BACT000048 (rplS) allele sequence: id-368
Contig position
- sequence bin id
- 3699
- contig length
- 169758
- start
- 5177
- end
- 5569
- length
- 393
- orientation
- forward
- complete
- yes
- method
- Illumina
Sequence
ACATGCGTGT GCGGCGCCTG ATGTGAATCC ATCCTCTATC GGGGCCAGGC CTGGAAGCAG GCGGGCGCAA ACGCCGACAC GATGGCTTTA GGAGTCAGTG ATGAATCTGA TCGCAAAACT TGAGCAGGAA GAAATCGAGC GCGCGCTCGC AGGCAAGACG ATCCCCGAAT TCGCCCCGGG CGACACGGTG ATCGTGAACG TGAACGTGGT TGAAGGTAAC CGCAAGCGCG TTCAGGCTTA CGAAGGCGTC GTGATCGCGA AGCGCAACCG TGGTCTGAAC TCGTCGTTCA TCGTCCGCAA GATCTCGTCG GGCGAAGGCG TCGAGCGTAC GTTCCAGACG TACTCGCCGC TGCTGGCGAG CATCGTCGTG AAGCGCCGCG GCGACGTGCG TCGTGCGAAG CTGTACTACC TGCGCGAGCG TTCGGGCAAG TCGGCTCGAA TCAAGGAAAA GCTGGTGTCG AAGGATCGCG CTGCAGCAGC ATCCCAAGAG TAAGAGCTGT AAGGAAAAAG CACCCACCCG GGTGCTTTTT TCATTCTGGC GCGACAATAT GCTCCATACG ACACGAAACC GAGAGCGCCA TTGAATCGCC GTC
Translation
T C V C G A * C E S I L Y R G Q A W K Q A G A N A D T M A L G V S D F1
H A C A A P D V N P S S I G A R P G S R R A Q T P T R W L * E S V F2
M R V R R L M * I H P L S G P G L E A G G R K R R H D G F R S Q * F3
1 ACATGCGTGTGCGGCGCCTGATGTGAATCCATCCTCTATCGGGGCCAGGCCTGGAAGCAGGCGGGCGCAAACGCCGACACGATGGCTTTAGGAGTCAGTG 100
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E S D R K T * A G R N R A R A R R Q D D P R I R P G R H G D R E R F1
M N L I A K L E Q E E I E R A L A G K T I P E F A P G D T V I V N V F2
* I * S Q N L S R K K S S A R S Q A R R S P N S P R A T R * S * T F3
101 ATGAATCTGATCGCAAAACTTGAGCAGGAAGAAATCGAGCGCGCGCTCGCAGGCAAGACGATCCCCGAATTCGCCCCGGGCGACACGGTGATCGTGAACG 200
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E R G * R * P Q A R S G L R R R R D R E A Q P W S E L V V H R P Q F1
N V V E G N R K R V Q A Y E G V V I A K R N R G L N S S F I V R K F2
* T W L K V T A S A F R L T K A S * S R S A T V V * T R R S S S A R F3
201 TGAACGTGGTTGAAGGTAACCGCAAGCGCGTTCAGGCTTACGAAGGCGTCGTGATCGCGAAGCGCAACCGTGGTCTGAACTCGTCGTTCATCGTCCGCAA 300
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D L V G R R R R A Y V P D V L A A A G E H R R E A P R R R A S C E A F1
I S S G E G V E R T F Q T Y S P L L A S I V V K R R G D V R R A K F2
S R R A K A S S V R S R R T R R C W R A S S * S A A A T C V V R S F3
301 GATCTCGTCGGGCGAAGGCGTCGAGCGTACGTTCCAGACGTACTCGCCGCTGCTGGCGAGCATCGTCGTGAAGCGCCGCGGCGACGTGCGTCGTGCGAAG 400
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V L P A R A F G Q V G S N Q G K A G V E G S R C S S I P R V R A V F1
L Y Y L R E R S G K S A R I K E K L V S K D R A A A A S Q E * E L * F2
C T T C A S V R A S R L E S R K S W C R R I A L Q Q H P K S K S C F3
401 CTGTACTACCTGCGCGAGCGTTCGGGCAAGTCGGCTCGAATCAAGGAAAAGCTGGTGTCGAAGGATCGCGCTGCAGCAGCATCCCAAGAGTAAGAGCTGT 500
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R K K H P P G C F F H S G A T I C S I R H E T E S A I E S P S F1
G K S T H P G A F F I L A R Q Y A P Y D T K P R A P L N R R X F2
K E K A P T R V L F S F W R D N M L H T T R N R E R H * I A V F3
501 AAGGAAAAAGCACCCACCCGGGTGCTTTTTTCATTCTGGCGCGACAATATGCTCCATACGACACGAAACCGAGAGCGCCATTGAATCGCCGTC 593
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