BACT000057 (rpmB) allele sequence: id-368
Contig position
- sequence bin id
- 3680
- contig length
- 847125
- start
- 685441
- end
- 685674
- length
- 234
- orientation
- reverse
- complete
- yes
- method
- Illumina
Sequence
GGGCTTGTGC GTTCGGAGTG CGGCCATGGA TCACGTGGCG GCGCGATGAG AACCTTCACC GGCGATCGAA CCCCGAATTT AGCGTATTAG GAGTGCTCTC ATGGCACGCG TATGCCAAGT AACTGGGAAA GCGCCGATGA GCGGCAACAA CGTTTCCCAC GCGAACAACA AGACCAAGCG CCGCTTCCTG CCGAACCTGC AAAACCGCCG GTTCTGGGTG GAAAGCGAAA ACCGTTGGGT GCGCCTGCGC GTTTCGAACG CCGGCCTGCG CCTGATCGAC AAGAACGGCA TCGATTCCGT GCTCGCTGAC CTGCGCGCAC GCGGCGAAGC CTAAGCCCAA GGAGCACAAT CATGGCAAAA GGCGCACGCG ACAAGATCAA GCTCGAGTCG ACCGCTGGTA CGGGTCACTT CTACACGACC ACGAAGAACA AGCG
Translation
G L V R S E C G H G S R G G A M R T F T G D R T P N L A Y * E C S H F1
G L C V R S A A M D H V A A R * E P S P A I E P R I * R I R S A L F2
A C A F G V R P W I T W R R D E N L H R R S N P E F S V L G V L S F3
1 GGGCTTGTGCGTTCGGAGTGCGGCCATGGATCACGTGGCGGCGCGATGAGAACCTTCACCGGCGATCGAACCCCGAATTTAGCGTATTAGGAGTGCTCTC 100
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
G T R M P S N W E S A D E R Q Q R F P R E Q Q D Q A P L P A E P A F1
M A R V C Q V T G K A P M S G N N V S H A N N K T K R R F L P N L Q F2
W H A Y A K * L G K R R * A A T T F P T R T T R P S A A S C R T C F3
101 ATGGCACGCGTATGCCAAGTAACTGGGAAAGCGCCGATGAGCGGCAACAACGTTTCCCACGCGAACAACAAGACCAAGCGCCGCTTCCTGCCGAACCTGC 200
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
K P P V L G G K R K P L G A P A R F E R R P A P D R Q E R H R F R F1
N R R F W V E S E N R W V R L R V S N A G L R L I D K N G I D S V F2
K T A G S G W K A K T V G C A C A F R T P A C A * S T R T A S I P C F3
201 AAAACCGCCGGTTCTGGGTGGAAAGCGAAAACCGTTGGGTGCGCCTGCGCGTTTCGAACGCCGGCCTGCGCCTGATCGACAAGAACGGCATCGATTCCGT 300
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
A R * P A R T R R S L S P R S T I M A K G A R D K I K L E S T A G T F1
L A D L R A R G E A * A Q G A Q S W Q K A H A T R S S S S R P L V F2
S L T C A H A A K P K P K E H N H G K R R T R Q D Q A R V D R W Y F3
301 GCTCGCTGACCTGCGCGCACGCGGCGAAGCCTAAGCCCAAGGAGCACAATCATGGCAAAAGGCGCACGCGACAAGATCAAGCTCGAGTCGACCGCTGGTA 400
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
G H F Y T T T K N K R F1
R V T S T R P R R T S X F2
G S L L H D H E E Q A F3
401 CGGGTCACTTCTACACGACCACGAAGAACAAGCG 434
----:----|----:----|----:----|----