BACT000044 (rplO) allele sequence: id-368

Contig position

sequence bin id
3702
contig length
204182
start
9581
end
10015
length
435
orientation
forward
complete
yes
method
Illumina
Options

Sequence

GCGAGCTTCA GGACACGCCG GCGGTCCGCG GCATGATCAA CAAGGTCTCG TACCTCGTTA AGGTCATCGC GTAAGCGGCC CTACGGATCA AGGAGTTGAT ATGGAATTGA ATAACCTGAA GCCGGCCGCT GGCGCCAAGC ACGCCAAGCG TCGCGTCGGC CGCGGCATCG GTTCGGGCCT CGGCAAGACG GCTGGCCGTG GTCACAAGGG TCAGAAATCG CGTTCGGGCG GCTTCCACAA GGTCGGCTTC GAAGGCGGTC AGATGCCGCT GCAACGTCGT CTGCCGAAGC GCGGCTTCAC GTCGCTGACG AAGGAATTCG TCGGTGAAGT GCGCCTGGGC GATCTCGAGA AGCTGCCGGT CGATGAAATC GATCTGCTCG CACTGAAGCA AGCCGGCCTG GTCGGCGAGC TGACGAAGAG CGCGAAGATC ATCGCCACGG GCGAACTGAA GCGCAAGATC GTCGTGAAGG GTCTCGGCGC CACGAAGAGT GCGCGCGCTG CGATCGAAGC GGCTGGCGGT TCGTTCGCCG AGTGACACGC GTAGCGCGTC GTCACTTGCA TTCATCGGAG AAGGTACTTG GCTAACAGCC CGAGTCTTGC AAAACCCGGT CGAAGCACGG CGAAATTCGG CGATC

Translation


          A  S  F  R  T  R  R  R  S  A  A  *  S  T  R  S  R  T  S  L  R  S  S  R  K  R  P  Y  G  S  R  S  *  Y   F1
           R  A  S  G  H  A  G  G  P  R  H  D  Q  Q  G  L  V  P  R  *  G  H  R  V  S  G  P  T  D  Q  G  V  D     F2
            E  L  Q  D  T  P  A  V  R  G  M  I  N  K  V  S  Y  L  V  K  V  I  A  *  A  A  L  R  I  K  E  L  I    F3
        1 GCGAGCTTCAGGACACGCCGGCGGTCCGCGGCATGATCAACAAGGTCTCGTACCTCGTTAAGGTCATCGCGTAAGCGGCCCTACGGATCAAGGAGTTGAT 100
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            G  I  E  *  P  E  A  G  R  W  R  Q  A  R  Q  A  S  R  R  P  R  H  R  F  G  P  R  Q  D  G  W  P  W    F1
          M  E  L  N  N  L  K  P  A  A  G  A  K  H  A  K  R  R  V  G  R  G  I  G  S  G  L  G  K  T  A  G  R  G   F2
           W  N  *  I  T  *  S  R  P  L  A  P  S  T  P  S  V  A  S  A  A  A  S  V  R  A  S  A  R  R  L  A  V     F3
      101 ATGGAATTGAATAACCTGAAGCCGGCCGCTGGCGCCAAGCACGCCAAGCGTCGCGTCGGCCGCGGCATCGGTTCGGGCCTCGGCAAGACGGCTGGCCGTG 200
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           S  Q  G  S  E  I  A  F  G  R  L  P  Q  G  R  L  R  R  R  S  D  A  A  A  T  S  S  A  E  A  R  L  H     F1
            H  K  G  Q  K  S  R  S  G  G  F  H  K  V  G  F  E  G  G  Q  M  P  L  Q  R  R  L  P  K  R  G  F  T    F2
          V  T  R  V  R  N  R  V  R  A  A  S  T  R  S  A  S  K  A  V  R  C  R  C  N  V  V  C  R  S  A  A  S  R   F3
      201 GTCACAAGGGTCAGAAATCGCGTTCGGGCGGCTTCCACAAGGTCGGCTTCGAAGGCGGTCAGATGCCGCTGCAACGTCGTCTGCCGAAGCGCGGCTTCAC 300
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          V  A  D  E  G  I  R  R  *  S  A  P  G  R  S  R  E  A  A  G  R  *  N  R  S  A  R  T  E  A  S  R  P  G   F1
           S  L  T  K  E  F  V  G  E  V  R  L  G  D  L  E  K  L  P  V  D  E  I  D  L  L  A  L  K  Q  A  G  L     F2
            R  *  R  R  N  S  S  V  K  C  A  W  A  I  S  R  S  C  R  S  M  K  S  I  C  S  H  *  S  K  P  A  W    F3
      301 GTCGCTGACGAAGGAATTCGTCGGTGAAGTGCGCCTGGGCGATCTCGAGAAGCTGCCGGTCGATGAAATCGATCTGCTCGCACTGAAGCAAGCCGGCCTG 400
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            R  R  A  D  E  E  R  E  D  H  R  H  G  R  T  E  A  Q  D  R  R  E  G  S  R  R  H  E  E  C  A  R  C    F1
          V  G  E  L  T  K  S  A  K  I  I  A  T  G  E  L  K  R  K  I  V  V  K  G  L  G  A  T  K  S  A  R  A  A   F2
           S  A  S  *  R  R  A  R  R  S  S  P  R  A  N  *  S  A  R  S  S  *  R  V  S  A  P  R  R  V  R  A  L     F3
      401 GTCGGCGAGCTGACGAAGAGCGCGAAGATCATCGCCACGGGCGAACTGAAGCGCAAGATCGTCGTGAAGGGTCTCGGCGCCACGAAGAGTGCGCGCGCTG 500
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           D  R  S  G  W  R  F  V  R  R  V  T  R  V  A  R  R  H  L  H  S  S  E  K  V  L  G  *  Q  P  E  S  C     F1
            I  E  A  A  G  G  S  F  A  E  *  H  A  *  R  V  V  T  C  I  H  R  R  R  Y  L  A  N  S  P  S  L  A    F2
          R  S  K  R  L  A  V  R  S  P  S  D  T  R  S  A  S  S  L  A  F  I  G  E  G  T  W  L  T  A  R  V  L  Q   F3
      501 CGATCGAAGCGGCTGGCGGTTCGTTCGCCGAGTGACACGCGTAGCGCGTCGTCACTTGCATTCATCGGAGAAGGTACTTGGCTAACAGCCCGAGTCTTGC 600
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          K  T  R  S  K  H  G  E  I  R  R  S                                                                     F1
           K  P  G  R  S  T  A  K  F  G  D  X                                                                    F2
            N  P  V  E  A  R  R  N  S  A  I                                                                      F3
      601 AAAACCCGGTCGAAGCACGGCGAAATTCGGCGATC 635
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