTTCGCGCGCAAGCGGCAAGGTCGCGAAGTAAGCTTCGCACCGCAGCCGGTGGCTGCAACGCACCGGT 400
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P Q K R A A S A A L F C L R A S G P R A R F1
L R K K G Q P R L P F F V S A R P A R E P X F2
S A K K G S L G C P F L S P R V R P A S P F3
401 CTCCGCAAAAAAGGGCAGCCTCGGCTGCCCTTTTTTGTCTCCGCGCGTCCGGCCCGCGAGCCCG 464
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