BACT000046 (rplQ) allele sequence: id-368
Contig position
- sequence bin id
- 3702
- contig length
- 204182
- start
- 14626
- end
- 15021
- length
- 396
- orientation
- forward
- complete
- yes
- method
- Illumina
Sequence
CTTTAAAATC CGCATCTTGC TTTTTTTCGT TACCGGCCCG TGCGCCCGTT CGGGGTGCGA TAGAAGAGCT GGATCAAAAC TTTGAATCAA GGAAACTGAA ATGCGCCATC GTCATGGTCT GCGGAAACTG AACCGCACGA GCAGCCACCG TCTGGCTATG CTCCGCAACA TGTCCAACTC GCTGATCGAG CACGAAGTCA TCAAGACGAC GCTGCCGAAG GCGAAGGAAC TCCGTAAAGT CGTCGAGCCG CTGATCACGC TCGGCAAGAA GCCGTCGCTC GCGAACCGTC GCCTGGCGTT CAACCGCCTG CGCGATCGCG ATTCGGTCGC GAAGCTGTTC GACGTGCTCG GTCCGCGTTT CGCGAACCGT CCGGGCGGCT ACCTGCGTAT CCTGAAGTTC GGCTTCCGCG TCGGCGACAA CGCACCGATG GCACTGGTCG AACTGCTGGA TCGTCCGGAA GTCGACGAAA CGGAAAACGT GCAAGAAGCG GAATAAGCTT CGGTACGAAG CAGTAACCGA AAGGGCTGAG CGATTGCTTG GCCCTTTTTG TTTTTCAGGC GCCGGCTGCG ATCGATTGTC GCAGTGCGCC GCCGGC
Translation
L * N P H L A F F R Y R P V R P F G V R * K S W I K T L N Q G N * N F1
F K I R I L L F F V T G P C A R S G C D R R A G S K L * I K E T E F2
L K S A S C F F S L P A R A P V R G A I E E L D Q N F E S R K L K F3
1 CTTTAAAATCCGCATCTTGCTTTTTTTCGTTACCGGCCCGTGCGCCCGTTCGGGGTGCGATAGAAGAGCTGGATCAAAACTTTGAATCAAGGAAACTGAA 100
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A P S S W S A E T E P H E Q P P S G Y A P Q H V Q L A D R A R S H F1
M R H R H G L R K L N R T S S H R L A M L R N M S N S L I E H E V I F2
C A I V M V C G N * T A R A A T V W L C S A T C P T R * S S T K S F3
101 ATGCGCCATCGTCATGGTCTGCGGAAACTGAACCGCACGAGCAGCCACCGTCTGGCTATGCTCCGCAACATGTCCAACTCGCTGATCGAGCACGAAGTCA 200
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Q D D A A E G E G T P * S R R A A D H A R Q E A V A R E P S P G V F1
K T T L P K A K E L R K V V E P L I T L G K K P S L A N R R L A F F2
S R R R C R R R R N S V K S S S R * S R S A R S R R S R T V A W R S F3
201 TCAAGACGACGCTGCCGAAGGCGAAGGAACTCCGTAAAGTCGTCGAGCCGCTGATCACGCTCGGCAAGAAGCCGTCGCTCGCGAACCGTCGCCTGGCGTT 300
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Q P P A R S R F G R E A V R R A R S A F R E P S G R L P A Y P E V R F1
N R L R D R D S V A K L F D V L G P R F A N R P G G Y L R I L K F F2
T A C A I A I R S R S C S T C S V R V S R T V R A A T C V S * S S F3
301 CAACCGCCTGCGCGATCGCGATTCGGTCGCGAAGCTGTTCGACGTGCTCGGTCCGCGTTTCGCGAACCGTCCGGGCGGCTACCTGCGTATCCTGAAGTTC 400
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L P R R R Q R T D G T G R T A G S S G S R R N G K R A R S G I S F F1
G F R V G D N A P M A L V E L L D R P E V D E T E N V Q E A E * A S F2
A S A S A T T H R W H W S N C W I V R K S T K R K T C K K R N K L F3
401 GGCTTCCGCGTCGGCGACAACGCACCGATGGCACTGGTCGAACTGCTGGATCGTCCGGAAGTCGACGAAACGGAAAACGTGCAAGAAGCGGAATAAGCTT 500
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G T K Q * P K G L S D C L A L F V F Q A P A A I D C R S A P P A F1
V R S S N R K G * A I A W P F L F F R R R L R S I V A V R R R X F2
R Y E A V T E R A E R L L G P F C F S G A G C D R L S Q C A A G F3
501 CGGTACGAAGCAGTAACCGAAAGGGCTGAGCGATTGCTTGGCCCTTTTTGTTTTTCAGGCGCCGGCTGCGATCGATTGTCGCAGTGCGCCGCCGGC 596
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