BACT000058 (rpmC) allele sequence: id-368
Contig position
- sequence bin id
- 3702
- contig length
- 204182
- start
- 5155
- end
- 5349
- length
- 195
- orientation
- forward
- complete
- yes
- method
- Illumina
Sequence
ATCCGAAGAA CTGGCGCGTG AGGCGTTCCG TCTGGCTGCA GCGAAGCTGC CGATCCAGAC CACGTTTATC GTTCGCCAGC TCGGCGCCTA AGGAGAAAAC ATGAAGGCTT CCGAACTTCT CCAGAAAGAC CAGGCCGCGC TCAACAAAGA GCTGGCGGAC CTGCTGAAGG CGCAATTCGG CCTGCGCATG CAACTCGCGA CCCAGCAGCT CACGAACACG AGCCAGCTGA AGAAGGTTCG TCGCGACATC GCACGTGTGC GGACCGTCAT GACTCAGAAG GCGAACCAGA AATGAACGAT AGCGTGAAAA CCTCGCTGAA GCGGACGCTG ATCGGTCGGG TCGTCAGCAA CAAGATGGAC AAGACCGTCA CCGTGCTGGT CGAGCACCGC GTCAA
Translation
I R R T G A * G V P S G C S E A A D P D H V Y R S P A R R L R R K H F1
S E E L A R E A F R L A A A K L P I Q T T F I V R Q L G A * G E N F2
P K N W R V R R S V W L Q R S C R S R P R L S F A S S A P K E K T F3
1 ATCCGAAGAACTGGCGCGTGAGGCGTTCCGTCTGGCTGCAGCGAAGCTGCCGATCCAGACCACGTTTATCGTTCGCCAGCTCGGCGCCTAAGGAGAAAAC 100
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
E G F R T S P E R P G R A Q Q R A G G P A E G A I R P A H A T R D F1
M K A S E L L Q K D Q A A L N K E L A D L L K A Q F G L R M Q L A T F2
* R L P N F S R K T R P R S T K S W R T C * R R N S A C A C N S R F3
101 ATGAAGGCTTCCGAACTTCTCCAGAAAGACCAGGCCGCGCTCAACAAAGAGCTGGCGGACCTGCTGAAGGCGCAATTCGGCCTGCGCATGCAACTCGCGA 200
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
P A A H E H E P A E E G S S R H R T C A D R H D S E G E P E M N D F1
Q Q L T N T S Q L K K V R R D I A R V R T V M T Q K A N Q K * T I F2
P S S S R T R A S * R R F V A T S H V C G P S * L R R R T R N E R * F3
201 CCCAGCAGCTCACGAACACGAGCCAGCTGAAGAAGGTTCGTCGCGACATCGCACGTGTGCGGACCGTCATGACTCAGAAGGCGAACCAGAAATGAACGAT 300
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
S V K T S L K R T L I G R V V S N K M D K T V T V L V E H R V X F1
A * K P R * S G R * S V G S S A T R W T R P S P C W S S T A S X F2
R E N L A E A D A D R S G R Q Q Q D G Q D R H R A G R A P R Q F3
301 AGCGTGAAAACCTCGCTGAAGCGGACGCTGATCGGTCGGGTCGTCAGCAACAAGATGGACAAGACCGTCACCGTGCTGGTCGAGCACCGCGTCAA 395
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----: