BACT000045 (rplP) allele sequence: id-368
Contig position
- sequence bin id
- 3702
- contig length
- 204182
- start
- 4729
- end
- 5145
- length
- 417
- orientation
- forward
- complete
- yes
- method
- Illumina
Sequence
GTCCGCGCCG TGACGGCGAA GGCGGCGCTC CGGGTGCTCG TCGTGGCGCA CCGCGCCGTG GCGCCGGCAA GCCGGAAGAC GGCAAGACTG GAGAATAACG ATGCTGCAAC CGAAACGCAG GAAGTATCGC AAAGAGCAGA AGGGTCGTAA CACCGGCAAG GCGACGCGCG GCAACGCGGT GTCGTTCGGT GAATTCGGCC TGAAGGCGAT CGGTCGCGGC CGTTTGACCG CGCGTCAAAT CGAAGCGGCG CGTCGTGCCA TGACGCGTCA CATCAAGCGT GGCGGCCGCA TCTGGATTCG CATTTTCCCG GACAAGCCGA TTTCGCAGAA GCCGGCCGAA GTACGTATGG GTAACGGTAA GGGTAACCCG GAGTACTACG TCGCCGAGAT TCAGCCGGGC AAGATGCTGT ACGAAATGGA CGGCGTATCC GAAGAACTGG CGCGTGAGGC GTTCCGTCTG GCTGCAGCGA AGCTGCCGAT CCAGACCACG TTTATCGTTC GCCAGCTCGG CGCCTAAGGA GAAAACATGA AGGCTTCCGA ACTTCTCCAG AAAGACCAGG CCGCGCTCAA CAAAGAGCTG GCGGACCTGC TGAAGGCGCA ATTCGGCCTG CGCATGC
Translation
V R A V T A K A A L R V L V V A H R A V A P A S R K T A R L E N N D F1
S A P * R R R R R S G C S S W R T A P W R R Q A G R R Q D W R I T F2
P R R D G E G G A P G A R R G A P R R G A G K P E D G K T G E * R F3
1 GTCCGCGCCGTGACGGCGAAGGCGGCGCTCCGGGTGCTCGTCGTGGCGCACCGCGCCGTGGCGCCGGCAAGCCGGAAGACGGCAAGACTGGAGAATAACG 100
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
A A T E T Q E V S Q R A E G S * H R Q G D A R Q R G V V R * I R P F1
M L Q P K R R K Y R K E Q K G R N T G K A T R G N A V S F G E F G L F2
C C N R N A G S I A K S R R V V T P A R R R A A T R C R S V N S A F3
101 ATGCTGCAACCGAAACGCAGGAAGTATCGCAAAGAGCAGAAGGGTCGTAACACCGGCAAGGCGACGCGCGGCAACGCGGTGTCGTTCGGTGAATTCGGCC 200
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
E G D R S R P F D R A S N R S G A S C H D A S H Q A W R P H L D S F1
K A I G R G R L T A R Q I E A A R R A M T R H I K R G G R I W I R F2
* R R S V A A V * P R V K S K R R V V P * R V T S S V A A A S G F A F3
201 TGAAGGCGATCGGTCGCGGCCGTTTGACCGCGCGTCAAATCGAAGCGGCGCGTCGTGCCATGACGCGTCACATCAAGCGTGGCGGCCGCATCTGGATTCG 300
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
H F P G Q A D F A E A G R S T Y G * R * G * P G V L R R R D S A G Q F1
I F P D K P I S Q K P A E V R M G N G K G N P E Y Y V A E I Q P G F2
F S R T S R F R R S R P K Y V W V T V R V T R S T T S P R F S R A F3
301 CATTTTCCCGGACAAGCCGATTTCGCAGAAGCCGGCCGAAGTACGTATGGGTAACGGTAAGGGTAACCCGGAGTACTACGTCGCCGAGATTCAGCCGGGC 400
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
D A V R N G R R I R R T G A * G V P S G C S E A A D P D H V Y R S F1
K M L Y E M D G V S E E L A R E A F R L A A A K L P I Q T T F I V R F2
R C C T K W T A Y P K N W R V R R S V W L Q R S C R S R P R L S F F3
401 AAGATGCTGTACGAAATGGACGGCGTATCCGAAGAACTGGCGCGTGAGGCGTTCCGTCTGGCTGCAGCGAAGCTGCCGATCCAGACCACGTTTATCGTTC 500
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
P A R R L R R K H E G F R T S P E R P G R A Q Q R A G G P A E G A F1
Q L G A * G E N M K A S E L L Q K D Q A A L N K E L A D L L K A Q F2
A S S A P K E K T * R L P N F S R K T R P R S T K S W R T C * R R N F3
501 GCCAGCTCGGCGCCTAAGGAGAAAACATGAAGGCTTCCGAACTTCTCCAGAAAGACCAGGCCGCGCTCAACAAAGAGCTGGCGGACCTGCTGAAGGCGCA 600
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
I R P A H A F1
F G L R M X F2
S A C A C F3
601 ATTCGGCCTGCGCATGC 617
----:----|----:--