BACT000051 (rplV) allele sequence: id-368
Contig position
- sequence bin id
- 3702
- contig length
- 204182
- start
- 3585
- end
- 3914
- length
- 330
- orientation
- forward
- complete
- yes
- method
- Illumina
Sequence
GGAAAACATG GTCGGCCACA AGCTTGGCGA GTTCGCACTG ACCCGTACGT TCAAGGGTCA CGCGGCCGAC AAGAAGGCCA AGAAATAAGG GGCTATCAAG ATGGAAGTGA AAGCAATTCA TCGCGGTGCC CGCATCTCGG CGCAAAAGAC GCGCCTTGTG GCTGACCAGA TCCGCGGTTT GCCGGTCGAC AAGGCGCTGA ACGTTCTGAC GTTCTCGCCG AAGAAAGCGG CTGGCATCGT GAAGAAGGTC GTGCTGTCGG CGATCGCGAA TGCGGAGCAC AACGAAGGCG CCGATATCGA CGAGCTGAAG ATCAAGAGCA TCTACGTCGA CAAGGCTGCA TCGCTCAAGC GTTTCACCGC GCGCGCCAAG GGCCGCGGTA ACCGCATCGA GAAGCAATCC TGTCACATCA CTGTGACGGT CGGGAATTAA GGAGCCATAC GATGGGACAG AAAATTCATC CGACTGGCTT CCGCCTGGCT GTCAGCCGCA ATTGGGCTTC GCGTTGGTAC GCGAACAACA ACAATTTCGC
Translation
G K H G R P Q A W R V R T D P Y V Q G S R G R Q E G Q E I R G Y Q D F1
E N M V G H K L G E F A L T R T F K G H A A D K K A K K * G A I K F2
K T W S A T S L A S S H * P V R S R V T R P T R R P R N K G L S R F3
1 GGAAAACATGGTCGGCCACAAGCTTGGCGAGTTCGCACTGACCCGTACGTTCAAGGGTCACGCGGCCGACAAGAAGGCCAAGAAATAAGGGGCTATCAAG 100
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G S E S N S S R C P H L G A K D A P C G * P D P R F A G R Q G A E F1
M E V K A I H R G A R I S A Q K T R L V A D Q I R G L P V D K A L N F2
W K * K Q F I A V P A S R R K R R A L W L T R S A V C R S T R R * F3
101 ATGGAAGTGAAAGCAATTCATCGCGGTGCCCGCATCTCGGCGCAAAAGACGCGCCTTGTGGCTGACCAGATCCGCGGTTTGCCGGTCGACAAGGCGCTGA 200
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R S D V L A E E S G W H R E E G R A V G D R E C G A Q R R R R Y R F1
V L T F S P K K A A G I V K K V V L S A I A N A E H N E G A D I D F2
T F * R S R R R K R L A S * R R S C C R R S R M R S T T K A P I S T F3
201 ACGTTCTGACGTTCTCGCCGAAGAAAGCGGCTGGCATCGTGAAGAAGGTCGTGCTGTCGGCGATCGCGAATGCGGAGCACAACGAAGGCGCCGATATCGA 300
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R A E D Q E H L R R Q G C I A Q A F H R A R Q G P R * P H R E A I L F1
E L K I K S I Y V D K A A S L K R F T A R A K G R G N R I E K Q S F2
S * R S R A S T S T R L H R S S V S P R A P R A A V T A S R S N P F3
301 CGAGCTGAAGATCAAGAGCATCTACGTCGACAAGGCTGCATCGCTCAAGCGTTTCACCGCGCGCGCCAAGGGCCGCGGTAACCGCATCGAGAAGCAATCC 400
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S H H C D G R E L R S H T M G Q K I H P T G F R L A V S R N W A S F1
C H I T V T V G N * G A I R W D R K F I R L A S A W L S A A I G L R F2
V T S L * R S G I K E P Y D G T E N S S D W L P P G C Q P Q L G F F3
401 TGTCACATCACTGTGACGGTCGGGAATTAAGGAGCCATACGATGGGACAGAAAATTCATCCGACTGGCTTCCGCCTGGCTGTCAGCCGCAATTGGGCTTC 500
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R W Y A N N N N F A F1
V G T R T T T I S X F2
A L V R E Q Q Q F R F3
501 GCGTTGGTACGCGAACAACAACAATTTCGC 530
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